Mill. Inst . ('at. (list. Nat., 63.17-26 199,

OFICI DE NATURALISTA

Informatitzacio de 1'herbari dela Universitat de Girona (UdG)

Miquel Campos, Joan Font, Lluls Vilar, Lluis Polo &

Conxi Rodriguez-Prieto*Rebut 02 11 94

Acceptat 19.09.95

Resum

I.'herhari do la IJdG consta de mes de 12.000plecs de plantes vasculars i 3.200 d'algueshentoniques marines, actualment en procesd' informatitzacio mitjanFant FilcMaker pro 2.0per Macintosh. S'ha elaborat un programaanomenat IIGI que permet utilitzar el fitxertesaurus II'Tl.ORA del programa BDORCA(FON r, 1992), corresponent al catalcg de plantesvasculars dels Paisos Catalans. Al fltser, s'hi hanafcgit nuns camps corn Ia la in ilia, la forma vitali la corologia. I.'estructuracio d'aquest progra-ma permet, a mcs dc Ics funcions propies degestio d'un herhari, el traspas de la inforrnaciointroduYda a la base de dades BDORCA.

Pro 2. 0 by Macintosh . A program called HGI hasbeen made to utilize the thesaurus fileTEFLORA of BDORCA program (FONT, 1992),corresponding to the check - list of vascularplants from Catalan Countries . It has beenadded to the file new fields as family , life formand chorology. The structure of this programallows , apart from the own managementfunctions of an herbarium , the possibility ofreturning the introduced information to the datafile BDORCA.

KF:YWORUS: Herbaria , FileMaker Pro , Macintosh,Floristic Database.

M(7 IS ('I At': I lerharis, FileMaker pro, Macintosh , Resumenbase de dades floristica.

Abstract

The computerization of Girona University

Herbarium

Girona University Herbarium has more than12,000 specimens of vascular plants and3,200 of benthic marine algae, that is now incomputerization process by means of FileMaker

• Departament de ( icneies Amhientals. Unisersitat de (iiruna.

PI. Hospital, 6, I-:-17071 (iirona.

La informatizacion del herbario de laUniversitat de Girona (UdG)

El herbario de la Universitat de Girona constade mas de 12.000 pliegos de plantas vascularesy 3.200 de algas bentonicas marinas, actual-mente en proceso de informatizacion medianteFileMaker Pro 2.0 para Macintosh. Se ha elabo-rado un programa denominado HG1 que permiteutilizar el fichero tesauro TEFLORA del progra-ma BDORCA (FONT, 1992), correspondiente alcatalogo de plantas vasculares de los PaisesCatalanes. En el fichero se han ahadido nue-vos campos como la familia, la forma vital y lacorologia La estructuraci6n de este programapermite, ademas de las funciones propias de

17

() i 1(I I) I CAI I RAI ISIA

gestion de un herbario, el retorno de la informa-cion introducida a la base de datos BDORCA.

PAI.ABRAS c[,AVI:: herbarios, FileMaker Pro,

Macintosh, base de datos tloristica.

Introduccio

l.'hcrbari de la Universitat de Girona va

ser fundat l'any 1976 pel doctor Lluis Polo,

aleshores professor del Coilegi Universitari

de Girona, integrat a la Universitat AutO-

noma de Barcelona. FIs primers plecs van

sortir, precisament, de la seva col-leccib

particular, a la qual es van anar afegint, pel

que fa a les plantes vasculars, els plecs

corresponents als treballs de recerca que es

van dur a terme a les comarques gironines

els ant's seguents: estudis al cap Norfeu

(GIRBAI. & P010, 1978), al massis del

Montgri (MASSIF & Poi (), 1987) i a la vall

de Sant Daniel a Girona (Pot.o & V11 AR,

1983). Darrerament s'han inclos diversos

herbaris personals dels quals destaquem el

de Manuel lbarz sobre el Girones i la

Garrotxa, i el de J. Maynes-A. Mallol sobre

el Baix F.mporda. Finalment, cal esmentar

les col•leccions provinents de la Selva

(VII.AR, 1987) i de ('Alta Garrotxa (VINAS,

1993).

