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PUESTA A PUNTO DE UNA TÉCNICA MOLECULAR CON CAPACIDAD DIFERENCIADORA DEL ECOTIPO DE CORZO ANDALUZ ORIGINARIO DE LAS SIERRAS DE CÁDIZ- MÁLAGA DEL RESTO DE POBLACIONES IBÉRICAS Y EUROPEAS INFORME FINAL Mayo 2012
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PUESTA A PUNTO DE UNA TÉCNICA MOLECULAR CON
CAPACIDAD DIFERENCIADORA DEL ECOTIPO DE CORZO
ANDALUZ ORIGINARIO DE LAS SIERRAS DE CÁDIZ-
MÁLAGA DEL RESTO DE POBLACIONES IBÉRICAS Y
EUROPEAS
INFORME FINAL
Mayo 2012
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Este trabajo se ha realizado en el marco del expediente “Plan de Gestión y Reintroducción del
Corzo en Andalucia2 (959/2009/M/00), financiado por la Consejería de Medio Ambiente y
Ordenación del Territorio de la Junta de Andalucía.
Directora Instituto Andaluz de Caza y Pesca Continental: Isabel Redondo. Dirección General de
Gestión del Medio Natural. CMAOT.
Dirección Facultativa Expediente: Pablo Fernández-Salguero. Delegación Territorial de la
Consejería de Medio Ambiente y Ordenación del Territorio en Córdoba.
Investigadores responsables del estudio, redacción y contenidos del informe: Dr. Samer Alasaad
y Dr. Ramón C. Soriguer (Estación Biológica de Doñana-CSIC).
Técnico responsable expediente y coordinación: Cristina San José (Agencia de Medio Ambiente
y Agua de Andalucía).
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Introducción
Los resultados de los estudios científicos sobre el corzo andaluz originario
de las Sierras de Cádiz-Málaga (Lorenzini et al. 2003; Royo et al. 2007) promovidos
por la Junta de Andalucía a lo largo de los últimos 20 años, han evidenciado la
existencia de un ecotipo de Corzo Andaluz originario de las sierras de Cádiz-
Málaga. Este corzo muestra diferencias significativas a nivel morfológico con
respecto a otras poblaciones españolas y europeas, incluyendo diferencias
significativas en la forma del trofeo.
A nivel genético existen diferencias significativas entre los corzos de la mitad
norte y la mitad sur de la Península Ibérica, con una segregación geográfica y
genética dentro de la “subpoblación sur”, donde los corzos de la Sierra de Cádiz-
Málaga pertenecen a una población genéticamente independiente, lo que
corrobora las diferencias encontradas a nivel morfológico y la existencia de una
raza o ecotipo singular originario de las Sierras de Cádiz-Málaga.
Por otro lado, en Septiembre del 2009, la Dirección General de Gestión del
Medio Natural de la Consejería de Medio Ambiente de la Junta de Andalucía
encomienda a EGMASA la ejecución de los trabajos relativos al expediente “Plan de
Gestión y Reintroducción del Corzo en Andalucía”. Uno de los objetivos del Plan
consiste en la implantación de la certificación genética del corzo andaluz originario
de las sierras de Cádiz-Málaga, para lo que se requiere la utilización de marcadores
genéticos que permitan su diferenciación. La certificación genética tiene como
objeto prevenir la introducción ilegal de corzos no autóctonos en Andalucía y
poner en valor los trofeos de caza de los ejemplares de corzo procedentes de
Cádiz-Málaga.
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Objetivos
El objetivo principal de este proyecto ha sido:
- Diseñar una herramienta molecular con capacidad para discriminar el
corzo andaluz de las Sierras de Cádiz y Málaga de las del resto de España.
Adicionalmente, este estudio ha permitido conocer una serie de parámetros
poblacionales de las poblaciones de corzo:
Heterogeneidad de la diversidad genética entre las poblaciones
estudiadas de corzo.
Cuantificación de la diversidad genética de los alelos, y el posible
efecto de la migración entre las poblaciones en la estructura genética
poblacional.
Flujo génico entre cada par de poblaciones (Nem), según el modelo
de separación y bajo el concepto de neutralidad y de la ignorancia
de mutaciones.
Además se llevó a cabo un análisis de la relación genética entre
individuos de las poblaciones estudiadas, estudiándose el número de
cluster y, cómo cada cluster, fue asociado a las diferentes
poblaciones estudiadas. F
Finalmente hemos estimado la huella genética de posibles cuellos de
botella en el corzo andaluz originario de las Sierras de Cádiz-Málaga.
En el Anexo III se ha recogido un resumen de Definiciones y conceptos de
los términos ms frecuentemente utilizados en este informe.
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Material y Métodos
Marcadores moleculares
Un marcador genético o marcador molecular es un segmento de ADN con
una ubicación física identificable (locus) en un cromosoma y cuya herencia genética
se puede rastrear. Un marcador puede ser un gen, o puede ser alguna sección del
ADN sin función conocida. El término marcador genético o molecular hace
referencia a moléculas, normalmente proteínas o fragmentos de DNA que
presentan un cierto nivel de variabilidad y que por ello permiten caracterizar
unidades biológicas, desde el individuo hasta la especie o taxones superiores (Avise
1994).
Los marcadores moleculares comparten una serie de propiedades de las que
las más importantes son las que les confieren su interés para diferentes
aplicaciones. Entre estas, dos importantes, la herencia mendeliana (para que un
fragmento de ADN sirva para rastrear la transmisión de un segmento de
cromosoma de una generación a otra es necesario que cumpla la condición de
transmisión, siguiendo el modelo mendeliano de segregación, es decir, que pase
de padre a hijo como una unidad discreta y con una probabilidad fija) y el nivel de
polimorfismo (término que significa que la secuencia nucleotídica de un segmento
de ADN o locus varía de un individuo o de un cromosoma a otro).
Actualmente, las herramientas de genética molecular proporcionan un gran
número de marcadores de ADN. Las posibilidades que estas técnicas ofrecen al
mundo de las especies silvestres, entre ellas las de interés cinegético, son de
enorme valor.
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Para afrontar problemas tales como la fragmentación de poblaciones,
aumento de deriva, consanguinidad y cuellos de botella o efecto fundador, se
estudia el grado o nivel de variación genética, medido como heterocigosidad
media y diversidad alélica en las poblaciones. Este grado se estimará para las
poblaciones españolas de corzo a partir de los genotipos de los individuos
muestreados para un juego de marcadores microsatélites, una poderosa
herramienta aplicada para medir variabilidad genética (Brufford et al 1993).
Los microsatélites son secuencias formadas por la repetición en tándem de
unidades de entre 2 y 6 nucleótidos (Tautz 1989). Su variabilidad es debida a que
cada alelo tiene un número diferente de repeticiones de estas unidades, de forma
que un locus microsatélite típico presenta un elevado número de alelos.
Microsatélites
Los microsatélites se analizan amplificándolos a través de PCR (Polymerase
Chain Reaction; Mullis & Faloona 1987) usando cebadores diseñados para que
sean complementarios a las regiones que flanquean al microsatélite.
7
Las medidas de diversidad genética habitualmente utilizadas son, en el caso
de la variabilidad alélica, el cálculo del número medio de alelos por locus (NA/locus)
y los alelos privados por población (ver Anexo III. Definiciones y conceptos). A nivel
de la proporción de los diferentes genotipos dentro de las poblaciones, la
diversidad genética o heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho) por locus en
cada población y la riqueza alélica (r).
