Post on 12-Jan-2015
Localización de informacióncientífica en Internet
XI Simposio Internacional de laAsociación de Cardiología de Rosario
Rosario, 8 y 9 de noviembre de 2002
Prof. Dr. Armando PacherBioingeniería - Universidad Nacional de Entre Ríos
CETIFAC – Centro de Teleinformática de FACFECC - Foro de Educación Continua en Cardiología
•Localización de la información científica
•Estrategias y tácticas de búsqueda: (AND OR NOT, etc.)
•Búsqueda de imágenes en la Web
•Utilización de PubMed – Medline y sus herramientas
Se asume que los asistentes saben cómo conectarse a Internet y utilizar un Browser o Navegador
Consultas: cursofac@fac.org.arObtención de este material: www.fac.org.ar/fec/cursofac/ros02
Localización de la información
Tipos de información
Documentos, imágenes, trabajos científicos indexados o no en Medline
¿Dónde se encuentra la información?
En sitios de instituciones académicas y científicas y bibliotecas
Se localiza información: accediendo a sitios institucionales y biliotecas con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline *
A una “distancia de tres clicks”
Organizaciones internacionales “a tres clicks”
Etica y calidad en la información científica
Universidades
Sitios institucionales
Sitios institucionales
Sitios institucionales
Acceso y búsqueda de información en la Web
Se localiza información: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline participando en mailing lists *
Buscadores o Searchers
Google Copernic Yahoo! Webcrawler Metacrawler Lycos Excite Infoseek HotBot otros (Magellan, EuroSeek, Altavista, Fast Search, Direct
Hit, YellowPages, Albert, etc., etc. etc.) Información no “filtrada” salvo la de instituciones
científicas y académicas.
Utilizar uno o a lo sumo dos y aprender a fondo sus funcionamientos
(cada uno tiene sus propias reglas)
?210.000 citas
Limitar las búsquedas en la Web
Utilización de operadores lógicos
AND
OR
NOT
Recordar la Teoría de ConjuntosConjunto A y Conjunto B
Intersección - Unión - Diferencia
Operador AND (= Y)
A Y Barrhythmia AND ventricular
trabajos que incluyan arritmia y ventricular
Limitar las búsquedas en la Web
Intersección
Operador OR (= O)
A OR Barrhythmia OR ventricular
trabajos que incluyan o arritmia o ventricular
Limitar las búsquedas en la Web
Unión
Operador NOT ( = NO)
A NOT Barrhythmia NOT ventricular
trabajos que incluyan arritmia pero no ventricular
Limitar las búsquedas en la Web
Diferencia
Operadores AND OR NOT
arrhythmia AND ventricular:
encuentra trabajos de arritmia ventricular
arrhythmia OR ventricular:
encuentra tanto trabajos de arritmia como trabajos que tengan la palabra ventricular
arrhythmia NOT ventricular:
encuentra trabajos de arritmia no ventricular *
Operadores AND OR NOT
arrhythmia AND ventricular NOT ischemia:
encuentra trabajos de arritmia ventricular sin isquemia
arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT ischemia:
encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular sin isquemia
arrhythmia AND ventricular NOT sustained AND treatment NOT ischemia :
encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular no sostenida sin isquemia *
167 citas
Limitar las búsquedas en la Web
Equivalencias:
AND = +
OR = ^
NOT = -
Inclusión de frases:
"radiation induced apoptosis”
"human lymphocytes”
Estudiar los comandos de cada Searcher:
? * “” , <frase> () <NEAR> <NEAR/N> etc., etc.
