Clase Búsqueda información en ciencias biomédicas

Búsqueda de la información

Cristian Rosas MéndezMetodología de la Investigación

Escuela de OdontologíaUniversidad Austral de Chile

Origen del problema de investigación

Pregunta de investigación

Análisis crítico de la información

• Estado del conocimiento actual sobre el tema

• Experiencia previa de otros investigadores

• Describir tipos de literatura disponible

• Diferenciar buscadores, bases de datos y revistas.

• Describir motores de búsqueda convencionales y sus limitaciones

• Describir paso a paso una correcta estrategia de búsqueda en PubMed

• Describir uso de herramientas adicionales de búsqueda

Objetivos

Tipos de literatura

Primaria

Secundaria

Estudios originales

Revisiones sistemáticas

Tesis no publicadas

Trabajos no publicados

Presentaciones en congresos

LITERATURA BLANCA LITERATURA GRIS LITERATURA NEGRA

Trabajos relacionados con

marcas comerciales

Fórmulas de productos

GoogleYahoo!Bing

Buscadores Bases de datos Revistas

PubMed

MEDLINEISI Web of Science

SCiELOCochrane Library

ScienceDirect

Evidence-based DentistryJournal Dental ResearchJournal Dental Education

Journal American Dental AssociationEuropean Journal Dental Education

British Dental JournalDental TraumatologyPeriodontology 2000

American Journal of DentistryAustralian Dental Journal

Caries ResearchDental Materials JournalJournal of Endodontics

Journal of PeriodontologyOral Diseases

Journal of Dental Sciences....

Fuentes de información

Buscadores generales

Búsqueda

Resultados

Ordenados por popularidad (PageRank)

=) =) =)

Orden de resultados es en base a número de enlaces.

NO A CALIDAD DE LA INFORMACIÓN

Cristian Rosas Méndez | Metodología de la Investigación | Universidad Austral de Chile | cristianrosas@gmail.com

Buscar: caries

Wikipedia1

Caries Wikipedia

Buscar: periodontitis

Wikipedia1

Periodontitis Wikipedia

• Útil para información general o básica

• En ningún caso útil para responder preguntas clínicas ni realizar toma de decisiones.

• Lugar donde los pacientes buscan información acerca de diagnósticos y tratamientos.

Buscadores generales

Buscadores y bases de datos biomédicos

Fases de la búsqueda

Elegir dónde buscar

Elaboración de estrategia de

búsqueda

Ejecución de búsqueda Resultados?

SI Análisis de la información

Fases de la búsqueda

Elegir dónde buscar

Elaboración de estrategia de

búsqueda

Ejecución de búsqueda Resultados?

SI Análisis de la información

Buscadores específicos

Información según base de datos

Guías clínicas Revisiones Sistemáticas

Tratamiento Diagnóstico Pronóstico Etiología

Cochrane Library - ++++ ++++ + + -

TripDatabase ++++ +++ ++ ++ ++ ++

Medline + +++ +++ +++ +++ +++

TripDatabase ++++ +++ ++ ++ ++ ++

Medline + +++ +++ +++ +++ +++

TripDatabase ++++ +++ ++ ++ ++ ++

Medline + +++ +++ +++ +++ +++

TripDatabase ++++ +++ ++ ++ ++ ++

Medline + +++ +++ +++ +++ +++

¿Cómo debe ser una búsqueda?Exhaustiva, pertinente y replicable

Los mejores resultados se obtienen con alto número de búsquedas

Islamaj D, et al. (2009). Understanding PubMed® user search behavior through log analysis. Database 2009(0):bap018+.

¿Exhaustiva o pertinente?

EXHAUSTIVA

PERTINENTE

¿Replicable?

http://www.pubmed.com

Permite el acceso gratuito a bases de datos bibliográficas compiladas por la National Library of Medicine (NLM):

MEDLINE, PreMEDLINE, Genbak y Complete Genoma.

Contiene sub-bases: AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals y PubMed Central.