De forma aislada estos datos tienen un valor limitado, por lo que se utilizan
comparaciones entre poblaciones para llevar a cabo una buena evaluación de la
diversidad genética de éstas y de posibles procesos de diferenciación y aislamiento
de las subpoblaciones.
Por todo ello, realizaremos una cuantificación y discriminación de la
variabilidad genética de las poblaciones españolas de corzo, mediante el uso de
marcadores microsatélites.
Colección de muestras y extracción de ADN
En el presente trabajo hemos analizado 258 muestras de tejido de corzos
españoles en 8 localidades diferentes (Tabla 1 y Figura 1). Además otros 35
ejemplares de corzos de origen alemán fueron introducidos en el análisis como
out-group.
Todas las muestras son tejidos colectados de animales que proceden de la
caza legal; 121 muestras de corzos de Cádiz-Málaga y 53 muestras de corzos de
España fueron aportadas por la Agencia de Medio Ambiente y Agua de Andalucía
(Consejería de Medio Ambiente-Junta de Andalucía), el resto de las muestras de
corzos españoles fueron aportadas por el IREC, (CSIC-UCLM, Ciudad Real). El
8
instituto de Leibniz-Institute for Zoo and Wildlife Research, aportó 35 muestras de
corzos de Alemania para ser usadas como out-group. Este número de muestras
europeas externas resultó suficiente para alcanzar el nivel de significación requerido
en los resultados.
Las muestras fueron conservadas en etanol al 100%. Para la extracción del
ADN se ha utilizado el kit comercial (BioSprint 96 and QIAamp DNA Mini Kit;
QIAGEN).
Tabla 1. Procedencia de las muestras de corzos españoles utilizadas en el análisis
molecular.
Referencia Población
Número de
animales
1: Asturias 74
2: Lugo 10
3: León 26
4: Segovia 6
5: Guadalajara 5
6: Toledo 6
7: Ciudad Real 4
8:
Cádiz-
Málaga 127
9
Figura 1. Localización geográfica de las poblaciones españolas de corzo
caracterizadas genéticamente en el estudio.
Península Ibérica
España
Cádiz-Málaga
Ciudad Real
Toledo
Guadalajara
Segovia
Leon
Lugo
Asturias
10
Genotipado de los microsatélites
Hemos usado 12 loci de microsatélites neutrales: BM4107 (Bishop et al.
1994), HAUT14 (Thieven et al. 1995), NVHRT16, -21, -24, -30, -48 (Røed y
Midthjell 1998), y Roe01, -05, -06, -08, 09 (Fickel y Reinsch 2000) (Tabla 2) ya
probados anteriormente en otras poblaciones del corzo europeo (Fickel et al.
2012), con la misma mezcla de PCR y el perfil de temperatura del termo-ciclador
descrito en Fickel et al. (2012).
Tabla 2. Conjunto de Microsatélites utilizados en el análisis de las 8 poblaciones de
España y la de Alemania.
Primers Forward 5' 3' Reverse 5' 3' Authors
Roe1 AAATTTGGCTCTGCAATCGG ACACAAAAGCCACCCAATAC
Roe5 TAATATGAATCACTTGGATG TCCACCTCCCAGCCTGCATC
Roe6 GTTCCTAGCCCAGTGCTC TGCAGACCTGGCAGAC
Roe8 AAGCCGCGCTTGAAGGAG ATCAAGCTCCCCTCTTCG
Roe9 TTGGCGTCATTCCAACAGAG TCACAGCAGAATGTCATCTG
NVHRT16 ATTCTAAGCCCAAATAATCTT TCTAAGGGGTCTGTGTCTT
NVHRT21 GCAGCGGAGAGGAACAAAAG GGGGAGGAGCAGGGAAATC
NVHRT24 TGTGGACTATAGGGAGC GTGTACAAAAAGTGATTGAGT
NVHRT30 GTGGAGCATTGTGTATGTGT GCCCCCACTGTGTTTT
NVHRT48 CGTGAATCTTAACCAGGTCT GGTCAGCTTCATTTAGAAAC
BM4107 AGCCCCTGCTATTGTCTGAG ATAGGCTTTGCATTGTTCAGG Bishop et al. 1994
HAUT14 TGACCTTCACTCATGTTATTAA CCAGGGAAGATGAAGTGACC Thieven et al. 1995
Fick
el y
Rei
nsc
h 2
00
0
Rø
ed y
Mid
thje
ll 1
99
8
La mezcla de PCR mixture (15µl) contenía 0.1µl de FastStart polymerase
(5U/µl; Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Alemania), 1.5µl 10× FastStart buffer
de reacción (contiene 20mM MgCl2; Roche, Mannheim Alemania), 1.2µl dNTPs (10
mM), 0.6µl de cada primer (10µM), 1µl BSA (2µg/µl), 3µl DNA (50–120 ng), 7µl
H2O. El perfil de temperatura del termo-ciclador fue 95 ◦ C 5 min, 35× {95 ◦ C
30s, 50◦ C 30s, 72 ◦ C 30s}, 72◦ C 7 min llevado a cabo en equipo PeqStar PCR
11
(PeqLab). Los fragmentos de microsatélites fueron visionados en A3130xl
sequencer (Applied Biosystems, Darmstadt, Alemania).
Resumen de la temperatura de anealing:
NVHRT24, y NVHRT 30……………………………………………….………. 49ºC
Roe01 (105), Roe05 (RROH), BM4107, Haut14……………………………. 50ºC
Roe6 (RROK), Roe08 (RMCMK), Roe09 (Rjab1), NVHRT16, NVHRT 21 y NVHRT 48
...………………………………………………………….......……………..…. 55ºC
Los 12 microsatélites se agruparon en seis Mix para ahorrar en el número de
corridas en el secuenciador:
NV21 y NV48…………………………………………………… Mix1
R105 (ROE01) y BM4107………………………….…………… Mix2
RMK (ROE08) y NV16…………………….……………….…… Mix3
ROH (ROE05)…………………………..………………………. Mix4
HAUT14 y NV30…………………………..…………….……… Mix5
ROK (ROE06), RJAB (ROE09) y NV24……………………..….. Mix6
El análisis de los microsatélites
Hemos usado el programa GENEPOP (v.3.4; Raymond & Rousset 1995) para
calcular la heterocigosidad esperada (HE) y observada (H
O), y para testar el
equilibrio de Hardy-Weinberg (HWE). El test de probabilidad exacta de Fisher’s
exact con correcciones de Bonferroni se usó para evaluar el desvío de equilibrio de
HWE. El Linkage disequilibrium (LD) entre cada pares de loci de microsatélites fue
examinado con el programa Arlequin 3.11 (Excoffier 2006).
12
La heterogeneidad de la diversidad genética entre las poblaciones
estudiadas de corzo fue estimada con la partición de la varianza (método AMOVA)
aplicando el estadístico de FST
convencional usando el programa Arlequin 3.11. El
mismo programa fue usado para cuantificar la diversidad genética de los alelos, y el
posible efecto de la migración entre las poblaciones en la estructura genética
poblacional. El flujo genético fue estimado entre cada par de poblaciones (Nem),
según el modelo de separación y bajo el concepto de neutralidad y la ignorancia
de mutaciones (Slatkin 1993).
El análisis de la relación genética entre individuos de las poblaciones
estudiadas fue llevado a cabo bajo el principio Bayesiano con el programa
Structure (v.2.3.3; Pritchard et al. 2000). Los paámetros Burn-in y la longitud de los
runs de las cadenas de Markov fueron 100000 y 500000, respectivamente. Se han
ejecutado20 runs independientes para cada valor de K (K = 1-10). El número ideal
de los clusters (grupos) fue estimado usando el método de Evanno et al. (2005).
