Evaluacion de reproductores_2008
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Evaluación de Reproductores para
Caracteres PoligénicosBr. Fernando Macedo
Área de Mejoramiento Genético Animal
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Peso Vellón Sucio
A: 5.23 Kg.
B: 5.60 Kg.
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P=G+E
• P=+G+E
• P= +A+NA+E
• P= +A+NA+Ep+Et
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P=G+E
• P=+G+E
• P= +A+NA+E
• P= +A+NA+Ep+Et
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Conceptos• Candidato a la selección
• Fuente de información
• Criterio de selección
• Objetivo de selección
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Evaluación
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Pasos de una evaluación de Reproductores
• Modelizar el carácter en la población.
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Producción de leche en bovinos
y=+A+NA+lac.+edad+rodeo+año+e
= Media de la poblaciónA= Valor de críaNA= Valor no aditivolac.= numero de lactación:1, 2, 3, 4 o másedad= 4 dientes, 6 d., bll.rodeo: 1, 2, 3…año:2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, etc.e= error
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Pasos de una evaluación de Reproductores
• Modelizar el carácter en la población.
• Determinar los parámetros genéticos del carácter en la población.
• Elegir la metodología para la evaluación.
• Presentación de los resultados de la valoración.
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¿Qué precisamos para una evaluación genética?
134 kg
154 kg
134,7 kg
124,5 kg131,3 kg133 kg
136,7 kg
131,3 kg
129,8 kg
138,6 kg
133,5 kg 142,2 kg
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Que precisamos para una evaluación genética?
•Registros Productivos
•Registros Genealógicos
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Fuentes de Información
Individuo
Antecesores
Descendientes
Colaterales Colaterales
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Fuentes de Información• Registro del Reproductor• Registro de la progenie del Reproductor• Registros de los antecesores del Reproductor• Registros de los hermanos y ½ hermanos del
Reproductor• Registros de otros colaterales del
Reproductor• Combinación de todos los tipos de registro
del Reproductor
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Metodologías:
• Índices de Selección o BLP (Best Linear Prediction)
• BLUP (Best Linear Unbiased Prediction)
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Índices de Selección oBLP.
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Efectos ambientales
• Cuantificables o sistemáticos (establecimiento-año, lactación, mes de parición, edad de la madre, etc.)
• Intangibles o no sistemáticos (efectos no genéticos propios de la observación; diferencia entre gemelos idénticos criados en iguales condiciones ambientales)
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Efectos ambientales
• Predecibles (mes de nacimiento, edad de la madre, número de lactación, etc.)
• No predecibles (Establecimiento-año)
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Efectos ambientales no predecibles
• Grupos Contemporáneos
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Efectos ambientales predecibles
• Estandarización de mediciones
• Factores de corrección o ajuste
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Factores de ajuste
• Equiparan diferentes niveles de efectos, logrando una neutralización de los efectos ambientales y una mejor aproximación al valor de cría.
• Aditivos• Multiplicativos
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Factores de ajusteNiveles 1ª
Lactación2ª
Lactación3ª o mas Lactacion
esMedias 4200 Kg. 4800 Kg. 5100 Kg.Factor de ajuste Aditivo
+900 Kg. +300 Kg. +0 Kg.
Factor de ajuste Multiplicativo
1.21 1.06 1
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Modelo de los índices de selección
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Ecuación de Predicción
0 ,y xY b b X ^
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0 ,y xb Y b X
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, ,y x y xY b XY b X
, ,y x y xY Y b X b X
, ( )y xY Y b X X
,y xy b x
^
^
^
^
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Modelo de los índices de selección
, ( )A PÂ b P
Si la variable “x” representa al Fenotipo y la variable “y”
representa al Valor de Cría entonces:
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Coeficiente de Regresión del BLP
, 2
( , )A P
P
Cov A Pb
……2
, 1 ( 1)A Pnh abn t
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2
, 1 ( 1)A Pnh abn t
,
2
( , ')
:
:
::
( )
A P
A A
b coeficiente de regresión del valor decría enel fenotipo
n cantidad registros considerados
h heredabilidad dela caracteristicaa r parentescoentreel individuo que
estamos estimandoel valor aditivo yel los indiv
o
2
( ):
( )
iduo s dequienes tomamos registrost correlaciónentre los registros dela fuentedeinformación
cuando son medidas repetidas deunmismoindividuot r repetibilidad
cuando setrata demedidas enotras fuentes deinformación t h r
1, 2A A
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Precisión de la estimación
, ,,A C A PA Ar o r b a
, , 1 ( 1)A C A A
nr o r a hn t
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Intervalo de Confianza2 2,(1 ) AA ÂÂ t r
% de Confianza
t
50 0.6760 0.8468 1.0070 1.0480 1.2890 1.6596 2.099 2.58
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Relación entre precisión e intervalo de confianza
Precisión
Inte
rval
o de
con
fianz
a
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Evaluación de reproductores a partir de un solo registro
individualo
Selección Fenotípica Individual
2 22
,
2
1 11 ( 1) 1 (1 1)
( )
A Pnh a hb hn r r
 h P
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Precisión
, ,
111 ( 1) 1 (1 1)A C A A
nr or a h hn t t
h
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h2 : 0.4Toro Peso corregido (P – m)
1 510 Kg.. - 40 Kg..
