Post on 08-Apr-2016
VIRUS
VIRUS: COMPONENTES• Algunos tienen DNA y otros RNA, pero nunca ambos ácidos nucleicos• En general tienen doble hélice de DNA( doble cadena), pero
pueden ser monocatenarios..• En muchos casos reciben el nombre de la enfermedad que causan
( ej. Virus Polio), o del tejido que afectan (ej.Adenovirus)• Contienen: Acido nucleico central, rodeado de una cubierta
proteica: cápside,cada proteina individual que forma la cápside se llama capsómero
• Formas: las más comunes son : Helicoidal: son largos cilindros, con una estructura central y rodeados de capsómeros.
Icosaedro: (20 caras triang. con 12 vértices.) Son en general virus pequeños de apariencia redondeada.
• Envoltura: son estructuras más complejas que rodean al complejo núcleo-cápside. No todos los virus poseen envoltura
VIRUS• Ser vivo con un elemento genético que contiene DNA o
RNA y que es capaz de alternar entre dos estados distintos:
Extracelular : infeccioso( virus completo para infectar otra célula)
Intracelular : fase replicativa ( donde reproducen los ácidos nucleicos y todos sus componentes para luego salir de la célula a infectar otra célula.)
• Varían de : tamaño, forma, composición, organismos atacados, tipos de daños celulares inducidos.
• Todos son sub- microscópicos ( no se ven con microscopio óptico), sólo pueden verse con microscopio electrónico
Virus : multiplicación• Deben introducirse en una célula viva para inducirla a fabricar
los componentes esenciales de una partícula vírica y debe hacerse de forma adecuada para poder escapar de la célula a infectar otra célula.
• Las fases pueden resumirse en 6 etapas:1. Fijación o adsorción: a la célula huesped
( Hepatocitos del hígado, por ej)2. Penetración en la célula3. Replicación del ácido nucleico en la cél.-huesped4. Producción de capsómeros y otros componentes5. Reunión de ácido nucleico – capside dando lugar
a nuevas partículas víricas6. Liberación de las partículas víricas para infectar
otas células
1-Reproduciéndose en el interior de la célula infectada, utilizando todo el material y la maquinaria de la
célula hospedante.
2- Uniéndose al material genético de la célula en la que se aloja, produciendo cambios genéticos en ella.
Por eso se pueden considerar los virus como agentes infecciosos productores de enfermedades o como agentes genéticos que alteran
el material el material hereditario de la célula huésped.
Los virus pueden actuar de dos formas distintas:
No poseen metabolismo ni organización celular, por lo que se les situa en el límite entre lo vivo y lo inerte.
Interacción Huesped - Virus
• En la naturaleza un virus ataca generalmente organismos relacionados( humanos, aves, plantas, determinados órganos, etc)
• En el Laboratorio pueden infectarse huéspedes que no se infectan naturalmente ( determinadas líneas celulares)
• Especificidad Huesped - Virus : está dada por la especificidad entre el lugar de adsorción del huesped y de fijación del virus
• Daños en el huesped: son variables, desde los virus latentes que por años están mudos de síntomas en el huesped, hasta los extremadamente virulentos como el de la Polio, que disgrega los polirribosomas del huesped produciendo inhibición de la síntesis proteica en éste.
Bacteriofago - Bacteria
Colección y transporte de muestras clínicas
• Tiempo de la toma dentro de la 1ª semana de síntomas
• Medios : solución salina o enriquecida con proteinas (suero o albúmina)
• Temperatura:conservar refrigeradas ( 4- 8 ºC )
• Rotular las muestras con nombre del paciente
• Hisopos: cualquiera sea su procedencia ( faringe, piel, recto,conjuntiva,genitales) deben enviarse dentro de medio de transporte especial.
• Sangre:entera, anticoagulada con EDTA, recogida en forma esteril.
• Suero:Dos sueros sin anticoagulante. El 1º en etapa sintomática y el 2º en convalescencia
VIRUS RESPIRATORIOS
Cuáles son?
Son un verdadero problema sanitario?
Tiene costo beneficio su diagnostico?
Es posible la prevención?
?
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Faringitis
Cuántas enfermedades pueden producir?