Finalmente, cada cluster fue asociado con las poblaciones estudiadas.
En las poblaciones animales que sufren de un cuello de botella genético, la
heterocigosidad observada tiene la tendencia de ser mayor que la heterocigosidad
observada bajo el equilibrio mutación-deriva (HEQ
) (Piry et al. 1999). Y de ahí hemos
estimado la huella genética de posibles cuellos de botella en el corzo andaluz
originario de las Sierras de Cádiz-Málaga bajo tres test de exceso de
heterocigosidad; Sign Test, Standardized Differences Test y Wilcoxon Sign-Rank
test usando el software BOTTLENECK (v.1.2.02; Piry et al. 1999). La significación de
los tres test fue estimada con 10,000 iteracciones en one-tailed Wilcoxon Sign Rank
test. Hemos usado el intermediate, two-phase mutation model (TPM) (Piry et al.
13
1999), porque este parámetro daba resultados más realistas en los microsatélites
estudiados en otros animales (Di Rienzo et al. 1994). El grado de las relaciones
genéticas entre individuos y poblaciones fue adicionalmente testado con FCA
(Factorial Component Analysis) usando el programa Genetix v.4.05.2
Todos los archivos fueron preparados con el programa CONVERT (v. 1.31;
Glaubitz 2004).
Resultados y discusión
El presente trabajo representa el mayor estudio de caracterización genética
del corzo español hecho hasta el momento, en lo que se refiere al número de
muestras, representatividad geográfica y los marcadores genéticos. El corzo en
España tiene una distribución genética muy marcada (norte-sur; ver Figura 4), lo
cual concuerda con la posible ruta de colonización de la Península Ibérica y con los
resultados de estudios genéticos realizados previamente sobre la especie en
España (Lorenzini et al. 2003). Hemos detectado 111 alelos de los 12 microsatélites
estudiados en las 8 poblaciones españolas de corzo analizadas. El número de
alelos por microsatélite varió entre 2 alelos (en el Roe01) y 14 alelos (en NV21) (ver
Anexo I).
Hemos identificados 28 alelos privados (ver definición en Anexo III) en las 8
poblaciones estudiadas: 12 alelos privados en la población de Asturias y el máximo
en Cádiz-Málaga con 16 alelos privados (Anexo I).
La heterocigosidad esperada no fue significativamente diferente entre las
poblaciones estudiadas (Tabla 3) con un valor medio de 0,59±0,16.
14
En total hemos detectado 111 alelos en los 12 locus usados, con una media
de 3,93±1,76.
Tabla 3. Heterocigosidad esperada por locus y por población para el corzo español.
Locus
Asturia
s Lugo Léon
Segovi
a
Guada
lajara Toledo
Ciud
ad
Real
Cádiz
Málag
a
Medi
a s.d.
Tot.
Het.
1 0,855
0,85
0
0,67
8 0,924 0,867 0,803
0,86
7 0,743
0,82
3
0,07
4 0,823
2 0,486
0,48
5
0,51
0 0,000 0,200 0,000
0,00
0 0,137
0,22
7
0,21
7 0,428
3 0,000
0,00
0
0,31
7 0,000 0,200 0,409
0,25
0 0,317
0,18
7
0,15
5 0,221
4 0,503
0,36
6
0,56
2 0,409 0,556 0,485
0,57
1 0,459
0,48
9
0,07
0 0,507
5 0,788
0,00
0
0,77
9 0,561 0,822 0,511
0,53
6 0,576
0,57
2
0,24
6 0,697
6 0,627
0,63
7
0,66
7 0,667 0,622 0,167
0,60
7 0,226
0,52
8
0,19
3 0,505
7 0,617
0,43
2
0,72
5 0,833 0,733 0,697
0,82
1 0,658
0,69
0
0,11
9 0,722
8 0,623
0,76
8
0,66
6 0,439 0,378 0,644
0,85
7 0,740
0,64
0
0,15
2 0,762
9 0,709
0,76
8
0,64
7 0,689 0,800 0,485
0,57
1 0,532
0,65
0
0,10
6 0,693
10 0,469
0,68
4
0,51
2 0,439 0,333 0,439
0,00
0 0,657
0,44
2
0,19
9 0,576
11 0,589
0,55
8
0,54
6 0,621 0,333 0,667
0,57
1 0,468
0,54
4
0,09
6 0,652
12 0,666
0,10
0
0,50
5 0,439 0,600 0,591
0,75
0 0,421
0,50
9
0,18
6 0,526
Medi
a 0,578
0,47
1
0,59
3 0,502 0,537 0,492
0,53
4 0,494
0,52
5
0,04
1 0,593
s.d. 0,207
0,28
8
0,12
0 0,273 0,232 0,216
0,28
9 0,187
0,22
7
0,05
4 0,160
15
Tabla 4. Numero de alelos por locus y población en las poblaciones del corzo
español.
Locus# Asturias Lugo León Segovia Guadalajara Toledo
Ciudad
Real
Cádiz
Málaga Media s.d. Total
1 10 7 8 8 5 5 4 10 7,125 2,147 15
2 4 2 2 1 2 1 1 3 2 1 6
3 1 1 2 1 2 2 2 2 1,625 0,484 2
4 3 2 3 2 2 2 2 2 2,25 0,433 4
5 7 0 6 4 4 3 2 10 4,5 2,915 12
6 7 3 4 3 3 2 3 3 3,5 1,414 8
7 8 4 6 5 4 4 4 6 5,125 1,364 10
8 6 4 4 3 3 4 4 8 4,5 1,581 12
9 6 4 5 3 5 2 2 7 4,25 1,714 9
10 7 6 4 3 2 3 1 9 4,375 2,546 12
11 5 4 3 3 2 3 2 5 3,375 1,111 8
12 8 2 5 3 2 3 4 9 4,5 2,5 13
Media 6 3,25 4,333 3,25 3 2,833 2,583 6,167 3,927 1,335 9,25
s.d. 2,345 1,92 1,7 1,785 1,155 1,067 1,115 2,967 1,757 0,622 3,7
Según los resultados obtenidos no parece que haya habido introducciones
significativas de corzo del norte de España en el sur, ya que las poblaciones de
Cádiz-Málaga aparecen claramente diferenciadas a nivel genético del resto de
poblaciones españolas y con valores de FST
muy próximos a 0. El valor de FST
(lo que
caracteriza la diferencia genética entre poblaciones) fue significativo con un valor
total de 0.145 (p<0.001). Las poblaciones de corzo andaluz de Cádiz-Málaga
fueron significativamente diferentes de todo el resto de corzos españoles. Respecto
a los posibles procesos de translocación de individuos de unas zonas a otras, los
valores de la tabla 5 más próximos a 0 indican escaso flujo génico (Tablas 5, 6 y 7).
16
Tabla 5. Valor de FST
(FST nos informa sobre la diversidad genética entre
poblaciones) entre las poblaciones españolas de corzo estudiadas.
