Marcadores Genéticos XML
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FACULTAD DE CIENCIAS AGRARIASESCUELA DE INGENIERÍA AGRONÓMICA
GENÉTICA
NOMBRE:
XAVIER MOLINA LÓPEZ
PROFESOR:
ING. GONZALO ALMAGRO
TEMA:
MARCADORES GENÉTICOS
MARCADORES GENÉTICOS
Es un locus polimórfico que indica:
El genotipo de los organismos que presentan el marcador. Aplicación en estudios de genética de poblaciones El genotipo de uno o varios loci ligados al marcador. Aplicación en clonación posicional y en selección asistida por
marcadores
Si un marcador sigue las leyes de Mendel Þ MARCADOR GENÉTICO
Debe ser: Polimórfico Multi-alélico Codominante – No interacción intraalélica No epistático – No interacción interalélica Neutro – No efecto fenotípico o selectivo por sustitución alélica Insensible al ambiente Abundante y distribuido en el genoma
Tipos de Marcadores Morfológicos – genes que controlan características morfológicas Bioquímicos – isoenzimas y proteínas Moleculares – ADN
Marcadores Morfológicos
Genes que determinan fenotipos de fácil identificación visual: Enanismo Deficiencia de clorofila – albinismo Color de pétalos Morfología foliar Pubescencia Primeros mapas genéticos
Limitaciones de Marcadores Morfológicos Insuficientemente polimórficos Generalmente dominantes Interfieren con otras características Influenciables por el ambiente Poco abundantes Se los identifica a nivel de planta completa o adulta (tiempo)
Marcadores Moleculares
Develan: Polimorfismos detectados en el DNA del núcleo y organelos
Ventajas:
No sujetos a la influencia del medio ambiente Potencialmente de número ilimitado Objective: medir la variación La mayor desventaja es la necesidad de equipo técnicamente
más complejo
Tipos de marcadores moleculares
Basados en corte de DNA con enzimas RFLP (Restriction Fragment Length polymorphism)
Basados en PCR RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism) Microsatélites o SSR (Simple Sequence Repeat) Región amplificada caracterizada por una secuencia (SCAR))
Región amplificada caracterizada por una secuencia (SCAR))
Los SCAR aprovechan una banda que ha sido generada en un experimento de RAPD, san cebadores de16 a 24 pb, diseñados a partir de los extremos de marcadores RAPD clonados.Esta técnica transforma una banda —propensa a dificultades de interpretación o de reproducibilidad— en un marcador muy confiable.
Ventajas: Patrones más sencillos que los RAPD Ensayo sólido gracias al uso de cebadores largos específicos Herencia mendeliana. A veces convertibles a marcadores
codominantes Desventajas: Requieren un conocimiento mínimo de las secuencias Requieren esfuerzo y gastos para diseñar cebadores específicos
de cada locus
AFLP (Amplified Fragment lenght polymorphism)
Combina el corte del DNA con enzimas de restricción (RFLP); y Amplificación de fragmentos de DNA mediante PCR con “primers” arbitrarios (RAPD).Ventajas:
Rápido scan del genoma por polimorfismos debido al gran úmero de bandas generadas por cada par de primers
Produce un fingerprint altamente informativo Son también altamente reproducibles No requiere información previa sobre la secuencia o sonda Extremedamnte útil para crear mapas genéticos “Transcript
profiling”
Desventajas: Generan grandes cantidades de información, que pueden
requerir análisis automatizados y por tanto tecnología computacional.
Son marcadores dominantes En mapeo genético, se agrupan en los centrómeros y telómeros Son técnicamente demandantes en el laboratorio y,
especialmente, en el análisis de datos.
Aplicaciones: Determinación de la variabilidad Análisis de distancias genéticas Fingerprinting Analisis de colecciones Mapeo genómico Monitoreo de marcadores de diagnóstico
Instrumentos utilizados en estos procesos
Electroforesis vertical
Electroforesis horizontal
Gel de Agarosa
Termociclador
Secuenciación de ADN