(Gubernamental)

• Más de 20 millones de referencias a artículos biomédicos

• Enlace a texto completo de algunos artículos

• Más de 5000 revistas de ciencias de la salud

• Desde 1966 a la fecha

• 86% en idioma inglés

• 52% publicaciones en USA

PubMed / Medline

PubMed - Home

PubMed - HomeSelección base datos Búsqueda avanzada

Campo de búsqueda

My NCBI

Realizar TUTORIAL

Métodos de búsqueda

• Búsqueda simple

• Búsqueda avanzada• Términos MeSH• Operadores booleanos y uso de paréntesis• Tags y truncamiento• Límites• Historial de búsqueda

PubMed

• Buscar uno o más términos en campo de búsqueda

Búsqueda simple

Cáncer oralEjemplo

La búsqueda arrojó 78405 artículos que contienen los términos “cancer” y “oral”

• Gran cantidad de información (76033 artículos).

• Este método busca artículos que contienen exacta y literalmente el/los término/s “oral” y “cancer” en cualquiera de los campos del artículo.

• No encuentra otros posibles artículos sobre cáncer oral especificados con otros términos, por ejemplo mouth carcinoma.

Búsqueda simple

Consideraciones

Búsqueda simpleLimitando la búsqueda: uso de comillas

5505 artículos

• Búsqueda simple: Usar con precaución

PubMed

• Búsqueda simple: Usar con precaución

PubMed

Búsqueda avanzada

1. Definición de términos de búsqueda

Términos MeSH

Vocabulario de términos biomédicos que clasifican

temáticamente los artículos

Palabras clave

Términos específicos de búsqueda no indexados

en MeSH

Medical Subject Heading

Términos MeSH

cariesTérminos MeSH

Conceptos que engloba el término MeSH

Términos similares

Estructura arboriforme de términos

Términos MeSH

Búsqueda avanzada

Search Clear

Búsqueda avanzada

Search Clear"Dental Caries"[Mesh]

Cáncer oralEjemplo

Fibroma traumáticoEjemplo

irritation fibroma

Fibroma traumáticoEjemplo

irritation fibroma

No hay término MeSH para esta patología

Palabras clave

Términos específicos de búsqueda no indexados en MeSH.

Se deben utilizar sólo si para el concepto no existe un término MeSH.

Términos MeSH

Definición de términos de búsqueda

TÉRMINO EXISTE

TÉRMINO NO EXISTE

Palabras clave

Buscar en

¿Cómo conectamos estos términos?

2. Operadores booleanos

Deben escribirse con mayúsculas

AND OR NOT

• Busca artículos contengan ambos términos de búsqueda

• Operador booleano por defecto.

periodontitis pregnancy

Search Clear

Search Clearperiodontitis AND pregnancy

hyperthermia

• Busca artículos que contengan cualquiera de los dos términos

• Se usa para términos similares o sinónimos

Search Clear

fever hyperthermia

hyperthermia

Search Clearfever OR hyperthermia

fever hyperthermia

hyperthermia

Search Clearfever OR hyperthermia

fever hyperthermia

radicular

• Excluye los artículos que contengan el término

• Se utiliza para eliminar una porción de artículos de un tema determinado

Search Clear

caries

radicular

Search Clearcaries NOT radicular

caries

radicular

Search Clearcaries NOT radicular

caries

2. Múltiples operadores booleanos

canine incisor "anterior teeth"

impacted included retained displaced

Ejemplo: Dientes anteriores incluidos

OR OR )(

OR OR OR

OR OR )(

OR OR OR( )

OR OR )(

OR OR OR( )