2 610 Kg.. 60 Kg..
3 520 Kg.. -30 Kg..
4 550 Kg.. 0 Kg..
5 560 Kg.. 10 Kg..
550 Kg..
![Page 35: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/35.jpg)
Toro  Precisión
1 - 16 Kg.. 0.63
2 24 Kg.. 0.63
3 - 12 Kg.. 0.63
4 0 Kg.. 0.63
5 4 Kg.. 0.63
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Evaluación de reproductores a partir de registros repetidos del
propio individuo 2 2
,
2
11 ( 1) 1 ( 1)
( )1 ( 1)
A Pnh a nhbn r n r
nh Pn r
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Precisión
, , 1 ( 1)A C A A
nr o r a hn r
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h2=0.4, r=0.5, n=2carnero 1°
vellón2°
vellónPromedi
o (P – m)
1 8100 g 7900 g 8000 g -70 g
2 7400 g 6800 g 7100 g -970 g
3 9100 g 8500 g 8800 g 760 g
4 8900 g 8300 g 8600 g 530 g
5 8000 g 7700 g 7850 g -220 g
8070 g
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Carnero  Precisión
1 -37.1 g 0.73
2 -514.1g 0.73
3 402.8g 0.73
4 280.9g 0.73
5 -116.6g 0.73
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Valoración del reproductor a partir de registros de la
progenie2
, 21, 2
2
2
1 ( 1)
0,5 ( )1 ( 1) 0,25
A PA A
nh abn h r
nh Pn h
![Page 41: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/41.jpg)
Presición
, 2,1, 21 ( 1)A C A A
A A
nr o r a hn h r
![Page 42: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/42.jpg)
h2 = 0.35, n = 3, = 4605 Kg.
Toro P hijas (Phijas – m)
14500 Kg.
655 Kg.6100 Kg.5180 Kg.
23700 Kg.
-655 Kg.3900 Kg.4250 Kg.
![Page 43: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/43.jpg)
Toro  Precisión
1 293 kg. 0.47
2 -293 Kg. 0.47
![Page 44: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/44.jpg)
Valoración de Reproductores combinando diversas fuentes
de información
1 1 2 2( ) ( ) ... ( )n n I b P b P b P
Índices Familiares BLP
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Precisión
,A Âr ab
![Page 46: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/46.jpg)
Para la confección de índices familiares debemos ponderar cada fuente de
información según su peso relativo.
![Page 47: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/47.jpg)
Peso relativo (PR) expresado en % de las distintas fuentes de información
para cálculo del índice. (h2 = 0.3)Nº de Registros Peso Relativo %
Ind. ½ her. P
½ her M
Hijos
Ind. ½ her. P ½ her M Hijos
Prec
0 10 2 0 0 76 24 0 0.380 200 2 0 0 87 13 0 0.520 400 4 0 0 80 20 0 0.551 10 2 0 71 22 07 0 0.611 200 2 0 54 40 06 0 0.671 10 2 10 30 09 03 58 0.771 200 2 10 27 20 03 50 0.791 10 2 200 03 01 0 96 0.971 200 2 200 03 01 0 95 0.97
![Page 48: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/48.jpg)
Apareamientos aleatorios en pruebas de progenie.
1 12 2
hijos padres madreshijosP A A A
1 12 2
hijos madrespadrehijosP A A A
1 solo padre
?
![Page 49: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/49.jpg)
Apareamiento con hembras al azar1 12 2
hijos madrespadrehijosP A A A
+-0
![Page 50: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/50.jpg)
Apareamiento con hembras al azar
1 1 02 2
hijos padrehijosP A A
![Page 51: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/51.jpg)
Propiedades del BLP1. Maximiza rA, (precisión de la predicción)2. Minimiza el promedio de los cuadrados
del error (Â-A)3. Maximiza la velocidad del avance
genético o de la respuesta a la selección4. Maximiza la probabilidad de seleccionar
a los reproductores por su verdadero valor de cría
![Page 52: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/52.jpg)
Limitantes del BLP• Grupos genéticamente similares
• Grupos Contemporáneos (minimiza los efectos ambientales)
• Apareamientos Aleatorios (minimiza el sesgo por valor de cría de las madres)
• Corrección de información (Factores de ajuste). Produce un sesgo cuando esta no es bien ajustada.