OtitisOtitis
AAdeno
Causa o contribuye a la muerte de 4 a 5 millones de niños por año en países en vías de desarrollo. En Argentina son causales de un 10% de las muertes en menores de 1 año. Un niño en un área urbana tiene 5 a 8 episodios de enfermedad respiratoria anuales en sus dos primeros años de vida. Son causa de infecciones nosocomiales: pacientes de riesgo (alta mortalidad VRS,ADV,PI3)
personal de salud ( ausentismo- infecciones nosoc.) La gravedad de alguno de ellos en el grupo de 0-4 años es semejante a la de > 65 años.
VIRUS RESPIRATORIOSEn cifras... avaladas por la literatura
A QUIENES PUEDEN AFECTAR??
NIÑOS ***
ANCIANOS***
JOVENES ADULTOS*
PUEDEN DEJARSECUELASGRAVES( ADV)
BQL lactante
Neumonitis
Neumonía
FAMILIA GENERO VIRUSOrthomyxoviridae
Influenzavirus
Influenza tipos A, B y C
Paramyxoviridae
Respirovirus Parainfluenza tipos 1, 2, 3 y 4A y B
PneumovirusMetapneovirus
VSR subgrupos A y BMetapneumovirus humano.
Adenoviridae Adenovirus Adenovirus serotipos 1 a 49 ( 3* y 7 *)
Picornaviridae Rhinovirus >99 tipos Resfrío común
Coronaviridae Coronavirus SARS ( Co-V)
Quiénes son....?
El virusLos viriones están envueltos y contienen ocho segmentos de ARNTienen espículas formadas por dos glicoproteínas: HA y NA.Para el IA se conocen 15 subtipos de HA y 9 de NA.Tienen gran variabilidad antigénica .La población más afectada
INFLUENZA A Y BVirus de la GRIPE
Mayores de 65 años LactantesCardiópatas Enfermedad pulmonar previaInmunosuprimidos Enfermedades debilitantes
Se propaga de persona a persona por gotas de secresiones respiratorias forma indirecta por objetos contaminados. Período de incubación: 1 a 7 días. Sobrevive en secresiones respiratorias secas y en superficies del medio ambiente por 1 o 2 días.Sintomas: cefalea, fiebre, coriza. BQL- NM- Neumonitis> 50 % internaciones y 80% de mortalidad en > 65 años
GRIPE
1918 20.000.000muertes
0102030405060708090
100
ENERO MAYO SEPTIEMBRE
19992000200120022003
GRIPE: INCIDENCIA ESTACIONAL
PREVENCION: Aislamiento respiratorio Vacuna
PROGRAMAS DE VIGILANCIA: GRIPE DE INFECCIONES RESPIRATORIAS AGUDAS VIRALES Anual: recogiendo y publicando la informaciones semanalmente
Centros centinelas
Laboratorios de red de vigilancia
Laboratorio de referencia
CENTROS DE CONTROL
VACUNA ANUAL
Inst.Malbrán
Lab de OMSCDC Atlanta
Htal Garrahan
Marzo-mayo
Médicos de todoel país
A/ Panamá/2007/99 (H3N2)A/New Caledonia/20/99 (H1N1)B/Sichuan/379/99Similares a la cepa B/Yamanashi/166/98Similares a la cepa B/Johannesburg/5/99
Análogo al A/Moscow/10/99 (H3N2) A/Panamá/2007/99 (H3N2)Análogo al A/New Caledonia/20/99 (H1N1)Análogo al B/Sichuan/379/99 B/Guandong/120/2000, B/Johannesburg/5/99 B/Victoria/504/2000
Efectividad aproximada de 80% de prevención Redujo en un 75% las muertes por influenza y las complicaciones en pacientes que requieren hospitalización.
ALTO COSTO BENEFICIO
Cepas circulantes en el año 2001
Vacuna 2002 recomendada por OMS para 2002 A/Nueva A/Nueva
Caledonia/20/99(H1N1)Caledonia/20/99(H1N1)A/Fujian/411/2002(H3N2)A/Fujian/411/2002(H3N2)B/Hong Kong/330/2001B/Hong Kong/330/2001
2004
Contiene una cadena de ARN Parainfluenza 3
Es el más frecuente en nuestro medio PRODUCE: neumonía , bronquiolitis ( < 1 año),
coup, laringits , otitis media aguda (niños 2 – 5 años) Brotes en primavera. Son comunes las reinfecciones. Se elimina de 4 a 7 días. Se transmite de persona a persona
PARAINFLUENZA 1 2 3El virus
Mortalidad: 2.8%
Htal Garrahan
0
5
10
15
20
25
ENERO MAYO SEPTIEMBRE
19992000200120022003
INCIDENCIA ESTACIONAL
Htal Garrahan
PREVENCION: Aislamiento de contacto
Es más pequeño que los Parainfluenza, es envuelto y tiene una cadena de ARN
Es el patógeno respiratorio más importante en niños de 0 – 3 años . Causante de bronquiolitis y neumonitis
3 a 5 % necesita hospitalización. En adultos produce enfermedad del tracto respiratorio superior leve Las reinfecciones son comunes.
VIRUS SINCISIAL RESPIRATORIO
Mortalidad: 2.4%
VSR
Htal Garrahan
INCIDENCIA ESTACIONAL
050
100150200250300350400450500
ENERO MAYO SEPTIEMBRE
19992000200120022003
Htal Garrahan
Factores de riesgo Enfermedad cardíaca y broncopulmonar Inmunosupresión ( Tx MO, leucémicos) Prematuros y lactantes < 3 meses
El período de contagio de 3 a 8 días La transmisión directa o indirecta por fomites perdura en ambiente y secreciones por más de 48hs. Tratamiento Sintomático. Ribavirina ( sólo a inmunocomprometidos). Gammaglobulina hiperinmune. Vacuna?
VSR
PREVENCION: aislamiento de contacto
EL VIRUS: contiene ADN doble cadena , no son envueltos.No lo afectan el pH del estómago, las sales biliares o las enzimas proteolíticas, replica bien en el tracto gastrointestinal.
La transmisión es esporádica y epidémica.Se transmite por agua y fomitesSe mantienen activos a temperatura ambiente durante 7 días.
Los principales serotipos respiratorios son : 1, 2, 3, 5 y 7.
ADENOVIRUS
INFECCIONES Respiratorias Gastrointestinales Miocarditis, pericarditis, encefalitis, meningitis Cistitis hemorrágica.INCUBACION: 2 a los 14 días TRANSMISION: puede ser directa o indirecta
ADENOVIRUS
MORTALIDAD: 22%
EL 90% de los recién nacidos por vía transplacentaria reciben anticuerpos protectores hasta los seis meses de vida. Luego la curva desciende hasta los dos años.Edad: > 6 meses
INFECCION RESPIRATORIA responsables del 80% de los pacientes pediátricos con secuelas respiratorias graves por neumonitis necrotizante
INCIDENCIA ESTACIONAL
0
5
10
15
20
25
30
35
ENERO MAYO SEPTIEMBRE
19992000200120022003
PREVENCIONAislamiento respiratorio
METAPNEUMOVIRUS HUMANO: caracteristicas
Familia Paramixoviridae Genoma ARN Pleomorfico Con envoltura lipídica Glicoproteínas de
superficie – F, G
25% niños entre 6-12 meses 25% niños entre 6-12 meses tienen Actienen Ac Virtualmente todos los niños > Virtualmente todos los niños > 5 años son sero +5 años son sero + “ “EEl virusl virus circula hace medio circula hace medio centenar” centenar” Mayor prevalencia en niños < Mayor prevalencia en niños < 1 año (11.6)1 año (11.6) Sin prevalencia en cuanto a Sin prevalencia en cuanto a sexo y razasexo y raza.. ARGENTINA: 11% en BQL (- ) para otros virus ( CEMIC)
