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SYLLABUS FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS LICENCIATURA EN INGENIERÍA AMBIENTAL PROFESOR: Rodolfo Álvarez Manzo ASIGNATURA: Bioquímica DÍA, HORA Y LUGAR: Teoría: lunes y miércoles de 17:15 a 18:45 Laboratorio: viernes de 15:45 a 18:45 CORREO ELECTRÓNICO: [email protected] PRESENTACIÓN DE LA ASIGNATURA Asignatura obligatoria de séptimo semestre de tres horas de teoría y tres de laboratorio. OBJETIVOS GENERALES Al término del curso, el alumno será capaz de: Explicar la estructura y función de las moléculas que conforman a los seres vivos, estableciendo la relación entre las reacciones bioquímicas de estas moléculas con el metabolismo, los intercambios energéticos y los mecanismos de regulación genética de los seres vivos. Explicar los procesos bioquímicos que se presentan en la biosfera y las transformaciones bioquímicas que actúan sobre los compuestos xenobióticos, para la remediación de la contaminación en agua y suelos. Medir parámetros bioquímicos e indicadores de contaminación, para operar o mejorar procesos biotecnológicos, así como para el control y la remediación de la contaminación en agua y suelos. ACTIVIDADES DE APRENDIZAJE

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SYLLABUS

FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICASLICENCIATURA EN INGENIERÍA AMBIENTAL

PROFESOR: Rodolfo Álvarez ManzoASIGNATURA: Bioquímica

DÍA, HORA Y LUGAR:Teoría: lunes y miércoles de 17:15 a 18:45

Laboratorio: viernes de 15:45 a 18:45CORREO ELECTRÓNICO: [email protected]

PRESENTACIÓN DE LA ASIGNATURA

Asignatura obligatoria de séptimo semestre de tres horas de teoría y tres de laboratorio.

OBJETIVOS GENERALES

Al término del curso, el alumno será capaz de:

Explicar la estructura y función de las moléculas que conforman a los seres vivos, estableciendo la relación entre las reacciones bioquímicas de estas moléculas con el metabolismo, los intercambios energéticos y los mecanismos de regulación genética de los seres vivos.

Explicar los procesos bioquímicos que se presentan en la biosfera y las transformaciones bioquímicas que actúan sobre los compuestos xenobióticos, para la remediación de la contaminación en agua y suelos.

Medir parámetros bioquímicos e indicadores de contaminación, para operar o mejorar procesos biotecnológicos, así como para el control y la remediación de la contaminación en agua y suelos.

ACTIVIDADES DE APRENDIZAJE

Las actividades de aprendizaje que se desarrollarán en el curso son: Análisis y discusión grupal sobre los contenidos de la asignatura; obtención de conclusiones

al respecto. Exposiciones individuales y/o grupales sobre temáticas revisadas en el curso, empleando

recursos didácticos pertinentes. Realización, individual y grupal, de ejercicios de identificación de macromoléculas,

descripción de las reacciones bioquímicas en las que intervienen y su efecto sobre los seres vivos y sobre compuestos xenobióticos que se desean eliminar del ambiente; retroalimentación sobre los mismos.

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EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

Calificación en el acta aprobatoria si la Calificación Final es10 mayor a 9.59 menor a 9.5 pero mayor a 8.58 menor a 8.5 pero mayor a 7.57 menor a 7.5 pero mayor a 6.5

6 menor a 6.5 pero mayor a 6

Calificación Final = 0.8 × Calif. Teoría + 0.2 × Calif. Laboratorio

Calificación de Teoría = promedio de los cuatro exámenes parciales (tres con calificación igual o mayor a 6), a realizar los días septiembre 10, octubre 1, octubre 29 y noviembre 24

Calificación de Laboratorio =0.1 x promedio de los diagramas de prelaboratorio0.2 x informes de postlaboratorio

0.7 x promedio de los exámenes de las prácticas.

Para acreditar el curso, la Calificación de Teoría y la Calificación de Laboratorio

deben ser ambas aprobatorias (iguales o mayores a 6).