Tabla 6. Significación (p value) del valor de FST
Asturias Lugo León Segovia Guadalajara Toledo CiudadReal
Cádiz-
Málaga
Asturias 0,000
Lugo 0,011 0,000
León 0,023 0,036 0,000
Segovia 0,174 0,148 0,114 0,000
Guadalajara 0,188 0,173 0,106 -0,015 0,000
Toledo 0,181 0,224 0,078 0,146 0,153 0,000
CiudadReal 0,150 0,169 0,087 0,108 0,093 0,050 0,000
Cádiz -
Málaga 0,201 0,228 0,146 0,165 0,130 0,115 0,119 0,000
Asturias Lugo León Segovia Guadalajara Toledo Ciudad Real
Cádiz-
Málaga
Asturias *
Lugo 0,315±0,031 *
León 0,000±0,000 0,045±0,015 *
Segovia 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 *
Guadalajara 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 0,810±0,023 *
Toledo 0,000±0,000 0,000±0,000 0,018±0,012 0,018±0,012 0,018±0,012 *
CiudadReal 0,000±0,000 0,000±0,000 0,009±0,009 0,081±0,016 0,108±0,037 0,252±0,048 * Cádiz-
Málaga 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 0,000±0,000 *
17
Tabla 7. Matriz de significación de FST .
(+) las dos poblaciones son
significativamente diferentes. (-) las dos poblaciones no son significativamente
diferentes y se pueden considerar como una población.
Asturias Lugo León Segovia Guadalajara Toledo
Ciudad
Real
Cádiz-
Málaga
Asturias - + + + + + +
Lugo - + + + + + +
León + + + + + + +
Segovia + + + - + - +
Guadalajara + + + - + - +
Toledo + + + + + - +
Ciudad Real + + + - - - +
Cádiz-
Málaga + + + + + + +
Los resultados de separación genética entre poblaciones fueron confirmados
por el bajo valor de los migrantes (ejemplares que han emigrado de sus
poblaciones de origen) entre poblaciones por generación de corzo. Vemos que no
suelen ser más de 3 individuos por generación los que emigran a lo largo de la
historia de colonización del corzo de la Península Ibérica. Es mas frecuente entre
poblaciones vecinas como se observa entre Guadalajara, Segovia, León, Lugo y
Asturias el número de migrantes sube a valores altos (Tabla 8).
18
Tabla 8. Numero de migrantes por generación entre cada par de poblaciones
españolas de corzo estudiadas.
Asturias Lugo León Segovia Guadalajara Toledo Ciudad Real Cádiz-Málaga
Asturias
Lugo 43,82
León 21,16 13,38
Segovia 2,37 2,88 3,89
Guadalajara 2,16 2,39 4,20 inf
Toledo 2,26 1,73 5,92 2,92 2,77
Ciudad Real 2,84 2,47 5,24 4,11 4,86 9,54
Cádiz-
Málaga 1,99 1,69 2,93 2,53 3,35 3,86 3,69
Inf: No estimable
Hemos analizado también, mediante tres tests diferentes, la posibilidad de
que hubiera habido un cuello de botella genético reciente (dentro de las últimas 5
generaciones) entre las poblaciones de corzo andaluz originario de las sierras de
Cádiz-Málaga. De acuerdo a los resultados mostrados en la tabla 9 (sólo
mostramos los resultados del Test de Wilcoxon por ser el más adecuado) podemos
concluir que: La población de corzo andaluz de Cádiz-Málaga, no pasó por un
cuello de botella genético reciente.
19
Tabla 9. Análisis de cuello de botella genético reciente en las poblaciones de corzo
andaluz de Cádiz - Málaga. Tampoco se encontraron efectos de cuello de botella
cuando se analizaron las dos poblaciones por separado.
Para examinar el potencial de nuestro kit de 12 microsatélites hemos usado
el programa Structure para agrupar las poblaciones españolas de corzo en posibles
clusters (grupos) según su similitud genética, usando el criterio de Evanno et al.
(2005). Según este método en España habría dos clusters o grupos genéticos
principales (Figura 2): uno en la mitad norte y otro en la mitad sur, dentro del cual
Cádiz-Málaga aparecen claramente en un grupo y Ciudad Real y Toledo en la zona
de transición hacia el grupo de la mitad norte (Figura 3).
Cádiz-Málaga WILCOXON TEST
Suposición: Todos los loci se ajustan al modelo de Mutaciones en Dos Direcciones, bajo el equilibrio genético de mutación-deriva.
Probabilidad (según el test unidireccional de la deficiencia de heterocigosis): ): 0.0881
Probabilidad (según el test unidireccional del exceso de heterocigosis): 0.9243
Probabilidad (según el test bidireccional del exceso o deficiencia de heterocigosis): 0.1763
20
Figura 2. Resultados del análisis de Structure de las 8 poblaciones españolas de
corzo estudiadas según el método Evanno et al. (2005). El mejor modelo indica la
presencia de dos clusters, siendo k el número de clusters, y k=2 los dos grupos
principales diferenciados por este análisis.
Según el criterio de Evanno (basado en similaridad genética) tenemos dos
clusters principales (solo considerando K=2). En la siguiente gráfica (Figura 3)
añadimos también K=3, 4 y 5, para ilustrar la eficacia del método.
21
Figura 3. Diversidad genética entre los corzos de las diferentes poblaciones
españolas estudiadas, asignados a cada cluster, cuando K=2-5 (agrupados de 2 a
5 clusters). Cada cluster o grupo viene representado por un color diferente.
K=2
K=3
K=4
K=5
K=4
K=3
K=2
22
En la Tabla 10 se muestra la proporción de la relación genética entre las
poblaciones españolas de corzo estudiadas. De esta forma el nuevo kit identifica al
corzo andaluz (de Cádiz y Málaga) a nivel de individuo con el 93,5%. A nivel
poblacional, el nuevo kit identifica las poblaciones procedente de Cádiz y Málaga al
100%.
Tabla 10. La proporción de la relación genética entre las poblaciones estudiadas
Población Grupo I Grupo II
Número de
animales
Asturias 0.084 0.916 74
Lugo 0.119 0.881 10
León 0.305 0.695 26
Segovia 0.223 0.777 6
Guadalajara 0.373 0.627 5
Toledo 0.616 0.384 6
Ciudad Real 0.453 0.547 4
Cádiz-Málaga 0.935 0.065 127
Para detallar más, podemos presentar la gráfica anterior de la semejanza
genética pero con los resultados de cada corzo analizado por separado. En el
Anexo II se resume la identidad genética individual de los corzos estudiados en
relación a su pertenencia al grupo I, “Andaluz originario de las Sierras de Cádiz-
Málaga”, o perteneciente al grupo II, “No andaluz de Cádiz-Málaga” (Tabla 10).
En la Figura 4 hemos hecho un resumen gráfico de lo descrito
anteriormente: Análisis hecho con FCA (Factorial Component Analysis) que
muestra cómo las poblaciones españolas de corzo tienen una diversidad genética
distribuida de norte a sur, donde los individuos de cada población aparecen con
un color diferente. Al igual que en la figura anterior, se observa como en el
23
extremo sur del gradiente genético aparece la población de Cádiz-Málaga,
separada del resto de poblaciones españolas.
Figura 4. Grado de las relaciones genéticas entre individuos y poblaciones testado
con FCA (Factorial Component Analysis).
Conclusiones
- El presente estudio evidencia que el corzo en España tiene una diversidad
genética con un gradiente norte a sur, corroborando los resultados de
estudios genéticos previos realizados sobre el corzo en España.
- El corzo andaluz originario de las Sierras de Cádiz-Málaga se puede
considerar como unidad genética independiente con un perfil genético
único.
- El nuevo kit desarrollado en este estudio es capaz de identificar el corzo
andaluz originario de Cádiz-Málaga al 94%, con un coste aproximado de 15
€/muestra.
Agradecimientos
El presente estudio ha sido realizado en el marco del Plan de Gestión y
Reintroducción del Corzo en Andalucía y con la colaboración de la Estación de
Referencia del Corzo Andaluz (Consejería de Medio Ambiente-Junta de Andalucía),
contando con la supervisión de Cristina San José (Agencia de Medio Ambiente y
Agua de Andalucía).