Pel que fa a les algues hentoniques, els

exemplars provenen dels diferents treballs

sobre sistematica, fenologia i ecologia

d'algues realitzats per L. Polo i C.

Rodriguez-Prieto (Polo, 1978, 1982; Polo

et al., 1980; BAI I.I[SIi ROS et al., 1984;

RODKiculcz-PRU 10, 1992; RODRICIJI:7-PRII ro

& Polo, 1988, 1993; Ro)DRio(JI:z-PRll ro et

al., 1993).

L'any 1991 1'herbari es va integrar a laXarxa Internacional d'Herharis, IndexIlerhariorum, amb les sigles IIG1. Amb datad'octubre de 1995, I'herbari de plantes

vasculars constava de 9.300 plecs catalogatsi d'uns 3.000 per incloure-hi. I el d'algueshentoniques marines, de 1.400 exemplarscatalogats i d'uns 1.800 per incloure-hi.

L'any 1994 es van iniciar els treballsd'informatitzacio de I'herbari de les plantesvasculars que han de suposar una millorgestio i consulta dels plecs. I.'ohjectiud'aquest article es, doncs, presenterl'aplicacio informatica creada: una base dedades d'Os senzill fins i tot per a personalno especialitzat.

Metodologia

S'ha avan4at molt d'en4a dels primers

treballs d'informatitzacio d'herbaris (I IAl t ,

1972; GRI I:NI:, 1972), i actualment existeix

en el mercat una oferta de hardware i

software que facilita la creacio i cl maneig

de banes de dades floristics , que ja s'ha

utilitzat per a diferents herbaris ibcrics

(PANDO, 1992; ESPINOSA et al ., 1993;

VASCON( IIOS, 1993; VnI AIR, 1993).

EI trehall d'informatitzacio de I'herbari

de la Universitat de Girona ha estat

condicionat a dos Pets principals: d'una

Banda, I'us de I ' entorn Macintosh per la

nostra Unitat i de I'altra , que no fos un

sistema tancat al principal bane de dades

floristic dels Paisos Catalans, ORCA ( B()l Os,

1985; FoN1, 1992).

f:l sistema de gestio de bases de dadesutilitzat cs FileMaker Pro 2 . OEv2 ( 1992) perMacintosh, que permet dur a tcrme amb

facilitat les funcions propies de disseny,

edicio, emmagatzcmatge i impressio de

dades, aixi corn la seva importacio i

exportacio a d'altres programes (perexemple dBase III, Lotus 1-2-3, Excel...).

FileMaker Pro facilita tambe la programaciode segiiencics de comandes interrela-cionades, que reben el nom de GUIONS,

18

STUDIUM GENERALE GERUNDENSE

Fntrada de nou plec

GestiO herbari

Impressio etiquctes

Opcions de Ilistat

Manteniment Flora

HGI

Unitat de Botanica de la

Universitat deGirona

I ic. 1. Menu principal de I'aplicacio IIGI

cadascun dels quals s ' assignen a unaicona (BO1O) (vegeu fig. I) que esvisualitza en pantalla formant part delsdiferents mends.

Aprofitant la possibilitat de transferenciad'inl'ormacici entre diferents tipus desistemes operatius com DOS i Macintosh(Dos Mounter , Apple Link ), s'ha efectuatI'intercanvi de les dades contingudes en ellitxer tesaurus de BDORCA, TL,FI.ORA, aun altre del programa FileMaker Pro. Enaquest nou fitxer s'ha realitzat una ampliaciodel contingut afegint-hi tres noes campscorresponents a la familia, la corologia i laforma vital de cadascun dels 5 . 344 taxonsque formen part del catalog floristic dels

Sortir J

Main menu of the HGI procedure

Paisos Catalans ( Boi ins et al., 1993). Lamateixa operacio es possible en sentit invers,de manera que la informacio continguda enel nostre herbari pot ser traspassada a unaaltra base de dades, com per exemple13DORCA.

