Casos prácticos PCR

Julián Sanz Ortega

Caso1

Varón 67 con antecedentes de Gammapatía monoclonal IgG (no mieloma múltiple).

Masa linfoganglionar en raíz de mesenterio con ganglios a ese nivel y en epiplón. Insuficiencia respiratoria tipo I Disfunción renal aguda. Síndrome poliúrico. Síndrome confusional de estancia en UCI Infección pulmonar por Pseudomona Aeruginosa (posterior estado de portador)

Diagnóstico: Enfermedad de Whipple

Tropheryma whipplei

2001 primer cultivo y caracterización

Enfermedad: Artralgia inicial, diarrea, corazón, SNC…

PAS carece de especificidad.

Target: secuencia 16S ARNr.

Biopsia: duodenal, ganglio, sinovial, saliva, sangre..

Caso2

Mujer 49 años, lesión oclusiva intestinal.

Diagnóstico: Adenocarcinoma de colon moderadamente diferenciado; T3N1M1 (metástasis hepáticas)

¿Familiar?

Diagnóstico: CCHNP (Cáncer de Colon hereditario No polipósico)

por mutación MLH1

Caso 2

Bat

25

Bat

26

346

(APC) Tejido

Normal.

Tejido

Tumoral.

CT32

Estabilidad de microsatélites

Riesgo de CRC

Población en general: 2-5%

Un familiar afectado: 6-10%

CCHNP: 70-80%

FAP: 100%

Cáncer de colon familiar

5-15% CRC es familiar.

Poliposis adenomatosa familiar (FAP) 0.5-1%, Cáncer de colon hereditario no polipósico (CCHNP) 5-13%.

Otros: Poliposis familiar juvenil, Sindrome de Turcot, Peutz-Jeghers..

Protocolo CCHNP en HCSC:

Anatomía Patológica: Extracción tumoral de ADN con

microdisección

Inmunohistoquímica MLH1, MSH2, MSH6. PMS2

PCR y estudio de inestabilidad de microsatélites

Oncología: Estudio de mutaciones.

Consejo genético

Caso 3: Dos bloques de parafina con el mismo número:

A B

Estudio de Filiación: Microsatélites:

Errores de filiación

Metástasis de laboratorio

Confirmación de identidad

Caso 4

Varón fumador de 64 años, nódulo único pulmonar

PAAF: diagnóstico carcinoma pulmonar no microcítico

¿Es sensible a inhibidores de EGFR?

www.ensembl.org (SNPs) K

ACTTCCTTATGATCACAAATGGGAGTTTCCCAGAAACAGGCTGAGT --

L--P--Y--D--H--K--W--E-=F=-P--R--N--R--L--S--F--G--K--T--

Mutaciones c-KIT (exón 9 y 11) y

EGFR (exón 18,19, 20, 21)

Concocer SNPs

Asociada respuesta a gefitinib Ca pulmón.

2 hot spot: DELECIONES EXON 19, 46%:

a) Análisis de fragmentos

b) Secuenciación directa

Exon 21 L858R, 43%: c) Secuenciación directa

d) Enzimas de restricción

Exon 19 del, 48%

Mutaciones EGFR:

a)

b)

Exon 21 L858R,43%

c)

d)

Virus BK

Trasplantes renales (1-5%)

Causa importante de rechazo (45-

67% de infectados).

Virus ubicuo: 90% seropreval.

Origen : infección respiratoria infantil, permanece latente en células uroteliales.

Inmunosupresión reactiva infección.

En: Biopsias renales. Orina?

Cómo: PCR, Real time-PCR, HIS (No tests aprobados por FDA)

Especificidad 100%,

sensibilidad 70% en gel,

85% en secuenciador.

Reordenamientos de IgH

(Fragmentos V-J):

Agradecimientos

Dr. Julián Sanz Esponera

Dr. Julián Sanz Ortega

Dr. Jose A López Asenjo

Dra. Elena Sierra

Susana Hernández

Mónica Fernández