REGLAMENTACIÓN

REGLAMENTO GENERAL SEULSA

TÍTULO SEXTO DE LOS ALUMNOS EN GENERALCapítulo IV. Derechos y o obligaciones de los alumnos.Artículo 74.- Serán obligaciones de los alumnos:

I.- Conocer y practicar los principios y fines de la Universidad estipulados en su Ideario;

II.- Conocer y cumplir la legislación universitaria;

III.- Observar buena conducta dentro y fuera de la Universidad;

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IV.- Vestirse, peinarse y arreglarse decorosamente;

V.- Asistir puntualmente a sus actividades académicas y de formación, así como a aquellas que le indiquen sus autoridades;

VI.- Cursar y acreditar el programa académico en los plazos determinados por las autoridades competentes;

VII.- Someterse a las evaluaciones determinadas por las autoridades competentes;

VIII.- Realizar los trámites académicos y administrativos, y cubrir sus cuotas escolares en los términos, plazos y calendario establecidos por la universidad;

IX.- Cuidar y darle buen uso a las instalaciones, mobiliario y equipo de la universidad;

X.- Abstenerse de utilizar teléfonos celulares o cualquier otro sistema de comunicación dentro de clases;

XI.- Abstenerse de utilizar equipos de cómputo o cualquier medio electrónico en clase sin que medie autorización del docente;

XII.- Portar su credencial actualizada, personal e intransferible y mostrarla o entregarla a las autoridades universitarias que lo soliciten;

XIII.- No fumar dentro de la Universidad.

XIV.-Las demás que establezcan los ordenamientos universitarios.

TÍTULO SÉPTIMO EVALUACIONES DE LOS ALUMNOS

Artículo 87.- Para tener derecho a evaluación integradora o final, el alumno deberá:

I.- En modalidades presenciales, cubrir como mínimo el 80% de asistencia del total de clases o actividades programadas;

Artículo 94.- Para tener derecho a presentar evaluaciones extraordinarias, los alumnos deberán:

I.- Estar al corriente en el pago de sus cuotas escolares;

II.- Haber asistido por lo menos al 60% de clases impartidas de la materia o unidad de aprendizaje, cuya evaluación extraordinaria sustentará;

Artículo 97.- La calificación obtenida en una evaluación extraordinaria no será objeto de promedio y la mínima para acreditar y aprobar cada materia es de 6.

Artículo 98.- Si el alumno no se presenta a la evaluación extraordinaria, el docente hará la anotación en la lista de evaluaciones de “NP” NO PRESENTADO.

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Nota: Completar la reglamentación en caso de existir criterios adicionales para cada curso.

SESIÓNY

FECHA

TEMASY

SUBTEMAS

ACTIVIDADES DE APRENDIZAJE

COORDINADAS POR EL DOCENTE EN EL AULA

ACTIVIDADES INDEPENDIENTES

REALIZADAS POR EL ESTUDIANTE FUERA DE

CLASE

1Ago 4

Presentación del curso No aplica No aplica

2Ago 6

I. INTRODUCCIÓN A LA BIOQUÍMICA.

La bioquímica y su relación con otras áreas del conocimiento.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

o Consulta de la página web del grupo: sinuhe2006.blogspot.mx

o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

3Ago 8

Sesión informativa del laboratorio

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

o Consulta de la página web del grupo: sinuhe2006.blogspot.mx

o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

4Ago 11

I. INTRODUCCIÓN A LA BIOQUÍMICA

Importancia de la bioquímica para entendimiento de las transformaciones que se presentan en los ecosistemas.

Transformaciones bioquímicas de importancia en la ingeniería ambiental.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

o Consulta de la página web del grupo: sinuhe2006.blogspot.mx

o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

5Ago 13

I. INTRODUCCIÓN A LA BIOQUÍMICA

Fisicoquímica de la molécula del agua.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel

o Consulta de la página web del grupo: sinuhe2006.blogspot.mx

o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

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o Word), con formato PDF

6Ago 15

Práctica 1

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

7Ago18

II. ESTRUCTURA DE LAS MACROMOLÉCULAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA.

Biomoléculas: composición química, estructura tridimensional e interacciones con otras moléculas en medios acuosos.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

8Ago 20

II. ESTRUCTURA DE LAS MACROMOLÉCULAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA.

Aminoácidos y péptidos: definición; clasificación; composición elemental; estructura; isomería; importancia biológica; propiedades fisicoquímicas.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

9Ago 22

Práctica 2 parte A

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

10Ago 25

II. ESTRUCTURA DE LAS MACROMOLÉCULAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA.

1. Proteínas: definición;

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicios

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clasificación; composición elemental; estructura; importancia biológica; propiedades físicoquímicas. Dinámica de las proteínas: relación estructura-función; ensamblado. Degradación. Desnaturalización.

Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

o Preparación de seminario

11Ago 27

Examen Parcial 1 No aplica No aplica

12Ago 29

Práctica 2 parte B

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

13Sep 1

II. ESTRUCTURA DE LAS MACROMOLÉCULAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA.

Enzimas: definición; velocidad; catálisis; especificidad y regulación. Terminología y nomenclatura. Sustratos, cofactores, coenzimas y grupos prostéticos; nomenclatura.

Catálisis enzimática: mecanismos generales de reacciones enzimáticas; formación del complejo enzima-sustrato. Concepto de sitio activo. Especificidad de acción y de sustrato. Factores que contribuyen a la eficacia de la catálisis. Efectos sobre la energía de activación en las reacciones

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

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catalizadas.

14Sep 5

Práctica 3

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

15Sep 8

II. ESTRUCTURA DE LAS MACROMOLÉCULAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA.

Carbohidratos: definición; clasificación; propiedades fisicoquímicas; importancia biológica.

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16Sep 10

II. ESTRUCTURA DE LAS MACROMOLÉCULAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA.

Lípidos: definición; clasificación; propiedades fisicoquímicas; importancia biológica.

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17Sep 12

Parcial 1 de laboratorio No aplica No aplica

18Sep 17

III. METABOLISMO.

Principios generales del metabolismo celular.

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19Sep 19 Práctica 4

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

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20Sep 22

III. METABOLISMO.

Procesos metabólicos: catabolismo y anabolismo.

Anabolismo: autotrófico; heterotrófico.

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21Sep 24

III. METABOLISMO.

Regulación del metabolismo.

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22Sep 26

Práctica 5

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

23Sep 29

Examen Parcial 2 No aplica No aplica

24Oct1

III. METABOLISMO.

Transformaciones de los nutrientes en el interior de las células.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

25Oct 3

Práctica 6Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

26Oct 6

IV. BIOENERGÉTICA.

Conceptos de termodinámica aplicados a reacciones bioquímicas.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de

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o Estudio en equipos.

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Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

27Oct 8

IV. BIOENERGÉTICA.

Reacciones redox y oxidaciones biológicas.

Respiración (flujo de electrones mitocondrial).

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

28Oct 10

Práctica 7

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

29Oct 13

IV. BIOENERGÉTICA.

Fosforilación oxidativa acoplada al flujo de electrones.

Intercambios de protones durante el transporte electrónico.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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30Oct 15

IV. BIOENERGÉTICA.

Energía del transporte electrónico.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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31Oct 17

Parcial 2 de laboratorio No aplica No aplica

32Oct 20

IV. BIOENERGÉTICA.

Bioluminiscencia y quimioluminiscencia.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

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33Oct 22

Examen Parcial 3

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

34Oct 24 Práctica 8

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

35Oct 27

V. COMPONENTES QUÍMICOS XENOBIÓTICOS.

Principales conceptos.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

36Oct 29

V. COMPONENTES QUÍMICOS XENOBIÓTICOS.

Clasificaciones de xenobióticos.

Contaminantes orgánicos: plaguicidas y compuestos industriales.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

37Oct 31

Práctica 9

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

38Nov 3

V. COMPONENTES QUÍMICOS XENOBIÓTICOS.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los

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o Estudio en equipos.

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Contaminantes inorgánicos: metales pesados y óxidos.

diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

39Nov 5

VI.BIOTRANSFORMACIONES Y MECANISMOS DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES EN ANIMALES Y PLANTAS.

Introducción a la toxicología. Xenobióticos: fase cinética; metabolismo (reacciones de fase I y II). Mecanismos de toxicidad de contaminantes. Compuestos biodegradables y persistentes (bioacumulación y biomagnificación).

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

40Nov 7

Práctica 10

Clase en la que se hace uso del pizarrón. Discusión previa y tips experimentales

o Preparación de un diagrama de prelaboratorio.

o Elaboración de un informe de postlaboratorio.

o Muestras de material biológico con el que van a trabajar.

41Nov 10

VI.BIOTRANSFORMACIONES Y MECANISMOS DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES EN ANIMALES Y PLANTAS.

Biotransformaciones. Reacciones: de fase I; de oxidación. Enzimas constituyentes del sistema citocromo P450. Inducción enzimática por xenobióticos. Reacciones de reducción e hidrólisis. Rutas para la biotransformación de los xenobióticos.

Contaminantes orgánicos.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

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Mecanismos: moleculares de actuación de plaguicidas y su toxicidad; de toxicidad de otros contaminantes orgánicos; de resistencia a drogas.