Estructura i funcionament de

1'aplicaci6 HGI

L'aplicacio creada utilitza quatre fitxers,anomenats FLORA, ENTRADES, IIERB.4RIi HGI, dins dels quals s ' inclouen els guionsinterns que realitzaran les tasques indicades

19

UI I(I UI, hAll kAIJSl;1

O

41.1'1'(

iJ d,

I,,, I I., ^ q-

fllnN

uluNh

^J^^Na

I%I'

L

h I. I'I'(( ^l^t X::

1

1

(-:xl. (IN(-^

^I ulca

III^]

pi nere

aui:^r szp.

:::,,ai,i,,.4 avliw^ i hdMml

al(iluil

Aa(a

Itr:

l ahaccai

I ;,ic,ahnmJ

I' c

C

1 i'1'M

hl rrr< I:J^,N

I^l11% f .,,h::,,... ^^.

iilanlii-e 1IIlIINh

IIJIINa

11

11

1

Nf (:I^1 Nf:

E^7 nlli^a 1

F u.. 2. Fsquema del proces d'informatitzacio d'un plec Scheme of the computerization process of an herbarium

d'herbari specimen

Lt^(1Lsr

L __

E(T-117w1-1llvbI ^ Ic'::lui<a arh: .. n. eilanil.a

alli:a

1

20

genere epitet especific

ssp + autor ssp

autor sp

(am ilia

localitat i habitat

comarca

registre

altitud UTM UTM2

PLeg recol lectorDet determinador

data

HGI Studium Generale Gerundense

I ii,, i. Model de I'etiqueta utilitzada a I'herhari de laUniversitat de (iirona

en cls diferents menus. El fitxer FLORA

conte el tesaurus floristic, el d'I.NTRADES

cmmagatzema els noun registres corresponents

als darrcrs plecs informatitzats que, un coprevisats, son traslladats al fitxcr I IFRUAR1,

que es concretament cl bane de dades que

conte el conjunt de registres. FI titxer HGI,tinalment, conte cls guions quc permeten la

gestio de la resta de titxers.

I.'ohertura del titxer IIGI activa el menu

principal (tig. I ). D'aquesta presentaci6

partcixen les diferents opcions i s'hi retornaen acabar-les. Aqucst menu pcnnct I'entradade Woos plecs i la impressio d'etiquetes, perotamhe un acces de consulta at fitxer HI RI3ARI,

i at de FI MA coin a opci6 d'actualitzaci6 deIcs dades contingudes en el tesaurus.

L'entrada de glees

I.'cnt ada de noes registres s'inicia

premcnt cl hot6 I: (FIN I RADA Nt)U Pf i ( ), quc

ohre simultaniament cis fitxers FLORA i

I.N I'RAI)IE:S. La recerca d'un taxon es pot

realitzar introduint els epitets gcntric i

cs/)ccltic, si es vol de forma ahreujada, o be

el numero corresponent a la l lora Manual

clefs Par'sos Catalans (fig. 2). Si la forma

ahreujada introdu'ida correspon a mes d'una

Label example used in the Girona University Herbarium

espccie, o he n'existcixen diverses categories

subespecifiques, es pot escollir el taxon que

interessi.

A continuacio aparcix en pantalla la

presentacio dissemada per a I'entrada de

dades quc inclou, d'una Banda, la informacio

del tesaurus Flora (nom del taxon, autors,

familia, corologia i forma vital), i de I'altra,

els camps on s'hi afegiran les dades propies

del plec (municipi, localitat i habitat, co-marca, altitud, UTM, recol-lector, data i

determinador) (fig. 2). I.'ultim camp es elreservat al numero de plec de I'hcrbari (RI -GIS I RI ) quc, si es vol, es pot automatitzarevitant possibles duplicitats en la numeracio

dels plecs.

