Aplicaciones de bioquímica y biología molecular

Coordinadora: Dra. Sobeida Sánchez Nieto

https://aplicacionesbqybiolmol.wordpress.com/

Objetivo general

Revisar los enfoques científicos para resolver problemas específicos en las siguientes áreas:

a) Ciencias de la Salud,

b) Agricultura y Biotecnología,

c) Cuidado del Medio Ambiente y

d) Desarrollo Sustentable y

e) Química y Macromoléculas

Impulso a

adaptarse

Homeostasis

Consiste en el adecuado equilibrio de un organismo con respecto a la relación que tiene con su entorno natural.

Estado homeostático

Estrés ambiental

Estrés nutrimental

Condición fisiológica

Más de un sistema externo o interno puede afectar a un organismo

Factores que afectan la homeostasis

1) Virus, bacterias, otros microorganismos

2) Mutaciones causadas por drogas, exposición a luz UV, otros.

3) Cambios en las condiciones ambientales o de nutrición llevan a modificaciones epigenéticas

4) Efectos fisiológicos

Respuestas a los cambios

1) Conocer la condición inicial: genes, transcritos, proteínas o

metabolitos, procesos, vías... 2) Activación de la transcripción de genes 3) Cambios en los niveles o actividad de proteínas 4) Cambios en los niveles o actividad de metabolitos

• Determinar mecanismos, rutas metabólicas o procesos, genomas, genética del organismo:

Nuevos

o en diferentes organismos

1) Genotipificación

2) Modificación genética para establecer mecanismos: producción de mutantes, expresión en sistemas heterólogos

Conocer la condición normal

Metodologías :

• Evaluar la activación de la transcripción (RNA)

a) PCR punto final (corrimiento en gel de agarosa),

b) PCR tiempo real (cuantificar)

c) Microarreglos

d) Bioinformática

e) Northern,

• Determinar las alteraciones en los niveles o actividad de proteínas

a) Determinación de la actividad de las proteínas, cursos temporales de actividad, efecto de concentración de sustrato(s), inhibidor(s), alosterismo

b) Producción de anticuerpos policlonales, monoclonales, de la proteína entera o solo de epítopes específicos.

c) Identificación o determinación cualitativa de los niveles de proteína por: Western Blot, Far Western, Inmunostrip

d) Producción de proteína recombinante para su caracterización in vitro.

e) Identificación de proteínas MC-HPLC

Metodologías :

• Analizar los cambios en los niveles o actividad de metabolitos

a) Fraccionamiento secuencial (solventes diferente polaridad)

b) Identificación y/o cuantificación (HPLC, MC-HPLC).

c) Modificación química de compuestos

d) Anticuerpos

e) Transducción de señales: azúcares, especies reactivas de oxígeno, calcio

Metodologías :

Resolver problemas

En las siguientes áreas:

a) Ciencias de la Salud,

b) Agricultura y Biotecnología,

c) Cuidado del Medio Ambiente y Desarrollo Sustentable y

d) Química y Macromoléculas

Programa 2018-01 FECHAS TEMA, PROFESOR O ACTIVIDAD (área a revisar)

8, 10, 15 y 17 de

Agosto

Mejorando la productividad en plantas, caso interacción Trichoderma-maíz (b)

Dra. Sobeida Sánchez Nieto

Facultad de Química, UNAM

22, 23, 29 y 31 de

Agosto

Genómica, Proteómica y Biología de Sistemas (a)

Dra. Nora Andrea Gutiérrez Nájera

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Unidad de Proteómica Médica

5, 7 y 12 de

Septiembre

Nuevas funciones de una enzima conocida (moonlighting), papel de las hexocinasas de maíz en su

fisiología.

M. en C. Paulina Aguilera Alvarado

Facultad de Química, UNAM

14 Septiembre EXAMEN

19, 21 y 26 de

Septiembre

Mecanismos epigenéticos afectados por la exposición a dietas obesogénicas (a)

Dra. Lorena Aguilar Arnal

Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM

28 de Septiembre,

3 y 5 de Octubre

Mejoramiento de cepas de microorganismos para la producción de productos bioactivos de interés

farmacéutico. (d)

Dr. Fernando Guzmán Chávez

Molecular Microbiology Department University Groningen, the Netherlands

10, 12 y 17 Octubre Mantenimiento de la integridad genómica en plantas. (b)

Dr. José Antonio Pedroza García

Instituto de Ecología, UNAM

19 Octubre EXAMEN

24 y 26 Octubre Biotecnología de los residuos lignocelulósicos para la producción de etanol.

Dra. Irma Bernal Lugo

Facultad de Química, UNAM

31 de Octubre y 7 de

Noviembre

1) Estudio proteómico de canales iónicos que participan en el balance ácido-base.

2) Producción por técnicas de ADN recombinante de conopéptidos con actividad farmacológica.

Dra. Laura Escobar Pérez

Departamento de Fisiología, Facultad de Medicina, UNAM

9, 14 y 16

Noviembre

Cristalografía de rayos X en la resolución de la estructura tridimensional de proteínas así como su

función.

Dra. Lilian González Segura

Facultad de Química, UNAM

21 Noviembre EXAMEN

23 Noviembre ENTREGA DE CALIFICACIONES Y LLENADO DE ENCUESTA

FECHAS TEMA, PROFESOR O ACTIVIDAD (área a revisar)

24 y 26 Octubre Biotecnología de los residuos lignocelulósicos para la producción de etanol. (c)

Dra. Irma Bernal Lugo

Facultad de Química, UNAM

31 de Octubre y 7 de

Noviembre

1) Estudio proteómico de canales iónicos que participan en el balance ácido-base. (b)

2) Producción por técnicas de ADN recombinante de conopéptidos con actividad farmacológica. (d)

Dra. Laura Escobar Pérez

Departamento de Fisiología, Facultad de Medicina, UNAM

9, 14 y 16

Noviembre

Cristalografía de rayos X en la resolución de la estructura tridimensional de proteínas así como su

función. (d)

Dra. Lilian González Segura

Facultad de Química, UNAM

21 Noviembre EXAMEN

23 Noviembre ENTREGA DE CALIFICACIONES Y LLENADO DE ENCUESTA

Programa

Evaluación

• Para tener derecho a calificación y/o examen final deber contar con al menos el 70 % de asistencias.

• Se realizaran tres exámenes: Los días 14 Septiembre, 19 Octubre y 21 Noviembre.

• La evaluación tendrá como objetivo determinar el grado de conocimiento sobre los objetivos del estudio o tema de los investigadores, la descripción de los enfoques experimentales que utilizaron para contestar la(s) pregunta(s), los modelos experimentales usados, así como la(s) técnicas experimentales que los investigadores presentaron.

• Todos los exámenes tendrán el mismo peso en la calificación.

• No se repondrán exámenes en otras fechas.