Practica 1. definicion de un problema epidemiológico

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PRÁCTICA 1. DEFINICIÓN DE UN PROBLEMA EPIDEMIOLÓGICO Y DESARROLLO DE BASES ANALÍTICAS. INTRODUCCIÓN La planeación de un estudio epidemiológico involucra distintas etapas. La definición del problema es sustantivo ya que permite establecer los objetivos e hipótesis adecuados al problema optimizando lo recursos humanos y económicos. Los objetivos a su vez permiten definir la matriz de variables asociadas a los subsistemas del Sistema Epidemiológico en estudio (Figura 1). Figura.1 Esquema de un Plan de Estudio Epidemiológico En esta práctica se trabajará en la definición de un problema epidemiológico hasta la generación de un diagnóstico exploratorio del mismo. Es decir, la solución es una aproximación ya que puede implicar ulteriores procesos de verificación, por ejemplo vía experimental. En esta práctica se intenta aplicar el análisis de los insumos proporcionados así como otros elementos del marco cognitivo Dr. Gustavo Mora-Aguilera Práctica 1. Epidemiología FIT612/verano 2014. Colegio de Postgraduados 1 D efinición del D efinición del Problem a Problem a O bjetivos O bjetivos e e H ipótesis H ipótesis M odelo delSistem a M odelo delSistem a Epidemiológico Epidemiológico M atriz M atriz de variables de variables asociadas asociadas a a los subsistem as los subsistem as Investigación Investigación en en condiciones condiciones controladas controladas Investigación Investigación sinóptica sinóptica o bibliográfica bibliográfica Investigación Investigación Em pírica Empírica (no form al) (no form al) Síntesis Síntesis y y Solución Solución al alProblem a Problem a

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PRÁCTICA 1. DEFINICIÓN DE UN PROBLEMA EPIDEMIOLÓGICO Y DESARROLLO DE BASES ANALÍTICAS.

INTRODUCCIÓN

La planeación de un estudio epidemiológico involucra distintas etapas. La definición del problema es sustantivo ya que permite establecer los objetivos e hipótesis adecuados al problema optimizando lo recursos humanos y económicos. Los objetivos a su vez permiten definir la matriz de variables asociadas a los subsistemas del Sistema Epidemiológico en estudio (Figura 1).

Figura.1 Esquema de un Plan de Estudio Epidemiológico

En esta práctica se trabajará en la definición de un problema epidemiológico hasta la generación de un diagnóstico exploratorio del mismo. Es decir, la solución es una aproximación ya que puede implicar ulteriores procesos de verificación, por ejemplo vía experimental. En esta práctica se intenta aplicar el análisis de los insumos proporcionados así como otros elementos del marco cognitivo del problema no necesariamente proporcionados y que deben ser parte del perfil profesional.

Para tal fin, se proporcionan insumos técnicos obtenidos a partir de la dispersión de HLB de los Cítricos a nivel de campo en: 1) Colima (INIFAP-CESAVECOL, 2010), 2) Brasil (FUNDECITRUS, 2010) y 3) Paraguay (SENAVE, 2013) con el objetivo de aplicar el principio mencionado anteriormente. Adicionalmente, a nivel de planta se proporcionarán muestras colectadas en México de plantas asintomáticas de HLB. A partir de ellas, se realizará un análisis molecular a la presencia de un virus. En este

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Definición del Definición del ProblemaProblema

ObjetivosObjetivos e e HipótesisHipótesis

Modelo del Sistema Modelo del Sistema Epidemiológico Epidemiológico

MatrizMatriz de variables de variables asociadasasociadas

a a los subsistemaslos subsistemas

Investigación Investigación en en condiciones condiciones

controladas controladas

InvestigaciónInvestigaciónsinóptica sinóptica oo

bibliográficabibliográfica

InvestigaciónInvestigaciónEmpíricaEmpírica

(no formal)(no formal)

SíntesisSíntesis y y SoluciónSolución

al al ProblemaProblema

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objetivo se pretende que el estudiante realice la conexión entre este proceso a nivel planta y los procesos a nivel población en las entidades y/o países mencionados. En el desarrollo de la presente práctica se buscará que los estudiantes fomenten la concepción de problemas concretos para la búsqueda de alternativas analíticas.

OBJETIVOIntroducir el razonamiento epidemiológico como base para la definición, análisis y propuesta de solución de problemas.

METODOLOGÍA

*** Campo:1. Revisa y analiza la secuencia de mapas incluidas en la práctica respectiva en la

Plataforma Moodle Curso FIT612-2014 (www.infit.org.mx/moodle/).2. Define el problema epidemiológico que se deriva de los insumos

proporcionados. 3. Genera insumos que expliquen en el comportamiento de la dispersión del HLB

asociativos al problema planteado.4. Desarrolla hipótesis con un enfoque Epidemiológico.

*** Laboratorio:1. Realiza la extracción de ARN por método CTAB 2% y retrotranscripción. 2. Preparación de cDNA para su amplificación. En este procedimiento el Kit

(Biorad) ya cuenta con los componentes necesarios. Anteriormente se adicionaba DNTPs, buffer, enzima Taq Polimerasa.

3. Amplificar el fragmento. El equipo de PCR tiempo real amplifica por temperaturas y cuantifica el número de copias amplificadas de forma directa (Cts). A mayor concentración el tiempo de amplificación es más bajo.

4. Define el problema epidemiológico que se deriva de los insumos proporcionados.

5. Desarrolla hipótesis con un enfoque Epidemiológico.

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TU TURNO¡

1. Inicia sesión en la plataforma del curso FIT612. Emplea las cuentas de usuario proporcionadas por el profesor.

2. Emplea los insumos de HLB (Colima, Brasil y Paraguay) que se encuentran la presentación correspondiente a la Práctica 1 para desarrollar las indicaciones proporcionadas del instructor durante la práctica.

3. En laboratorio, emplear los insumos proporcionados por el instructor(es) para realizar PCR tiempo real para la detección del Citrus tristeza virus para su detección y cuantificación de carga viral en muestras de tejido vegetal de cítricos.

4. Discute en equipo y genera las conclusiones generales en torno a la concepción del problema, así como conclusiones específicas asociadas al mismo.

5. Desarrolla una(s) hipótesis relativas al problema proporcionado.

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