Enzimas
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Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
Catalizan reacciones de oxidorreducción, es decir, transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-‐) de un sustrato a otro, según la reacción general:
AH2 + B ↔ A + BH2
Ejemplos alcohol deshidrogenasa y acetaldehido desidrogenasa:
Ared + Box ↔ Aox + Bred
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Catalizan la transferencia de un grupo químico (disCnto del hidrógeno) de un sustrato a otro, según la reacción:
Clase 2: TRANSFERASAS
A-‐B + C ↔ A + C-‐B
Un ejemplo es la glucoquinasa:
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Clase 3: HIDROLASAS
Catalizan las reacciones de hidrólisis:
A-‐B + H2O ↔ AH + B-‐OH
Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reacción:
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Catalizan reacciones de ruptura o soldadura de sustratos
Clase 4: LIASAS
A-‐B ↔ A + B
Un ejemplo es la acetacetato descarboxilasa, que cataliza la reacción:
CO2 + ↔
ácido acetacéGco acetona
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Catalizan la interconversión de isómeros:
Clase 5: ISOMERASAS
Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa, que catalizan las reacciones representadas en la tabla inferior:
A ↔ B
fosfotriosa isomerasa fosfoglucosa isomerasa
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Clase 6: LIGASAS
Catalizan la unión de dos sustratos con hidrólisis simultánea de un nucleóCdo trifosfato (ATP, GTP, etc.):
A + B + XTP ↔ A-‐B + XDP+Pi
Un ejemplo es la piruvato carboxilasa, que cataliza la reacción:
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Estructura delcentro acGvo.
Los aminoácidos que forman el centro acCvo de un enzima pueden formar parte del clasificarse en dos grupos: • De unión : aminoácidos cuyas cadenas laterales R poseen grupos funcionales que pueden establecer interacciones débiles (puentes de hidrógeno, interacciones iónicas, etc.) con grupos funcionales complementarios de la molécula de sustrato. Su función consiste en fijar la molécula de sustrato al centro acCvo en la posición adecuada para que los aminoácidos catalíCcos puedan actuar. Al lugar del centro acCvo de la proteína donde se encuentra se denomina siGo de unión. • CatalíGcos: Son uno o más aminoácidos cuyas cadenas laterales R poseen unas peculiaridades químicas tales que los facultan para desarrollar una función catalíCca. Al lugar donde se encuentran estos aminoácidos se le denomina siGo catalíGco
Los aminoácidos de fijación y los catalíGcos forman el centro acGvo del enzima, que ocupa una pequeña parte de la molécula. El resto de los aminoácidos están implicados en el mantenimiento de la estructura de la molécula, y se denominan a.a estructurales. En algunos enzimas existen residuos que no intervienen directa ni indirectamente en la catálisis, la acCvidad el enzima no varia al eliminarse. Se denominan a.a no esenciales .
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• Es pequeño • Es tridimensional: los aminoácidos que forman el centro acCvo normal mente se encuentran en partes de la secuencia lineal muy alejadas, formando una bolsillo tridimensional donde se une el sustrato. • Forma hendidura o grietas: El sustrato en todos los enzimas conocidos se unen a una hendidura hidrofobica. El carácter apolar de la hendidura aumenta la unión con el sustrato y favorece la catálisis. Además crea un microambiente en el cual los residuos polares adquieren caracterísCcas especiales para la unión del sustrato y la catálisis. • Produce interacciones iniciales no covalentes: El complejo E-‐S se estabiliza por mulCtud de fuerzas de carácter debil. Para que estos enlaces se formen las distancias interatomicas deben de ser pequeñas, de modo que el enzima y el sustrato deben de tener formas complementarias. • Tiene especificidad de sustrato: estéreo, regio y enanComéricamente selecCva. De modo que el centro acCvo debe tener una estructura especifica que sea complementaria estructuralmente a la molecula de sustrato.
Propiedades del centro acGvo
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Independientemente del modelo, las reacciones intervenidas por enzimas se disCnguen 5 etapas: 1. Reconocimiento del enzima por el sustrato 2. Formación del complejo enzima-‐sustrato (ES) 3. Transformación de ES en complejo de transición acCvado (ET*) 4. Formación del complejo enzima-‐producto 5. Disociación de enzima y producto Así, en lugar de una reacción de un paso, en que una molécula reaccionante se convierte directamente en producto con una gran necesidad de energía de acCvación, Cenen varios pasos intermedios de menor energía de acCvación.
Etapas energéGcas de una reacción enzimáGca
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Etapas energèGcas de una reacción enzimáGca
Mas que con el sustrato o sustratos, el centro acCvo posee máxima complementariedad con el estado de transición. Una vez formado el complejo enzima sustrato, mediante un mecanismo de distorsión, se acCvan los enlaces que hay que romper y se aproximan los grupos que hay que enlazar, favoreciendo la formación del producto resultante de la reacción catalizada y quedando la enzima libre para comenzar de nuevo el proceso catalíCco
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Ventajas de la formación del complejo E-‐S
1. Reduce el número global de componentes de la reacción
2. Favorece la formación de un complejo más reacCvo que los componentes por separado
3. Evita la necesidad de colisión estadísCca entre sustratos 4. Favorece la disposición adecuada de las moléculas para
interaccionar con los grupos reacCvos del centro acCvo 5. El enzima aporta los grupos necesarios para la formación del
producto
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Factores que contribuyen a la acGvidad catalíGca de las enzimas
Son varios los factores que parecen contribuir al gran incremento de velocidad producido por las enzimas:
Proximidad y orientación del sustrato. La enzima puede fijar la molécula de sustrato de
modo que el enlace suscepCble se halle próximo y bien orientado respecto al grupo catalíCco. Esa proximidad y orientación adecuadas del sustrato respecto al grupo catalíCco permiten que se alcance con facilidad el estado de transición y se incremente la velocidad de reacción.
Factor de tensión de la catálisis enzimáGca. La enzima puede inducir una tensión o una
distorsión en el enlace suscepCble de la molécula de sustrato, que determine que la ruptura del enlace sea más fácil.
Catálisis covalente. Algunas enzimas se combinan con el sustrato para formar un
intermediario covalente que reacciona con más facilidad para formar los productos. Este compuesto se forma y se destruye rápidamente.
Catálisis ácido-‐base. Al proporcionar grupos funcionales capaces de actuar como
dadores o aceptores de protones, la enzima puede efectuar una catálisis general ácida o básica.la catálisis ácido-‐base general el catalizador actúa como aceptor o dador de protones. La catálisis ácido-‐base general proporciona un medio para efectuar la catálisis a pH neutro, que de otro modo necesitarían concentraciones muy elevadas de iones OH-‐ o H+.
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