ERROR COMÚN

Search Clear

es lo mismo que

Search Clear

debe escribirse

ERROR COMÚN

Search Clear

Search Clearincisor AND impacted OR included

es lo mismo que

Search Clear

debe escribirse

ERROR COMÚN

Search Clear(incisor AND impacted) OR included

es lo mismo que

Search Clear

debe escribirse

ERROR COMÚN

Search Clear(incisor AND impacted) OR included

es lo mismo que

Search Clearincisor AND (impacted OR included)

debe escribirse

Prevalencia del granuloma piogénico

debe escribirse

Ejercicio

Search Clear

(sinónimo de hemangioma lobulillar)

prevalence pyogenic granulomalobular capyllary hemangioma

debe escribirse

Ejercicio

Search Clear

prevalence pyogenic granulomalobular capyllary hemangioma OR

debe escribirse

Ejercicio

Search Clear

prevalence pyogenic granulomalobular capyllary hemangiomaAND

debe escribirse

Ejercicio

Search Clearprevalence

debe escribirse

Ejercicio

debe escribirse

Ejercicio

AND (lobular hemangioma

debe escribirse

Ejercicio

AND (lobular hemangioma OR

debe escribirse

Ejercicio

AND (lobular hemangioma OR pyogenic granuloma)

debe escribirse

Prevalencia granuloma piogénico en embarazadasEjercicio

prevalence lobular capyllary hemangioma pyogenic granuloma pregnancy

Search Clear

debe escribirse

Search Clear

debe escribirse

Search Clear

ORAND AND

debe escribirse

ORAND AND

debe escribirse

Search Clearprevalence AND

ORAND AND

debe escribirse

Search Clearprevalence AND (lobular hemangioma

ORAND AND

debe escribirse

Search Clearprevalence AND (lobular hemangioma OR

ORAND AND

debe escribirse

Search Clearprevalence AND (lobular hemangioma OR pyogenic granuloma)

ORAND AND

debe escribirse

Search Clearprevalence AND (lobular hemangioma OR pyogenic granuloma) AND

ORAND AND

debe escribirse

Search Clearprevalence AND (lobular hemangioma OR pyogenic granuloma) AND pregnancy

ORAND AND

debe escribirse

Search Clear

Técnica quirúrgica de Erupción cerrada versus erupción abierta para dientes anteriores incluidos.

Ejercicio

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

closed

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

closed closed-eruption

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

open open-eruption

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

open open-eruption apically positioned flap

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

canine

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

canine incisor

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

canine incisor anterior teeth

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

impacted

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

impacted included

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

impacted included retained

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

ORclosed closed-eruption

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

ORclosed closed-eruption

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

( )( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

( )( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

( )( )( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

OR OR OR

( )( )( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

OR OR OR

( )( )(( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

OR OR OR

ANDclosed closed-eruption

( )( )(( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

OR OR OR

( )( )(( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

OR OR OR

( )( )(( )

debe escribirse

Search Clear

Ejercicio

(closed OR “closed-eruption”) AND (open OR “open-eruption” OR “apically positioned flap”) AND (canine OR incisor OR "anterior teeth") AND (impacted OR included OR retained OR displaced)

OR OR OR

( )( )(( )

Search Clear(closed OR “closed-eruption”) AND (open OR “open-eruption” OR “apically positioned flap”) AND (canine OR incisor OR "anterior teeth") AND (impacted OR included OR retained OR displaced)

34 artículos

Problema:Búsqueda es en todo el artículo

¿Cómo indicamos a PubMed dónde buscar los términos?

Título Autor AbstractTodo el artículo

3. Calificadores de campo o TAGS

[TI] Busca el término en el título

[TIAB] Busca el término en título y abstract

[AU] Busca término en lista de autores

[TA] Busca término en lista de journals

[TW] Busca término en cualquier parte del manuscrito

Elementos que indican a PubMed dónde buscar el término utilizado.

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Busca el término “canines” sólo en el título de los artículos

Resultados usando tag Resultados sin tag

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Busca el término “canines” sólo en el título y abstract de los artículos

Resultados sin tagResultados usando tag

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Ejemplo

canines[TI]

impacted[TIAB]

Ejemplo

andreasen[AU]

dental traumatology[TA]

Ejemplo

andreasen[AU]

Busca “andreasen” sólo en los nombres de autores de los artículos

Ejemplo

andreasen[AU]

Ejemplo

andreasen[AU]

Ejemplo

andreasen[AU]

Busca “dental traumatology” en los nombres de los journals incluidos en PubMed

Ejemplo

andreasen[AU]

Ejemplo

andreasen[AU]

Uso de asterisco (*) al final de un término para que PubMed busque todos aquellos que contengan la misma raíz.