42Nov 12

VI.BIOTRANSFORMACIONES Y MECANISMOS DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES EN ANIMALES Y PLANTAS.

Contaminantes inorgánicos gaseosos: monóxido de carbono; óxidos de azufre, de nitrógeno y nitritos; ozono y smog fotoquímico; fluoruros.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

43Nov 14

Parcial 3 de laboratorio No aplica No aplica

44Nov 19

VI.BIOTRANSFORMACIONES Y MECANISMOS DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES EN ANIMALES Y PLANTAS.

Generación de radicales libres y efectos biológicos. Especies reactivas de oxígeno y su toxicidad. Eliminación de oxidantes y radicales libres: superóxido, dismutasa, catalasa, glutation peroxidasa, otras enzimas y antioxidantes. Sistemas enzimáticos de reparación.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel o Word), con formato PDF

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o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

45Nov 24

VI.BIOTRANSFORMACIONES Y MECANISMOS DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES EN ANIMALES Y PLANTAS.

Clase en la que se hace uso del pizarrón y de presentaciones desarrolladas en los diferentes programas de Office (Power Point, Excel

o Consulta de la página web del grupo: sinuhe2006.blogspot.mx

o Estudio en equipos.o Resolución de ejercicioso Preparación de seminario

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SYLLABUS

Contaminación por elementos y compuestos metálicos. Mecanismos generales de toxicidad de metales. Efectos moleculares de los metales pesados y otros metales. Mecanismos biológicos de defensa, adaptaciones metabólicas, acumulación, metalotioneínas y fitoquelatinas.

Acciones de contaminantes sobre el DNA. Tipos de mutaciones. Mutagénesis: por radiaciones ionizantes y radiación UV; por agentes químicos. Mecanismos de reparación del DNA.

o Word), con formato PDF

46Nov 26

Examen Parcial 4 No aplica o No aplica

FUENTES DE CONSULTA PARA EL APRENDIZAJE

Básicas

Murray, R. K. et al. (2010). Harper Bioquímica Ilustrada. México: McRAW-Hill Interamericana.

Complementarias

Devlin, Thomas M. (Coord.) (2004). Bioquímica: libro de texto con aplicaciones clínicas. Barcelona; México: Reverté.

Laguna, José et al.. Bioquímica de Laguna. 7ª. (2013). TEA Ediciones. Stryer, Lubert et al. (2008). Bioquímica. México: Reverté. Voet, Donald et al. (2008). Fundamentals of biochemistry: life at the molecular level.

Hoboken, New Jersey: Jonh Wiley & Sons.

Software de apoyo

Sitio del grupo en internet: sinuhe2006.blogspot.mx

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SYLLABUS

SEMBLANZA DEL PROFESOR

SEMBLANZA DEL PROFESOR

Asignaturas impartidas: Química Orgánica, Química Inorgánica, Química Orgánica Heterocíclica, Física, Química Analítica, Análisis Instrumental, Farmacognosia, Cálculo Diferencial, Ingeniería Ambiental y Procesos industriales.

Licenciatura, Maestría y Doctorado en Ciencias Químicas, FQ-UNAM

Estancia posdoctoral en la Coordinación de Ingeniería Molecular – Instituto Mexicano del Petróleo

Revisor técnico de McGraw-Hill Interamericana, entre otros títulos, de Química (Raymond Chang) y Química Orgánica (de Francis A. Carey).

Docente de la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad la Salle (desde 2011), de la Escuela de Ciencias de la Salud de la Universidad del Valle de México Campus Sur (desde 2013), de la Facultad de Química de la Universidad Nacional Autónoma de México (desde 1992) y de la Facultad de Ingeniería de la Universidad Anáhuac México Sur (desde 2013).

Ha impartido clases también en el Instituto Tecnológico Superior de Xalapa, en la Facultad de Ciencia y Tecnología de la Universidad Simón Bolívar y formó parte del Departamento de ingeniería y Ciencias Químicas de la Universidad Iberoamericana.

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SYLLABUS

FIRMAS DE LOS ESTUDIANTES INSCRITOS AL CURSO

"[Nombre y firma de cada alumno]"

1

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3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

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15

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SYLLABUS

REVISADO

_______________________________MC JOSÉ LUIS GARCÍA TAVERA

JEFE DE CARRERA INGENIERÍA AMBIENTALFACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS

ENTERADO

_______________________________QFB ANA BELÉN OGANDO JUSTO

SECRETARÍA ACADÉMICAFACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS