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Uso de programaslibres en ciencia
JornadasIPErinas 2014
Miguel Sevilla-Callejo<msevilla@ipe.csic.es> Paleo-IPE research group
Instituto Pirenaico de Ecología – CSIC | 11 Diciembre 2014
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mi trabajo en el IPE
● proyectos DINAMO y DINAMO2– secuencias lacustres interior peninsular
● asistencia técnica Paleo-IPE– gestión BD– repositorio de archivos centralizado
● análisis espacial ygeneración cartográfica devariables ambientales
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Paleo-IPE sites
~50 registros
32 lagos
VillarquemadoConquezuela
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Paleo-IPE DB
modelo lógicode la base dedatos del equipo(lagos)
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desde enero 2010
● problemas y dificultades... – equipo potente y SO mediocre– dependencia de las licencias
● uso ya programas libres y de código abierto– Firefox, QGIS, Zotero, Inkscape, LibreOffice, GIMP...
● instalo GNU/Linux (Ubuntu 10.10)● pocos problemas al migrar... soy feliz :-)
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software libre
● Free & Open Source Software (FOSS)● fredoom to use, share, study & modify
– libertad para uso– libertad para compartirlo– libertad para examinar su código (cómo funciona)*– libertad para mejorar su funcionamiento (su código)*
● * requiere ser de código abierto (Open Source)
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importancia de FOSS en ciencia
23 FEBRUARY 2012 | VOL 482 | NATURE | 485
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método científico y FOSS
● reproducir y refutar● las publicaciones científicas
– comunicar resultados– convencer a los lectores de que son correstos
● el uso de programas de código abierto garantizan la transparencia de los resultados frente a las “cajas negras” de programas cerrados (privativos)
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Quantum GIS
● FOSS desktop GIS● datos vectoriales y ráster● OGC (WMS, WFS, WCS...)● BD espaciales● generación de modelos● producción cartográfica
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QGIS – extensiones
● para todos los gustos
– GRASS
– DBManager
– procesamiento
– openlayers● en crecimiento
constante
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QGIS – Processing Toolbox
● algoritmos de procesamiento espacial– GRASS– SAGA– GDAL/OGR– R – otros
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QGIS – Processing modeler
● heredero del modelador de SEXTANTE● graphical modeler
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bases de datos espaciales
● ventajas comparativas a viejos sistemas: rapidez, estabilidad, multiusuario...
● di adios a los “chapefiles” de ESRI● principales sistemas libres
– SpatiaLite (SQLite)● sistema de cliente/servidos en un archivo
– PostGIS (PostgreSQL)● sistema tradicional de servidor y cliente
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ejemplos de cartografía
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datos en abierto
● servicios OGC:– WMS, WFS, WCS
● portales de descarga– IDEE, IDEAragon...– CNIG-IGN
● openstreetmap.org● petición de datos... ¡no te cortes!
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Zotero
● gestión bibliográfica avanzada
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Inkscape
● diseño vectorial
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R & RStudio
● no comments...
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otros programas libres
● programas de calidad listos para un entorno productivo– Navegación web: Firefox– Ofimática: LibreOffice– Edición imágenes: GIMP– Retoque fotográfico: Darktable– y muchos más
M. Sevilla-Callejo 2014 27imagen de cool-retro-term en thefreecountry.wordpress.com
GNU/Linux
tal vez pienses que es esto...
foto de theinfamousgdub en Flickr
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Linux Mint 17 – Numix theme
GNU/Linux
… pero en en realidad es esto:
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GNU/Linux
y está dentro de esto...
Raspberry Pi Model A
IBM Roadrunner
Google/LG Nexus 5
fotos de Wikipedia
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curva de aprendizaje
imagen de Bruno Oliveira en su Google+
SE GEEK
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pero todo esto no es fácil ...
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tú solo no... con amigos si!
● gente con entusiasmo yganas de aprender
● lista usuarios Linux IPE-CSIC● amplia documentación en red● soporte en comunidad● cursos gratuitos
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Gracias por la atención
Presentación realizada conLibreOffice Impress 4.3
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