La impressio d'etiquetesF'Is processor d'impressio van associate

at boto I (IMPRFSSII> 1101 / II S). Fl progra-

ma permet el disseny de models

personalitzats d'ctiquetes, i l'escollit per

nosaltres es mostra a la figura 3. Horn pot

imprimir etiquctes dels darrers registres

entrats (amb una opcio de revisi6 previa) o

be de registres aillats que es troben a

I'herbari (fig. 4). Fn el cas dcls registres

d' F.N I RADI S es pot efectuar una impressio

21

UFICI OF NAIGRAI ISIA

IE

Colutea arborescens L.

gallica Browicz

Iabaccae HGI 977

MONISTROI.: St. Jeroni (Montserrat)

- _ Bagc s 600 m I )G 00

I cg_: I PoloDet : id.

30-6. 69

HGI Studium Generale Gerundense

P

T

Escriu num. de registre:

Continuar

Colutea arborescens L.

gallica Browicz

I abaccac HGI 977

MONISTROI.: St. Jeroni (Montserrat)

Rages 600 m I)G 00

Leg.: 1.. PoloDet.: id.

3 0 -6-69

HGI Studium Generale Gerundense

Cancel lar Imprimir

Fui. 4. Fsquema del proces d'impressio d'etiquetes Scheme of process for labels printing

Impri^ntir tots Imprimir unels registres umc registre

( ancel'lar

22

ISTUDIUM (;ENERALE GERUNDENSE

Options de Ilistat:

Buidat herhari

Pertaxons

Per quadrats IJ I M

Per municipis

C)(JD(:73-)

CD

II(;I

CIDC6D

CD

CD=9

Per comarques

Per Ibrma vital

Per corologia

Per altitud

Per diverses opcions

C Anul lar

Coditaxon

genere

especie

suhsp.

Buscar

Menu principal Anul lar

Fio. 5. Esqucma de Its possibles options de Ilistat

de totes les titxes o d'una de restringida,

indicant-hi el numero de plec (fig. 4). Quan

la impressi6 es d'un unit plec cal escriure

el numero de registre corresponent,

I'etiqueta del qual apareixera en pantalla

amb una opcio de cancel•lacio per si no fos

la desitjada.

Les options de Ilistat

Al hot6 I (OPCIONS DI, I I ISIAI ), hi van

associades les diferents opcions de consulta.

1 211411

Gratiula

o_tTicinalis_

Scheme of different options list

Entre d'altres, horn pot obtenir la Ilista i el

nombre de plecs continguts a l'herbari, els

taxons recol • lectats en una quadricula ETM,

aixi corn cn una cornarca o municipi

seleccionats , i les diferents quadricules EfM,localitats i cornarques en les quals s'ha

herboritzat un taxon determinat (fig. 5).

Corn a exemple es d6na la Ilista de plecs

de Gratiola officinalis I.., dipositats aI'herbari , tal corn s'obte en una de les