Agradecemos la colaboración de todos los titulares y guardas de cotos
privados de caza de la provincia de Cádiz que durante los diez últimos años han
facilitado la toma de muestras de corzos, sin las cuales no habría podido llevarse a
cabo este estudio. Igualmente agradecemos la colaboración en la toma de
muestras de corzos de Cádiz y Málaga al personal de la oficina del PN Los
Alcornocales, agentes de Medio Ambiente, censadores, guardas y técnicos de la
Agencia de Medio Ambiente y Agua de Andalucía, y a Eduardo Briones. La
colaboración en 2010 con el Programa de Vigilancia Sanitaria de la Fauna Silvestre
(Consejería de Medio Ambiente-Junta de Andalucía) permitió incrementar el
número de muestras de corzos originarios de las Sierras de Cádiz-Málaga,
agradecemos la colaboración del personal del PVE y de los titulares de los cotos de
caza de Cádiz y Málaga que participan en ese Programa. Igualmente, para la
obtención de muestras de corzo del resto de España se contó, en el marco del Plan
de Gestión y Reintroducción del Corzo en Andalucía, con la colaboración
desinteresada de las siguientes personas y entidades: Antonio Adán, Bruno
Álvarez, Centro de Biotecnología Animal/SERIDA/Principado de Asturias, Fernando
Terry, Granja Cinegética de Valsemana/Junta de Castilla y León, Joaquín Vela, José
Antonio Gamarra, Juan Francisco Beltrán y Patricio Herguido de Juan. La
conservación de la mayor parte de estas muestras se ha llevado a cabo en el CAD
(Centro de Análisis y Diagnóstico de la Fauna Silvestre, Consejería de Agricultura,
Pesca y Medio Ambiente, Junta de Andalucía).
Agradecemos a Joaquin Vicente (IREC, CSIC-UCLM-JCCM) y todo su equipo
por proporcionarnos un elevado número de muestras de toda España, y Ana Píriz e
Isabel Martín por la extracción de ADN. Joerns Fickel (Research group Evolutionary
Genetics, Leibniz-Institute for Zoo and Wildlife Research, Alfred-Kowalke-Str. 17, D-
10315 Berlin, Alemania) aportó las muestras procedentes de Alemania y otros
países centroeuropeos y por las enormes facilidades para llevar a cabo gran parte
de los análisis en su laboratorio. Este proyecto ha sido realizado parcialmente en el
Laboratorio de Ecología Molecular (LEM) y de Ecofisiología (LEF) de la Estación
Biológica de Doñana (CSIC), Sevilla.
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ANEXOS
ANEXO I.- Frecuencia de de cada alelo en cada una de las 8 poblaciones
estudiadas (Asturias, Lugo, León, Segovia, Guadalajara, Toledo, Ciudad Real, Cádiz-
Málaga. La columna “Total alelos privados“ nos dice si hay un alelo que solo está
en una población y no está en las demás.
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guada_ lajara Toledo
Ciudad Real
Cádiz Málaga
Total alelos
privados Población
NV21 1 158 0,101 0,125 0,042 0,167 0,200 0,083 0,333 0,066 0,085
NV21 2 160 0,109 0,063 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,033
NV21 3 162 0,130 0,000 0,479 0,083 0,000 0,000 0,167 0,384 0,281
NV21 4 164 0,000 0,063 0,021 0,000 0,100 0,000 0,000 0,000 0,006
NV21 5 166 0,000 0,000 0,042 0,000 0,200 0,000 0,000 0,000 0,008
NV21 6 168 0,239 0,313 0,063 0,083 0,000 0,000 0,000 0,095 0,134
NV21 7 170 0,051 0,000 0,000 0,083 0,200 0,333 0,333 0,037 0,052
NV21 8 172 0,007 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 Asturias
NV21 9 174 0,196 0,250 0,313 0,083 0,000 0,333 0,000 0,302 0,256
NV21 10 176 0,109 0,125 0,000 0,250 0,300 0,000 0,000 0,004 0,050
NV21 11 178 0,022 0,063 0,000 0,167 0,000 0,167 0,000 0,008 0,021
NV21 12 180 0,036 0,000 0,021 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,015
NV21 13 182 0,000 0,000 0,021 0,083 0,000 0,083 0,000 0,079 0,046
NV21 14 186 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,167 0,021 0,012
NV21 Nº
muestras 69 8 24 6 5 6 3 121 242
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
NV48 1 80 0,007 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 Asturias
NV48 2 82 0,014 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 Asturias
NV48 3 86 0,352 0,333 0,500 1,000 0,900 1,000 1,000 0,928 0,709
NV48 4 88 0,627 0,667 0,500 0,000 0,100 0,000 0,000 0,032 0,265
NV48 5 90 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,040 0,020 CádizMálaga
NV48 Nº
muestras 71 6 26 6 5 6 4 125 249
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
Roe01 1 130 1,000 1,000 0,808 1,000 0,900 0,750 0,875 0,803 0,874
Roe01 2 132 0,000 0,000 0,192 0,000 0,100 0,250 0,125 0,197 0,126
Roe01 Nº
muestras 74 1 26 6 5 6 4 127 258
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
BM4107 1 154 0,411 0,222 0,500 0,250 0,500 0,667 0,500 0,646 0,535
BM4107 2 156 0,575 0,778 0,442 0,750 0,500 0,333 0,500 0,354 0,455
BM4107 3 158 0,014 0,000 0,058 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,010
BM4107 Nº
muestras 73 9 26 6 5 6 4 127 256
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
Roe08 1 56 0,000 NA 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
Roe08 2 59 0,292 NA 0,154 0,083 0,200 0,000 0,000 0,088 0,152
Roe08 3 65 0,000 NA 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
Roe08 4 69 0,000 NA 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
Roe08 5 71 0,285 NA 0,308 0,667 0,300 0,700 0,625 0,625 0,489
Roe08 6 73 0,192 NA 0,231 0,167 0,300 0,100 0,375 0,129 0,167
Roe08 7 75 0,085 NA 0,250 0,083 0,200 0,200 0,000 0,104 0,117
Roe08 8 77 0,031 NA 0,039 0,000 0,000 0,000 0,000 0,017 0,022
Roe08 9 79 0,062 NA 0,019 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,022
Roe08 10 81 0,054 NA 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,015 Asturias
Roe08 11 89 0,000 NA 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,021 0,011 CádizMálaga
Roe08 Nº
muestras 65 NA 26 6 5 5 4 120 231
