En el suelo del crucero, justo debajo del cimborrio, se encuentra desde 1921 el sepulcro del Cid y Doña Jimena. Sus restos, procedentes del Monasterio de San Pedro de Cardeña, fueron inhumados bajo una simple losa de mármol con la correspondiente inscripción, en una solemne ceremonia en la que se leyó un epitafio redactado por Ramón Menéndez Pidal.

En 1460-1470, el obispo Acuña mandó a Juan de Colonia construir en el crucero un cimborrio que adorno con muchas columnas.Pero el 4 de marzo de 1539 la obra se derrumbo por el peso de sus columnas. Luego Juan de Vallejo reconstruyo el cimborrio. Su obra era de tipo renacentista. La obra concluyo en 1568.  

El actual coro de la Catedral de Burgos (Castilla y León, España), que ocupa los tres tramos de la nave mayor inmediatamente anteriores al crucero del templo, con su magnífica sillería formada por 103 asientos tallados en nogal, es el resultado de distintas fases constructivas. Así, el primer coro, de estilo gótico y hoy desaparecido, estaba situado en el presbiterio, en los flancos del viejo retablo mayor, siguiendo el modelo francés, donde el coro capitular se ubica siempre en la cabecera.