opcions de Ilistat de I'aplicaci6 IIGL

23

OIICI 1)1 'JAII[RAI IS IA

UTM localitat comarca altitud registre data

DG 72 SII.S Selva 75 in 1101 6728 15-08-84

DG 82 CALDFS DE MALAVFLLA, entre can

Fully i Sta. Ccclina Selva 120 m IIGI 1726 19-05-82

DG 83 CALDES DE MALAVI:I,LA, a can Per-

pinya, prop del limit amb Sils Selva 80 m 11(11 1729 05-06-85

DG 83 CASSA 1)E LA SELVA, a Sant Vicenc

d'I?sclet, a un Gaudinio-Arrhenatheretum Gironcs 110 m 1101 5227 23-06-91

DG 83 CASSA DL LA SELVA, a la resclosa

de la riera Berneda Gironcs 100 m 11GI 7322 20-09-82

DG 86 PORQUFRES, al Clot d'Espolla Pla de 1'lstany 240 ni 11GI 1725 25-03-88

DG 88 DARNItJS, prop del mas Ccllers Alt Emporda 300 m IIGI 6904 21-05-94

DG 99 LA JONQt1FRA, als Estanys Alt I :mporda 175 in 11G1 1728 15-05-89

1)G 89 LA VAJOI., prop del Coll de LII Alt Iimporda 750 m 1101 9335 21-11-95

La gestio de I'herbari

Al boto G (GI srlO III IMAM), hi van

associats els processos d'incorporacio de les

noves entrades al fitxer HI :RBARI, la corrcccio

d'errors existents en les etiquetes d'herbari

i les opcions d'exportacio a d'altres bases

de dades (per exemple, BDORCA). Aixi es

pot crear un fitxer on constin tots els plecs

de I'herbari d'un o mes taxons prcviament

seleccionats. I:l fitxer resultant, en format

de text separat per comes, es pot exportar i

ser incorporat directament a la base de Jades

de BI)ORCA, amb la qual cosa es pot gene-

rar el mapa corologic corresponent (fig. 6).

I)iscussio

EI programa IIGI ha permcs la

intormatitzacio del contingut de I'herbari dela Universitat de Girona de forma senzillaen el curt periode d'un any. L'exportacio deles dades sol•licitades per ORCA ja s'efectuacomodament mitjani;ant aquesta aplicacio.

Aquesta aplicacio pot ser una bona einaper a la gestio de la informacio continguda

en herbaris de petites dimensions, com cs

el cas del de la Universitat de Girona.

Tanmateix, a causa del tipus de sistema de

base de dades emprat (FileMaker Pro 2.0),

el programa tc un funcionament normal

sempre que cl fitxer on s'acurnula la

informacio (HI(RBARI) no superi els 32

Mbytes de memoria cosa que equivaldria,

aproximadament, a uns 50.000 plecs.

Per a herbaris amb un nombre d'espc-cimens superior, caldria utilitzar progra-mes de base de dades de tipus relacional

(com per exemple FoxPro, 4th Di-mension...) en els quals, a dil'erencia deFileMaker, el proccs d'informatizaci6 delsplecs no precisa de la duplicacio de lainformacio continguda en cls fitxers

tesaurus, amb el conseguent estalvi dememoria i guany en la consulta de lainformacio.

:Is autors no tindran cap inconve-nient en oferir una copia d'aquest pro-grama a les persones que hi esliguininteressades.

24

Y B C

L

--I

J

H

L

iU

1

•••

•

•••

F

H

G

F

D

C

I ii . 6. Mapa corologic de Gruiiolu offrcinalis obtingut Chorological map of Gratiola officinalis obtained from

a partir de la informacio dell plecs existents a I'herhari the herbarium specimens of the Girona University

de la tiniversitat de Girona

I ^-

25

() 1 1 ( 1 1 )1 y \1I k \1 I5I \

Agraiments

Hem d'agrair al I)r. Xavier Font els

consells donats durant I'elahorac16 del pro-

grama i la cessi6 dels diversos fitxcrs

tesaurus de la base de dades I3DORCA.

Dihliografia

BAi I I s o sos, li., POI O, L. & RomI RO, J. 1984. Vegetaciosubmarina de les [Iles Medes. I. Algues. A: Els5i.slemes naturals de les Illes Mede.s. Arx. Sec. Cien.IEC, 73: 333-371. Barcelona.

Bin is, O. uF. 1985. Corologia de la Flora dels Pa'isosCatalans. Volum introductori. Inst. Est. Cat. 79 p.Barcelona.

BUIOS, O. ui; VIGO, J.; MASAI I is, R.M. & NINOI, J.M.

1993. Flora Manual dell Paiso.s Catalans (2a ed.).

Ed. Pbrtic. Barcelona. 1247 p.

ESPINOSA, R.; Moi INA CANTOS, R. & VAFOf:s, A. 1993.

lJn software especifico para la gestion de herharios.

Resumos XIII Jornadas de Fitossociologia (Lishoa):

164.

FONI, X. 1992. Manual de 1'usuuri del programaBDORCA. ICC. ORCA-Butll. intern, 3. Barcelona,23 p.

GIRRAI , J. & Polo, 1.. 1978. Flora y vcgetacion de CaboNorfcu. Bol. Est. ('enir. Ecol., 7(13): 3-22.