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cadiz
Malaga
Total alelos
privados Población
NV16 1 156 0,054 0,150 0,096 0,167 0,000 0,083 0,000 0,000 0,038
NV16 2 158 0,014 0,000 0,000 0,000 0,200 0,000 0,250 0,008 0,016
NV16 3 160 0,014 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 Asturias
NV16 4 166 0,466 0,500 0,250 0,333 0,200 0,000 0,125 0,120 0,254
NV16 5 168 0,392 0,350 0,500 0,500 0,600 0,917 0,625 0,872 0,655
NV16 6 172 0,007 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 Asturias
NV16 7 174 0,054 0,000 0,154 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,032
NV16 Nº
muestras 74 10 26 6 5 6 4 121 252
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
Roe05 1 121 0,035 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,010 Asturias
Roe05 2 125 0,097 0,050 0,096 0,250 0,200 0,417 0,250 0,012 0,069
Roe05 3 127 0,097 0,000 0,096 0,000 0,000 0,000 0,125 0,053 0,066
Roe05 4 129 0,132 0,050 0,135 0,333 0,500 0,083 0,375 0,508 0,327
Roe05 5 131 0,590 0,750 0,481 0,167 0,100 0,417 0,250 0,260 0,395
Roe05 6 133 0,021 0,000 0,058 0,167 0,200 0,000 0,000 0,118 0,077
Roe05 7 135 0,021 0,150 0,135 0,083 0,000 0,083 0,000 0,000 0,030
Roe05 8 137 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,049 0,024 CádizMálaga
Roe05 9 166 0,007 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 Asturias
Roe05 Nº
muestras 72 10 26 6 5 6 4 123 252
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
Haut14 1 111 0,060 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,336 0,186
Haut14 2 115 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
Haut14 3 117 0,000 0,000 0,039 0,000 0,100 0,000 0,000 0,008 0,010
Haut14 4 119 0,037 0,250 0,173 0,750 0,800 0,100 0,000 0,092 0,121
Haut14 5 121 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
Haut14 6 123 0,410 0,250 0,442 0,167 0,000 0,600 0,250 0,124 0,250
Haut14 7 125 0,455 0,350 0,346 0,000 0,100 0,000 0,250 0,344 0,353
Haut14 8 127 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,200 0,250 0,088 0,052
Haut14 9 131 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,100 0,250 0,000 0,006
Haut14 10 137 0,030 0,150 0,000 0,083 0,000 0,000 0,000 0,000 0,016
Haut14 11 168 0,008 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 Asturias
Haut14 Nº
muestras 67 10 26 6 5 5 4 125 248
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
NV30 1 155 0,130 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,040
NV30 2 157 0,253 0,150 0,280 0,300 0,000 0,333 0,000 0,653 0,440
NV30 3 159 0,041 0,250 0,000 0,000 0,000 0,000 0,500 0,141 0,098
NV30 4 161 0,000 0,000 0,040 0,000 0,400 0,000 0,000 0,004 0,014
NV30 5 163 0,000 0,000 0,040 0,000 0,100 0,000 0,000 0,012 0,012
NV30 6 165 0,452 0,350 0,520 0,500 0,300 0,667 0,500 0,153 0,313
NV30 7 167 0,082 0,250 0,120 0,200 0,100 0,000 0,000 0,033 0,068
NV30 8 169 0,041 0,000 0,000 0,000 0,100 0,000 0,000 0,000 0,014
NV30 Nº
muestras 73 10 25 5 5 6 4 121 249
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
Roe06 1 88 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,024 0,012 CádizMálaga
Roe06 2 92 0,000 0,100 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,085 0,046
Roe06 3 94 0,710 0,550 0,673 0,750 0,833 0,750 1,000 0,533 0,621
Roe06 4 96 0,149 0,150 0,115 0,083 0,167 0,167 0,000 0,215 0,175
Roe06 5 98 0,000 0,050 0,039 0,000 0,000 0,000 0,000 0,012 0,012
Roe06 6 100 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
Roe06 7 104 0,007 0,100 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,006
Roe06 8 108 0,088 0,000 0,173 0,000 0,000 0,000 0,000 0,069 0,077
Roe06 9 110 0,027 0,050 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,010
Roe06 10 112 0,014 0,000 0,000 0,167 0,000 0,000 0,000 0,008 0,012
Roe06 11 114 0,007 0,000 0,000 0,000 0,000 0,083 0,000 0,049 0,028
Roe06 Nº
muestras 74 10 26 6 3 6 4 123 252
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
Roe09 1 164 0,007 0,050 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004
Roe09 2 172 0,027 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,009 Asturias
Roe09 3 174 0,432 0,150 0,115 0,500 0,000 0,333 0,500 0,005 0,192
Roe09 4 176 0,473 0,650 0,269 0,417 0,833 0,167 0,500 0,335 0,393
Roe09 5 178 0,061 0,150 0,615 0,083 0,167 0,500 0,000 0,650 0,397
Roe09 6 180 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,005 0,002 CádizMálaga
Roe09 7 182 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,005 0,002 CádizMálaga
Roe09 Nº
muestras 74 10 26 6 3 6 4 100 229
Locus Alelo Tamaño Asturias Lugo Leon Segovia Guadalajara Toledo Ciudad
Real Cádiz
Málaga
Total alelos
privados Población
NV24 1 125 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
NV24 2 127 0,080 0,000 0,096 0,000 0,000 0,000 0,000 0,029 0,047
NV24 3 129 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
NV24 4 133 0,007 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,250 0,000 0,006
NV24 5 135 0,109 0,000 0,058 0,000 0,500 0,000 0,000 0,070 0,078
NV24 6 137 0,123 0,000 0,058 0,083 0,000 0,583 0,500 0,124 0,127
NV24 7 139 0,544 0,950 0,692 0,750 0,500 0,333 0,125 0,748 0,669
NV24 8 141 0,094 0,050 0,096 0,167 0,000 0,083 0,125 0,008 0,051
NV24 9 143 0,015 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 Asturias
NV24 10 145 0,029 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,008 Asturias
NV24 11 147 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,004 0,002 CádizMálaga
NV24 12 149 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,008 0,004 CádizMálaga
NV24 Nº 69 10 26 6 3 6 4 121 245
muestras
ANEXO II.- Identidad genética individual de los corzos estudiados de acuerdo a su
grado de pertenencia al grupo I) Andaluz originario de las Sierras de Cádiz-Málaga,
o al grupo II) No andaluz de Cádiz-Málaga.