64 citas
Acceso a traducción on line (limitada en su calidad)
Copiado (download) de la información
Mediante el browser, desde el sitio donde se localizó el o los archivos: definir bien la ubicación, para su localizacion posterior
Disminución del tiempo de copiado mediante programas específicos:
www.gozilla.com - www.getright.com - www.speedbit.com
Acceso y búsqueda de información en la Web
Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers
Se localiza información: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline participando en mailing lists *
Medline
Base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine - NLM
abarca los campos de medicina, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas o básicas.
contiene citas bibliográficas y resúmenes de aproximadamente 4300 publicaciones biomédicas sumando más de 10 millones de citas desde 1966.
se actualiza mensualmente
es gratuita
PubMed ofrece acceso a dos bases de datos: MEDLINE y PREMEDLINE (datos aún no indexados en MEDLINE)
PubMed se actualiza semanalmente. *
PubMed (Medline)
Búsquedas simples con o sin operadores AND OR NOT
Utilización de “Limits” acotación de los resultados
Journal Browser para hojear revistas
Citation Matcher ubica trabajos conocidos
MeSH Browser búsquedas avanzadas
Clinical Queries mediante categorías (therapy, diagnosis, etiology,
prognosis) y elección de sensibilidad y especificidad.
Cubby almacenamiento y actualización de búsquedas *
arrhythmia
Búsqueda simple: arrhythmia
Arrhythmia: 101.249 citas
Utilización de operadores
AND OR NOT
Arrhythmia AND ventricular: 36.674 citas
Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained: 15.608
Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained AND 2001: 1074
Utilización de “Limits”
campo de búsqueda (título, autor, etc.) grupo etario sexo humano o animal idioma disponibilidad de abstracts fechas de publicación o de indexación tipo de publicación (ensayo clínico [clinical trial],
editorial, etc.) Nota: la mayoría descartan PREMEDLINE
Agregando “Limits”
Resultado con “Limits”: 31 citas
Id. anterior, trabajos sólo de 2001: 7 citas
Journal Browser
Herramienta para hojear publicaciones
Se ingresa el nombre de la publicación, o la abreviatura correspondiente de MEDLINE o el identificador ISSN.
Mediante “Limits” se elige el ejemplar buscado
Ingreso del nombre de la publicación
Codificación de la publicación
Acceso a la totalidad de lo publicado: 17.965 citas
Utilización de Limits: fecha de publicación
Utilización de Limits: fecha de publicación: 55 citas
Citation Matcher
Herramienta para buscar artículos cuando se dispone la cita
Se ingresan los datos conocidos en los diferentes campos
Cuando se conoce la cita bibliográfica
Cuando se conoce la cita bibliográfica
Obtención directa cuando se conoce la cita bibliográfica
Abstract del artículo
MeSH Browser - Encabezados de Temas Médicos
Herramienta de mayor complejidad pero sensible y específica
Cada cita en la sección de MEDLINE en la base de datos de PubMed es indexada con los Medical Subject Headings (o MeSH) que describen el tema contenido en el artículo.
El MeSH Browser permite la búsqueda de citas por términos MeSH.
Los términos MeSH se dividen en encabezados y subencabezados *
MeSH Browser
Buscar el término MeSH
Elegir el encabezado o término MeSH adecuado
Verificar el árbol y agregarlo (“Add”) a la búsqueda
Buscar subencabezados o subtérminos MeSH
Incluir subtérminos MeSH, de a uno por vez
Realizar la búsqueda en PubMed
Incluir límites si son necesarios
Verificar el esquema MeSH utilizado (Details)
Opción de guardar la búsqueda MeSH
Guardado de la búsqueda como “Favoritos” o “Bookmarks”
Ej.: Inmunología en la Enfermedad de Chagas congénita
Optar por "MeSH Browser"
Escribir en "Search for:" el término a buscar (Chagas) y hacer clic en "Go"
Elegir en el listado el término MeSH más adecuado (Chagas Disease) y hacer clic en "Browse this term"
Aparece un árbol de categorías MeSH relacionadas con el término a buscar.