4. Truncamiento de palabras

neurol* neurology; neuroleptic; neurolekin; neurologic

impact* impact; impacted; impacting

Randomised

Randomized

Randomised

Randomized

random*

Search Clear(canine*[TIAB] OR incisor*[TIAB] OR "anterior teeth" NOT molars) AND (impacted[TI] OR included[TI] OR retained[TI] OR displaced[TI]) AND (close* OR “closed-eruption”[TI]) AND (open* OR “open-eruption”[TI] OR “apically positioned flap”)

5 artículos

Límites

Preferir uso de “Specify date range”

Límites

Precaución con límite “Humans”: puede excluir artículos que sean relevantes para los humanos (Sladek, 2010)

Límites

Seleccionar grupo etáreo de individuos que participen en los estudios

Links to free full text limita excesivamente los artículos.

Sladek, R.M. (2010). `Searchers be aware: limiting PubMed searches to 'humans' loses more than you think'. Internal Medicine Journal 40(1):88-89.

Usar con precaución, ya que limita sólo a artículos indexados con el tipo de estudio.

Limita según lenguaje.No usar español.

Limita búsqueda a un grupo determinado de artículos

Dental JournalsSelección de 420 revistas del “Index to Dental Literature

Límites

1 artículo

Revisión sistemática CochraneAlto nivel de evidencia

Search Clear

Términos + Operadores booleanos + Tags+ Trucamiento + Límites

RESUMEN

Search Clear

Términos + Operadores booleanos + Tags+ Trucamiento + Límites

RESUMEN

¿Cómo debe ser una búsqueda?

Exhaustiva, pertinente yREPLICABLE

Debemos presentar detalladamente nuestraestrategia de búsqueda.

Historia de búsqueda

Resultados de búsqueda

Forma de presentar los resultados

Formato para mostrar los resultados

Número de artículos a mostrar

en cada página

Forma de ordenar los artículos

Enviar resultados a:

Filtro de los resultados

Terminos de búsqueda similares

Títulos que incluyen términos

de búsqueda

Título del artículo

Título del artículoAutor(es) del artículo

Journal de publicación, año, volumen, número revista, páginas

Código PMID(PubMed Unique Identifier).

J Den Educ.

J Den Educ. 2005;

J Den Educ. 2005; 69

J Den Educ. 2005; 69 (11)

J Den Educ. 2005; 69 (11) x-x

Indica forma de acceso al artículo en texto completo

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Información actualizada de nuestros temas de interés automáticamente en nuestro lector RSS (Google Reader), accesible desde un computador o un

dispositivo móvil

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Términos MeSH Sin vocabulario controlado

Búsqueda avanzada y límites Sólo búsqueda simple

Sólo revistas Revistas y más (no está bien definido)

Acceso a literatura gris

PubMed Google Scholar

Cochrane Libraryhttp://www.thecochranelibrary.com

Cochrane LibraryCUANDO NO UTILIZAR

- Preguntas generales en salud

- Epidemiología

- Estudios que no sean clínicos

- Guías de práctica clínica

CUANDO UTILIZAR

- Preguntas sobre efectividad de tratamientos

Cochrane Libraryhttp://www.thecochranelibrary.com

Cochrane LibrarySearch: caries

Cochrane Library

Revisiones sistemáticas

Cochrane Library

Estudios clínicos

Cochrane Library

http://www.tripdatabase.com

TripDatabase

Filtra resultados en base a niveles de evidencia

TripDatabase

ISI Web - Web of ScienceBase de datos referencial

Acceso ExclusivoUACh WebProxy Biblioteca UACh

Búsqueda de artículos

Campo de búsqueda por términos. Uso de operadores booleanos AND, OR y NOT

Uso de límites

Búsqueda por autor

Búsqueda por revista

Búsqueda de artículos

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Cristian Rosas Méndezcristianrosas@gmail.com

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