Referencia Animal Población
Grupos
I II
AsCNP3.76 Asturias 0.034 0.966
AsCNP3.77 Asturias 0.329 0.671
AsCNP3.78 Asturias 0.396 0.604
AsCNP3.79 Asturias 0.026 0.974
AsCNP3.81 Asturias 0.130 0.870
AsCNP3.82 Asturias 0.067 0.933
AsCNP3.83 Asturias 0.379 0.621
AsP2.10 Asturias 0.153 0.847
AsP2.11 Asturias 0.054 0.946
AsP2.12 Asturias 0.118 0.882
AsP2.14 Asturias 0.019 0.981
AsP2.16 Asturias 0.058 0.942
AsP2.17 Asturias 0.018 0.982
AsP2.18 Asturias 0.044 0.956
AsP2.19 Asturias 0.034 0.966
AsP2.21 Asturias 0.139 0.861
AsP2.22 Asturias 0.075 0.925
AsP2.23 Asturias 0.029 0.971
AsP2.24 Asturias 0.029 0.971
AsP2.29 Asturias 0.026 0.974
AsP2.30 Asturias 0.026 0.974
AsP2.31 Asturias 0.377 0.623
AsP2.32 Asturias 0.075 0.925
AsP2.33 Asturias 0.024 0.976
AsP2.34 Asturias 0.077 0.923
AsP2.36 Asturias 0.130 0.870
AsP2.37 Asturias 0.061 0.939
AsP2.38 Asturias 0.067 0.933
AsP2.40 Asturias 0.024 0.976
AsP2.42 Asturias 0.482 0.518
AsP2.43 Asturias 0.019 0.981
AsP2.44 Asturias 0.220 0.780
AsP2.45 Asturias 0.040 0.960
AsP2.47 Asturias 0.047 0.953
AsP2.48 Asturias 0.018 0.982
AsP2.49 Asturias 0.023 0.977
AsP2.5 Asturias 0.027 0.973
AsP2.50 Asturias 0.035 0.965
AsP2.52 Asturias 0.242 0.758
AsP2.53 Asturias 0.050 0.950
AsP2.54 Asturias 0.014 0.986
AsP2.55 Asturias 0.040 0.960
AsP2.56 Asturias 0.061 0.939
AsP2.57 Asturias 0.023 0.977
AsP2.58 Asturias 0.195 0.805
AsP2.59 Asturias 0.015 0.985
AsP2.6 Asturias 0.052 0.948
AsP2.60 Asturias 0.116 0.884
AsP2.61 Asturias 0.018 0.982
AsP2.62 Asturias 0.020 0.980
AsP2.64 Asturias 0.124 0.876
AsP2.65 Asturias 0.064 0.936
AsP2.66 Asturias 0.035 0.965
AsP2.67 Asturias 0.049 0.951
AsP2.68 Asturias 0.027 0.973
AsP2.7 Asturias 0.023 0.977
AsP2.70 Asturias 0.271 0.729
AsP2.71 Asturias 0.062 0.938
AsP2.72 Asturias 0.081 0.919
AsP2.73 Asturias 0.070 0.930
AsP2.74 Asturias 0.121 0.879
AsP2.75 Asturias 0.034 0.966
AsP2.76 Asturias 0.025 0.975
AsP2.77 Asturias 0.035 0.965
AsP2.79 Asturias 0.026 0.974
AsP2.8 Asturias 0.050 0.950
AsP2.81 Asturias 0.029 0.971
AsP2.82 Asturias 0.015 0.985
AsP2.86 Asturias 0.038 0.962
AsP2.87 Asturias 0.024 0.976
AsP2.88 Asturias 0.023 0.977
AsP2.9 Asturias 0.024 0.976
AsP3.73 Asturias 0.023 0.977
AsViP3.74 Asturias 0.174 0.826
LuMoP3.84 Lugo 0.152 0.848
LuMoP3.85 Lugo 0.122 0.878
LuMoP3.86 Lugo 0.043 0.957
LuMoP3.88 Lugo 0.021 0.979
LuMoP3.90 Lugo 0.020 0.980
LuMoP3.91 Lugo 0.026 0.974
LuMoP3.92 Lugo 0.584 0.416
LuMoP3.93 Lugo 0.141 0.859
LuMoP3.94 Lugo 0.050 0.950
LuMoP3.95 Lugo 0.026 0.974
LeLuP3.11 Léon 0.496 0.504
LeLuP3.12 Léon 0.479 0.521
LeLuP3.13 Léon 0.599 0.401
LeLuP3.14 Léon 0.430 0.570
LeLuP3.15 Léon 0.177 0.823
LeLuP3.16 Léon 0.380 0.620
LeLuP3.17 Léon 0.304 0.696
LeLuP3.18 Léon 0.242 0.758
LeLuP3.19 Léon 0.383 0.617
LeLuP3.20 Léon 0.113 0.887
LeLuP3.21 Léon 0.115 0.885
LeLuP3.22 Léon 0.102 0.898
LeLuP3.23 Léon 0.298 0.702
LeLuP3.24 Léon 0.124 0.876
LeLuP3.25 Léon 0.244 0.756
LeLuP3.26 Léon 0.177 0.823
LeLuP3.27 Léon 0.304 0.696
LeLuP3.28 Léon 0.065 0.935
LeLuP3.29 Léon 0.804 0.196
LeLuP3.30 Léon 0.112 0.888
LeLuP3.31 Léon 0.486 0.514
LeLuP3.32 Léon 0.197 0.803
LeLuP3.33 Léon 0.092 0.908
LeLuP3.34 Léon 0.567 0.433
LeLuP3.35 Léon 0.474 0.526
LeLuP3.36 Léon 0.153 0.847
SeP2.90 Segovia 0.080 0.920
SeP2.91 Segovia 0.076 0.924
SeP2.92 Segovia 0.095 0.905
SeP2.93 Segovia 0.150 0.850
SeP3.3 Segovia 0.353 0.647
SeP3.4 Segovia 0.584 0.416
GuFAP3.5 Guadalajara 0.153 0.847
GuFAP3.7 Guadalajara 0.880 0.120
GuTPP3.8 Guadalajara 0.169 0.831
GuTPP3.9 Guadalajara 0.152 0.848
GuViP3.6 Guadalajara 0.510 0.490
ToP2.80 Toledo 0.707 0.293
ToP2.94 Toledo 0.293 0.707
ToP2.95 Toledo 0.310 0.690
ToYeP3.37 Toledo 0.838 0.162
ToYeP3.38 Toledo 0.680 0.320
ToYeP3.39 Toledo 0.868 0.132
CRP2.46 CiudadReal 0.208 0.792
CRP2.78 CiudadReal 0.580 0.420
CRP2.85 CiudadReal 0.369 0.631
CRP2.89 CiudadReal 0.656 0.344
MaAGP1.41 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
MaCFP1.14 Cádiz-Málaga 0.958 0.042
MaCFP1.23 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
MaCFP1.32 Cádiz-Málaga 0.963 0.037
MaCFP1.39 Cádiz-Málaga 0.942 0.058
MaCFP1.40 Cádiz-Málaga 0.947 0.053
MaCFP1.8 Cádiz-Málaga 0.970 0.030
MaCFP1.89 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
MaCFP1.90 Cádiz-Málaga 0.940 0.060
MaCFP1.91 Cádiz-Málaga 0.953 0.047
MaCFP1.92 Cádiz-Málaga 0.910 0.090
MaCFP1.93 Cádiz-Málaga 0.967 0.033
MaCFP1.94 Cádiz-Málaga 0.942 0.058
MaCFP1.95 Cádiz-Málaga 0.975 0.025
MaCFP1.96 Cádiz-Málaga 0.922 0.078
MaCoP1.15 Cádiz-Málaga 0.749 0.251
CaAGP1.10 Cádiz-Málaga 0.949 0.051
CaAGP1.11 Cádiz-Málaga 0.938 0.062
CaAGP1.12 Cádiz-Málaga 0.966 0.034
CaAGP1.13 Cádiz-Málaga 0.935 0.065
CaAGP1.22 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
CaAGP1.25 Cádiz-Málaga 0.960 0.040
CaAGP1.26 Cádiz-Málaga 0.801 0.199
CaAGP1.27 Cádiz-Málaga 0.968 0.032
CaAGP1.28 Cádiz-Málaga 0.953 0.047
CaAGP1.29 Cádiz-Málaga 0.966 0.034
CaAGP1.4 Cádiz-Málaga 0.962 0.038
CaAGP1.5 Cádiz-Málaga 0.927 0.073
CaAGP1.61 Cádiz-Málaga 0.951 0.049
CaAGP1.73 Cádiz-Málaga 0.968 0.032
CaAGP1.74 Cádiz-Málaga 0.982 0.018
CaAGP1.75 Cádiz-Málaga 0.969 0.031
CaAGP1.76 Cádiz-Málaga 0.979 0.021
CaAGP1.77 Cádiz-Málaga 0.984 0.016
CaAGP1.82 Cádiz-Málaga 0.972 0.028
CaAGP1.87 Cádiz-Málaga 0.842 0.158
CaAGP1.88 Cádiz-Málaga 0.982 0.018
CaAGP1.9 Cádiz-Málaga 0.970 0.030