Hacer clic en "Add this term to the Search using operator: AND"
Aparece en la nueva ventana "Chagas Disease"[MESH]
Hacer clic en "Detailed display" y agregar, de a uno por vez, los términos/subtítulos MeSH necesarios para acotar la búsqueda
Hacer clic en "PubMed Search"
Si es necesario, incluir "Limits”y/o “Add Terms”
Búsqueda compleja
Búsqueda compleja
Traducción de una búsqueda compleja
((((((Hypertension/drug therapy[MESH] AND Clinical Trial[ptyp]) AND English[Lang]) AND "adult"[MeSH Terms]) AND "human"[MeSH Terms]) AND ("2001/02/16 01.46"[EDat] : "2001/03/18 01.46"[EDat])) AND ("2001/02/16"[EDat] : "2001/03/17"[EDat]))
Esta sería la traducción aproximada:
"Buscar trabajos de marzo de 2001, sólo escritos en idioma inglés, que sean ensayos clínicos en humanos, mayores de 19 años, sobre el tema Terapia con drogas de la hipertensión arterial” *
Clinical Queries Filtros de categorías, sensibilidad y especificidad
Cubby Almacenamiento y actualización de búsquedas
Filtros de categorías, de sensibilidad y de especificidad
Almacenamiento y actualización de búsquedas
PubMed (Medline)
Técnicas: Búsquedas simples Utilización de “Limits” Journal Browser Citation Matcher MeSH Browser Clinical Queries Cubby
El material de texto completo (full text) puede ser obtenido en forma gratuita o bajo un arancel.
Esto es sólo la técnica para la búsqueda de información en Pubmed: hay que profundizar en la estrategia.
Guardar direcciones Web
Favoritos - Bookmarks
Se pueden copiar en diskettes,
enviar por email, etc.
Acceso y búsqueda de información en la Web
Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers
Se localiza información: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline participando en mailing lists *
Listas de Correo o Mailing lists
Grupos de interés común, cuyos integrantes intercambian información mediante E-mail
La correspondencia es recibida por todos los integrantes
Moderadas: un coordinador filtra los mensajes
• Temas de Informática Médica: cursofac@fac.org.ar
• La charla de esta mañana puede continuar en forma virtual
y permanente.
Suscripción a la mailing lists CursoFAC
Acceder a ayuda (Help) en temas informáticos (virus, etc.)
Obtener orientación para una búsqueda
Y obtener orientación desde otras mailing lists del Foro
Conceptos básicos finales (“para no marearse”)Dr. Alberto Vázquez, XX Congreso Nacional de Cardiología, Córdoba, 2001
Planificar una estrategia No sentarse a la PC sin un plan; escribir antes la búsqueda, que no deberá ser ni muy amplia ni muy acotada; abrir un solo frente por vez y agotarlo; si se encuentra un buen trabajo, detenerse y leerlo ...
al otro día se hará una mejor búsqueda; escribir todo en inglés (ayudarse con un buen diccionario).
No es difícil, pero hay que sumar “horas de silla”. *
Direcciones de Internet citadas en la exposición
http://www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/fig910.htm http://www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/atennecr.htm http://www.annals.org/issues/v134n12/toc.html http://www.fac.org.ar http://www.fac.org.ar/cvirtual/cvirteng/cienteng/mneng/mnm3004i/dicarli/dicarli.htm http://www.acc.org http://www.asecho.org http://www.americanheart.org http://www.worldheart.org http://www.who.int http://www.who.int/regions/amro http://www.paho.org http://www.cochrane.org http://www.hon.ch http://www.hon.ch/MedHunt http://www.bireme.br/bvs/E/home.html http://www.uba.ar http://www.un.edu.ar http://www.copernic.com http://www.sghms.ac.uk/depts/immunology/~dash/apoptosis http://www.google.com http://www.yahoo.com http://world.altavista.com http://www.gozilla.com http://www.getright.com http://www.speedbit.com http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi cursofac@fac.org.ar http://www.fac.org.ar/fec/cursofac http://www.fac.org.ar/search/mensaje.php3?cursofac+736 http://www.fac.org.ar/search/mensaje.php3?chagas-pcvc+679
Obtención de las diapositivas:www.fac.org.ar/fec/cursofac/ros02
Consultas:cursofac@fac.org.ar