GRI I N, D.M. 1972. A taxonomic data hank andretrieval system for small herbarium. Talon, 21(56): 62 1-629.

IIAI I , A.V. 1972. Computer-based data banking fortaxonomic collections. loran, 21 (l ): 13-25.

MASSIF, R. & POI u, 1,. 1987. Contribucio atconeixement de la flora vascular del massis delMontgri (E:mporda). SCIENTIA gerundensis, 13:115-129.

PANOI), F. 1992. Etimatic. Un programa de ordenadorpara hacer etiquetas de herbario y listas de mate-rial. Anale.s Jard. Hot. Madrid, 50(l ): 128.

POLO, L. & Vn AR, L. 1983. La Vegetacio de Sant Da-niel. An. See. ('line. CUG, 9: 11-20. Girona.

POI o, L. 1978. Estudio sabre la.s algas hentcinicas dela costa ratalana. Tesi doctoral. UniversitatAutbnoma de Barcelona. Bellaterra.

POLO, I,. 1982. Relacio d'especies recol'lectades pelscongressistes del IV Simposi de BotanicaCriptogamica. Anale.s Sec. Cienc. C'CG, 8: 25-32.Girona.

POI 0, 1 . . ; OFIVt:LI.A, I . ; Gn I , C.; ANAI0N, R.; CARBONI 11,R.; AiIIMIRA, C.& Ros., J. 1). 1980. Primcra aporta-cion a la sistematica de la flora y fauna hentonicasdel litoral de San Ciprian (Lugo). Actas del I Simp.lber. Bent. Mar. (I ): 333-375. San Sebastian.

RoORiOCez-PRn:ro, C. & Pow ALBFRI1, L. 1988. Apor-tacion a la fenologia de algas bentonicas de suhstrato

duro de la Costa Brava (Gerona). Acte.s del SimposiInternacional de Botanica Pius Ion! i Quer. Vol. 1.C'riptogamia: 143-149. I.leida.

RouRiiUF7-PRIF.ro, C. & Poi o Ai HI RI1, I.. 1993.

Contribucio a la flora d'algues marines de Ia

Mediterrania espanyola. Fol. Bot. Misc., 9: 19-24.

R(roRICCF/-PRlt ro, C. 1992. Esiudi de l'estructura, ladinamica i la lenalogia de la comunitat deCystoseira mediterranea Sauvageau. La iniportanciade le.s minve.s d'hivern. fesi ddctoral. llniversitatAutbnoma de Barcelona. Bellaterra.

RoiRiaUri-PRm i1i, C.; BOI DOI RI sQ1 I, C.-F. & MAR( 'OI-

COQI I116NR)I, J. 1993. Nouvelles observations sur

les algues marines du Parc Naturel Regional de

Corse. Pare. not, reg. Res. nat. Corse, Fr., 41: 53-

61.

SI OANF-CAMIA, J. & Poi U, 1.. 1978. Comunidadesbentonicas de sustrato duro del litoral NE: espaAol.XVII. Distribucion en profundidad de ]as especiesde algal. Anales Inst. Bo!. Caranilles, 35: 29-47.Madrid.

VAS( ON( FI I OS, T. 1993. Informatizacao do hcrhario do

instituto superior de agronomic. Resu,nos X111 Jor-

nada.s de Fito.ssociologia (I.ishoa): 167.

VIL AR, L. 1987. Flora i vegetacio de la Selva. Tesi

Doctoral. tiniversitat Autbnoma de Barcelona.

Bellaterra.

Vii [AR, L.; GOMF/, 1). & MU NO/, J.F. 1993. Thecomputer application «Ilerhar 2.0>>: mangement ofc(JACA» herbarium data. In: Int. Svmp. & FirstWorld Congr. on Preserv. and C'on.serv. o/ Nat. Mist.Cal. Vol. 1: 293-299. Madrid.

VISAS, X. 1993. Flora i vegetacici de !'Alta Garrotra.

Tesi doctoral. liniversitat de Girona. Girona.

26