![Page 53: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/53.jpg)
Aplicación• En establecimientos
• Centrales de prueba de progenie
![Page 54: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/54.jpg)
Modelo BLUP (Best Linear Unbiased
Predictor)
![Page 55: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/55.jpg)
![Page 56: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/56.jpg)
Propiedades• Evolución de los índices de selección
• No es necesario realizar apareamientos al azar
• Compara animales en distintos años y rodeos
![Page 57: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/57.jpg)
Toro 1 Toro 2 Toro 3
![Page 58: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/58.jpg)
Toro 1 Toro 2 Toro 3
Toro R
![Page 59: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/59.jpg)
![Page 60: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/60.jpg)
Modelo del BLUP
:::
Y Xb Zu eXb efecto fijo ponderado por su coeficienteZu efecto aleatorio ponderado por su coeficientee error o desvio residual
![Page 61: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/61.jpg)
Modelo BLUPModelo Lineal Mixto
Y Xb Zu e
Efectos Ambientales Fijos o Sistemáticos
Efecto Aleatorio debido al Valor de Cría
![Page 62: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/62.jpg)
Propiedades• Evolución de los índices de selección
• No es necesario realizar apareamientos al azar
• Compara animales en distintos años y rodeos
• Usa toda la fuente de información disponible
![Page 63: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/63.jpg)
Tipos de BLUPDiferentes fuentes de
información• Modelo Padre
• Modelo Abuelo materno-Padre
• Modelo Animal
• Modelo con Efectos Maternos
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Tipos de BLUPDiferentes fuentes de
información• Modelo Padre
• Modelo Abuelo materno-Padre
• Modelo Animal
• Modelos con Efectos Maternos
• Modelos Multicarácter
![Page 66: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/66.jpg)
Ventajas del BLUP• Considera toda la información de parientes
• El valor de cría estimado para un animal toma en cuenta el valor de cría de la hembra con la que se aparea
• Los valores de cría se estiman tomando en cuenta los efectos fijos y viceversa
• Es un Modelo flexible
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Condiciones y limitaciones del BLUP
• Sensible al modelo
• Calidad o confiabilidad de los datos de los registros
• Tratamientos preferencial
• Imposibilidad de comparar datos entre diferentes evaluaciones
![Page 68: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/68.jpg)
Presentación de los resultados de
Evaluaciones Genéticas
![Page 69: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/69.jpg)
Presentación de los resultados
• Catálogos
• Libro de padres
• Resúmenes de padres y madres de establecimientos
• Gráficos estandarizados
• Etc…
![Page 70: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/70.jpg)
Expresión del valor de cría• Valor de cría:
– Â: Valor de cría estimado, Mérito genético estimado, Valor aditivo estimado
– EBV: Estimated breeding value– PBV: Predicted breeding value
• ½ del Valor de cría:– ETA: Estimated transmiting abilities– PTA: Predicted trasmiting abilities– DEP: Diferencia esperada en la progenie– EPD: Expected progeny differences
![Page 71: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/71.jpg)
Precisión de la estimación
• Precisión o Accuracy
• Repetibilidad, Repeteability o Reliabilities (Precisión2)
![Page 72: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/72.jpg)
Relación entre la precisión y la repetibilidad
0,8
0,5
0,2
0,64
0,25
0,040
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0,9
1
PrecisiónRepetibilidad
![Page 73: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/73.jpg)
Resumen•La evaluación genética de los reproductores para el o los caracteres poligénicos, es uno de los pasos fundamentales para lograr el éxito de un plan de mejora genética de las poblaciones.
![Page 74: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/74.jpg)
•Las restricciones que plantea la metodología de los Índices Familiares, hace que esta sea aplicable en muy pocas situaciones, por ejemplo cuando queremos evaluar a los reproductores de un establecimiento.
![Page 75: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/75.jpg)
•A través de las valoraciones genéticas logradas por la metodología BLUP, pueden ser evaluados y comparados reproductores pertenenecientes a distintos rodeos, distintos años y ambientes, lo cual hace que sea la metodología adecuada para valorar grandes poblaciones.
![Page 76: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/76.jpg)
• Los catálogos de reproductores resumen de forma ordenada diversa información del individuo evaluado.
• De la información presentada en catálogos de reproductores, la de mayor importancia desde el punto de vista de la Mejora Genética es el resumen de la Evaluación Genética.
• Cuanto mas precisa sea la estimación del Valor de Cría mas confiable será el ranking de reproductores.
• La información de reproductores presentada en catálogos diferentes no pueden ser comparadas
![Page 77: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/77.jpg)
Dos grandes metodologíasBLP o Índices de selección BLUP (Modelos Mixtos)
Grupos genéticamente similares
Grupos genéticamente disímiles
Comparación dentro de Grupos Contemporáneos
Comparación entre Grupos Contemporáneos
Factores de ajuste No necesita
Apareamientos aleatorios Permite apareamientos dirigidos
Se elabora para cada individuo por separado
Estima los valores de cría (para todos los individuos) y los efectos
ambientales simultáneamentePoco uso de la información
de parientesUtiliza toda la información
disponibleÚtil en pequeñas
poblaciones Buenos resultados en evaluaciones de grandes poblaciones (nacionales
de una raza en particular)Metodología basada en Machos de
Referencia
![Page 78: Evaluacion de reproductores_2008](https://reader035.fdocumento.com/reader035/viewer/2022070602/587a2cac1a28abbd388b6697/html5/thumbnails/78.jpg)
¡¡¡Cualquiera sea la metodología utilizada
para estimar valores de cría; los resultados de
diferentes grupos contemporáneos (BLP) y evaluaciones (BLUP) no
pueden ser comparados!!!