INCIDENCIA ESTACIONAL Año 2003
0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
500
EN FEB MZO AB MAY J UN J UL AG SET OCT NOV DICIEMBRE
ADV VSR FLU A FLU B PARA 1 PARA 2 PARA 3
Muestras totales: 5320 Positivos: 24.72%
VSR: n= 910FLU A n=153
ADV n= 151
PARA 3 n = 97
Htal Garrahan
ADV VSR IA PI3
NM 43% 13% 21% 22%
BQL 42% 84% 49% 50%
Distres
86% 23% 78% 43
Presentación clínica
Htal Garrahan 2003
Dias de Htal
Requer. O2
Dias deO2
Requer. UCI
Dias UCI
ADV 30 89 27 31.2 22
VSR 12 93.8 11 13.2 1.4
IA 17 77 11 11 5
PI3 18 84.6 18 25 15
OTROS PARAMETROS EPIDEMIOLOGICOS
COSTO día / cama UCI: 790$ CIM: 490$
Htal Garrahan
Diagnóstico sindromático orienta a la causa solo a veces ¿Cuándo y para qué solicitar un examen virológico confirmatorio? Niño internado, con factores de riesgo. Confirmar Dx Fijar pronóstico Suspender terapéuticas innecesarias Cohortización de pacientes Evitar infecciones horizontales
Infecciones respiratorias virales diagnóstico etiológico
Resultados en el día
DIAGNOSTICO MICROBIOLOGICOEL LABORATORIO LA MUESTRA CLINICA
Exudado faringeo
Aspirado naso faríngeo
El resultado depende de la calidad de la muestra
Bioseguridad
Buena microscopíaCentrífuga
05
101520253035404550
1999200020012002
CUANDO PEDIRLO?PORCENTAJE DE POSITIVOS
Tiene costo beneficio el estudio entre los meses de mayo a setiembre
Metodologías de Metodologías de DiagnósticoDiagnóstico
Cultivo Convencional Cultivo rápidoELISA Inmunifluorescencia (antígenos virales)Biología molecular
Métodos de diagnóstico cuál elegir?
Cultivo convencional
Cultivo rápido
18- 20 díasS: 75% Costo: $ 40
24 – 48 hs S: 80% Costo : $ 30
ADV
Métodos de diagnóstico cuál elegir?
( -)
(+)
2 hsS: > 90%(Salvo ADV)$ : 13
ELISAVSR
FLU A1 hS: > 85 %$ : 30
FLUORESCENCIA
K.E.Irmen, Use of monoclonal antibodies for rapid diagnosis of respiratory viruses in a community hospital, 2000, Clinical and diagnostic laboratory inmunology , 7, 396-403
N=8670 S % E % VPP % VPN %TOTAL 84.2 87.7 70.7 94.0ADV 64.8 99.9VSR 90.6 93.3IA 84.3 95.1IB 82.6 99.0PI1 82.0 99.8PI2 41.3 99.9PI3 87.0 99.6
Valor de los estudios con AC monoclonales fluorescentes
Diagnóstico microbiológicoComparación Fluorescencia Directa / Cultivo viral
Cultivo: ADVEscaso Costo/ beneficio para diagnósticoImportante para colección de cepas para trabajo en vacunas
VSR - FLU A - FLU B -PARA FLU 1 2 3 El cultivo No tiene costo beneficio CDC Atlanta
Amplificación Molecular (PCR)
Gold standard 24- 48 hs > 50$
Métodos de diagnóstico cuál elegir?
El paciente sólo ADV de alta sospecha si dan (-) los otros métodosMetapnemovirus
Estudios de brotesTipificación de cepas
Screening de 7 virus
Algorritmo de trabajo diario11
12
(-) (+)
Identificación
Identificación13 - 14
Recepción de muestras
11.30
INFORME 2- 3 hs
Hora
FLUORESCENCIA CONANTICUERPOS MONOCLONALES
Mas de 1 virus ( VSR +ADV =0.4%)Htal Garrahan
Serv. Epidemiología Htal Garrahan
Aislamiento respiratorio
FLUADV
Aislamiento VSRde contacto PARA 3
Para el paciente Para la Intitución de Salud
Confirmar diagnósticoFijar pronósticoSuspender terapéuticas innecesarias
Cohortización de pacientesEvitar infecciones horizontalesAhorro en TTO ATB y en casos secundarios
OBJETIVOS DEL DIAGNOSTICO MICROBIOLOGICO