CaBaP1.17 Cádiz-Málaga 0.976 0.024
CaBaP1.18 Cádiz-Málaga 0.949 0.051
CaBaP1.37 Cádiz-Málaga 0.967 0.033
CaBaP1.38 Cádiz-Málaga 0.951 0.049
CaBaP1.42 Cádiz-Málaga 0.855 0.145
CaBaP1.43 Cádiz-Málaga 0.976 0.024
CaBaP1.44 Cádiz-Málaga 0.814 0.186
CaBaP1.45 Cádiz-Málaga 0.962 0.038
CaBaP1.64 Cádiz-Málaga 0.939 0.061
CaBaP1.66 Cádiz-Málaga 0.963 0.037
CaBaP3.46 Cádiz-Málaga 0.797 0.203
CaBaP3.47 Cádiz-Málaga 0.604 0.396
CaBaP3.48 Cádiz-Málaga 0.924 0.076
CaBaP3.66 Cádiz-Málaga 0.976 0.024
CaBaP3.67 Cádiz-Málaga 0.975 0.025
CaBaP3.68 Cádiz-Málaga 0.966 0.034
CaBaP3.69 Cádiz-Málaga 0.774 0.226
CaBaP3.70 Cádiz-Málaga 0.939 0.061
CaBaP3.72 Cádiz-Málaga 0.955 0.045
CaBoP1.3 Cádiz-Málaga 0.972 0.028
CaGrP1.2 Cádiz-Málaga 0.938 0.062
CaGrP1.6 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
CaGrP1.62 Cádiz-Málaga 0.956 0.044
CaGrP1.78 Cádiz-Málaga 0.977 0.023
CaGrP1.79 Cádiz-Málaga 0.946 0.054
CaGrP1.80 Cádiz-Málaga 0.970 0.030
CaFJP1.35 Cádiz-Málaga 0.785 0.215
CaJFP1.1 Cádiz-Málaga 0.959 0.041
CaJFP1.24 Cádiz-Málaga 0.962 0.038
CaJFP1.30 Cádiz-Málaga 0.965 0.035
CaJFP1.31 Cádiz-Málaga 0.971 0.029
CaJFP1.34 Cádiz-Málaga 0.774 0.226
CaJFP1.57 Cádiz-Málaga 0.976 0.024
CaJFP1.58 Cádiz-Málaga 0.981 0.019
CaJFP1.59 Cádiz-Málaga 0.914 0.086
CaJFP1.60 Cádiz-Málaga 0.953 0.047
CaJFP1.68 Cádiz-Málaga 0.967 0.033
CaJFP1.69 Cádiz-Málaga 0.976 0.024
CaJFP1.7 Cádiz-Málaga 0.963 0.037
CaJFP1.70 Cádiz-Málaga 0.979 0.021
CaJFP1.81 Cádiz-Málaga 0.970 0.030
CaJFP3.40 Cádiz-Málaga 0.963 0.037
CaJFP3.41 Cádiz-Málaga 0.976 0.024
CaJFP3.42 Cádiz-Málaga 0.981 0.019
CaJFP3.43 Cádiz-Málaga 0.977 0.023
CaJFP3.44 Cádiz-Málaga 0.949 0.051
CaJFP3.45 Cádiz-Málaga 0.952 0.048
CaMSP1.46 Cádiz-Málaga 0.929 0.071
CaMSP1.47 Cádiz-Málaga 0.896 0.104
CaMSP1.48 Cádiz-Málaga 0.982 0.018
CaMSP1.49 Cádiz-Málaga 0.961 0.039
CaMSP1.50 Cádiz-Málaga 0.971 0.029
CaMSP1.65 Cádiz-Málaga 0.980 0.020
CaMSP1.67 Cádiz-Málaga 0.899 0.101
CaMSP1.83 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
CaMSP1.84 Cádiz-Málaga 0.687 0.313
CaMSP1.85 Cádiz-Málaga 0.967 0.033
CaMSP1.86 Cádiz-Málaga 0.978 0.022
CaMSP3.49 Cádiz-Málaga 0.979 0.021
CaMSP3.50 Cádiz-Málaga 0.977 0.023
CaMSP3.51 Cádiz-Málaga 0.968 0.032
CaMSP3.52 Cádiz-Málaga 0.843 0.157
CaMSP3.53 Cádiz-Málaga 0.933 0.067
CaMSP3.54 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
CaMSP3.55 Cádiz-Málaga 0.898 0.102
CaMSP3.56 Cádiz-Málaga 0.889 0.111
CaP2.1 Cádiz-Málaga 0.952 0.048
CaP2.2 Cádiz-Málaga 0.922 0.078
CaP2.27 Cádiz-Málaga 0.814 0.186
CaP2.35 Cádiz-Málaga 0.970 0.030
CaP2.39 Cádiz-Málaga 0.741 0.259
CaP2.83 Cádiz-Málaga 0.831 0.169
CaTaP1.51 Cádiz-Málaga 0.937 0.063
CaTaP1.52 Cádiz-Málaga 0.979 0.021
CaTaP1.53 Cádiz-Málaga 0.926 0.074
CaTaP1.54 Cádiz-Málaga 0.960 0.040
CaTaP1.55 Cádiz-Málaga 0.959 0.041
CaTaP3.57 Cádiz-Málaga 0.943 0.057
CaTaP3.58 Cádiz-Málaga 0.964 0.036
CaTaP3.59 Cádiz-Málaga 0.921 0.079
CaTaP3.60 Cádiz-Málaga 0.932 0.068
CaTaP3.61 Cádiz-Málaga 0.860 0.140
CaTaP3.62 Cádiz-Málaga 0.929 0.071
CaTaP3.63 Cádiz-Málaga 0.984 0.016
CaTaP3.64 Cádiz-Málaga 0.929 0.071
CaUbP1.16 Cádiz-Málaga 0.949 0.051
CaZSP1.33 Cádiz-Málaga 0.865 0.135
CaZSP1.71 Cádiz-Málaga 0.971 0.029
CaZSP1.72 Cádiz-Málaga 0.974 0.026
ANEXO III.
Definiciones y conceptos:
Un marcador genético o marcador molecular es un segmento de ADN con una ubicación física identificable (locus) en un cromosoma y cuya herencia genética se puede rastrear. Un marcador puede ser un gen, o puede ser alguna sección del ADN sin función conocida. La deriva genética es una fluctuación al azar en las frecuencias de genes en el tiempo. El resultado de la deriva suele ser la pérdida de variabilidad genética. La dirección en la cual irá la deriva genética es al azar. Los alelos raros, son generalmente, los que desaparecen de una población.
El fenómeno poblacional de "cuello de botella", se refiere normalmente a
una reducción significativa del tamaño poblacional efectivo. La magnitud de la
pérdida de variabilidad genética depende del tamaño de la población y de la tasa
de crecimiento de la misma, en consecuencia los cuellos de botella aceleran la
deriva genética.
Alelos: Un determinado gen puede tener más de una forma. Las diferentes
formas de un gen serían los alelos. Un haplotipo sería una combinación de alelos
de diferentes loci de un cromosoma que son trasmitidos juntos
Alelos privados o raros: Los alelos privados o raros son aquellos alelos que
están en muy baja frecuencia en la población, lo que indica una diferenciación
genética de la población en la que están, respecto a las demás.
FST determina la diferenciación genética entre pares de poblaciones causada por deriva (distancia genética). La comparación por pares de las frecuencias alélicas de cada población nos da una estima de la distancia genética entre las distintas poblaciones, es decir, cómo de próximas genéticamente son las distintas subpoblaciones tras la fragmentación de la población natural y que nivel de estructuración han alcanzado. También nos permite observar procesos de traslocación de individuos de unas zonas a otras por similitud en el acervo génico de las poblaciones. Valores significativamente distintos de 0 indican escaso flujo génico o interrupción del mismo conforme se acerca a 1.
