El concepto de “célula mínima”
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El concepto de “célula mínima” Alba Ferré García Modulo de genómica y proteómica Junio 2013
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El concepto de “célula mínima”. Alba Ferré García Modulo de genómica y proteómica Junio 2013. ¿Qué entendemos por célula mínima?. “Conjunto mínimo de genes que son necesarios y suficientes para que una célula funcione, en presencia ilimitada de nutrientes esenciales”. Objetivos. - PowerPoint PPT Presentation
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El concepto de “célula mínima”
Alba Ferré GarcíaModulo de genómica y proteómica
Junio 2013
“Conjunto mínimo de genes que son necesarios y suficientes para que una célula
funcione, en presencia ilimitada de nutrientes esenciales”
¿Qué entendemos por célula mínima?
Conocer mínima expresión.
Eliminar la carga génica.
Objetivos
“Células minimas naturales”
A. Haemophilus influenzae (1830 Kb)B. Mycoplasma pneumoniae (816 Kb)C. Mycoplsama genitalium (580 Kb)D. Nanoarchaeum equitans (500 Kb)E. Candidatus Carsonella ruddii (160
Kb)
A.
B.
C.
E.D.
Teórico - computacional
Experimental – laboratorio
Albert Libchaber
Craig Venter
CRG
Construyendo versión mínima
Teórico
Comparación de genomas
EjemplosH. influenzae y M. genitaliumH. influenziae 1740
256 genesconservados
M.genitalium 480
M. genitalium 480
156 genes conservados
Rickettsia prowazekii 834
Chlamydia trachomatis 894
Experimental
Albert Libchaber
Llenando recipientes vacios
+ toxin alpha-hemolysin
Saturación
Craig Venter
350 genes esenciales
Problema
1 2
2 31 2 3
1 3
NO
SISI
1
NO
CRG
Microorganismo diseñados para realizar tareas específicas:
◦Biocombustibles◦Medicamentos◦Eliminar tóxicos ◦Reducir la contaminación ◦Etc.
Futuras aplicaciones
How many genes can make a cell:The Minimal-Gene-Set Concept, Eugene V. Koonin, Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2000. 01:99–116.
Toward an artificial cell based on gene expression in vesicles, Vincent Noireaux, Roy Bar-Ziv, Jeremy Godefroy, Hanna Salman and Albert Libchaber. Phys. Biol. 2 (2005) P1–P8.
Global Transposon Mutagenesis and a Minimal Mycoplasma Genome, Clyde A. Hutchison III, Scott N. Peterson, Steven R. Gill, Robin T. Cline, Owen White, Claire M. Fraser, Hamilton O. Smith, J. Craig Venter. Science 1999. Vol. 286, 2165 – 2169.
Transcriptome Complexity in a Genome-Reduced Bacterium Marc Güell et al. Science 2009, Vol Vol 326, 1268 – 1271.
Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium Sebastian Kühner et al. Science 2009, Vol 326, 1235 – 1240.
Impact of Genome Reduction on Bacterial Metabolism and Its Regulation Eva Yus et al. Science 2009, Vol 326, 1263 - 1268
Bibliografía
