Taller: Análisis de vocalizaciones animales en...
Transcript of Taller: Análisis de vocalizaciones animales en...
![Page 1: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/1.jpg)
Taller: Análisis de
vocalizaciones animales en R
Marcelo Araya-Salas
Grace Smith Vidaurre
New Mexico State University
![Page 2: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/2.jpg)
Taller: Análisis de vocalizaciones
animales en R
Objetivo:
Entrenar a los participantes en la obtención,
procesamiento y análisis de grabaciones de
sonidos animales para poner a prueba
hipótesis sobre su ecología y evolución
![Page 3: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/3.jpg)
Taller: Análisis de vocalizaciones
animales en R
Descripción del taller:
1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica
2. Introducción al ambiente de programación R
3. Introducción a los paquete seewave, tuneR
y warbleR
4. Proyectos de investigación individuales
![Page 4: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/4.jpg)
Hora 14 de julio 15 de julio 16 de julio 17 de julio 18 de julio
8:00-9:00 Técnicas de grabación Técnicas de grabación Técnicas de grabación Técnicas de grabación
9:00-9:30 Equipo de grabación/
documentacion de grabaciones Análisis de vocalizaciones
Laboratorio IV: Loops y
funciones Proyectos: Análisis de grabaciones
9:30-10:00 El lenguaje de programacion R Análisis de vocalizaciones en R
Laboratorio V: Frases
condionales y la utilidad de la
expresión regular
Proyectos: Análisis de grabaciones
10:00-10:20 Descanso Descanso Descanso Descanso
10:20-10:50 Introducción a la programación
en R
Laboratorio I: organizar datos en
R y funciones útiles
Análisis de vocalizaciones en
R Proyectos: Análisis de grabaciones
10:50-11:20 Introducción a la programación
en R
Laboratorio II: organizar datos en
R y funciones útiles
Ejercicios de analisis de
vocalizaciones en R Proyectos: Análisis de grabaciones
11:20-11:50 Introducción a seewave y tuneR Laboratorio III: cómo crear
gráficos en R
Ejercicios de analisis de
vocalizaciones en R Preparar presentaciones
11:50-1:20 Almuerzo Almuerzo Almuerzo Almuerzo
1:20-1:50 Introducción a warbleR Análisis de vocalizaciones en R Proyectos: obtención y análisis
de grabaciones Preparar presentaciones
1:50-2:20 llegada a Palo Verde Introduccion al analisis de
sonidos en R
Ejercicios de analisis de sonido en
R
Proyectos: obtención y análisis
de grabaciones Presentación de proyectos
2:20-2:40 Descanso Descanso Descanso Descanso Descanso
2:40-3:10
Intro al taller/ Introducción a la
bioacustica: historia y
desarrollo
Introduccion al analisis de
sonidos en R
Proyectos: obtención y análisis de
datos
Proyectos: obtención y análisis
de grabaciones Presentación de proyectos
3:10-3:40 Introduccion al analisis de
sonidos
Introducción a proyectos
independientes
Proyectos: obtención y análisis de
datos
Proyectos: Análisis de
grabaciones Presentación de proyectos
3:40-4:00 Descanso Descanso Descanso Descanso Descanso
4:00-4:30 Equipo de grabación/
documentacion de grabaciones Planeamiento de proyectos
Proyectos: obtención y análisis de
datos
Proyectos: Análisis de
grabaciones Presentación de proyectos
4:30-5:00 Equipo de grabación/
documentacion de grabaciones Planeamiento de proyectos
Proyectos: obtención y análisis de
datos
Proyectos: Análisis de
grabaciones Presentación de proyectos
![Page 5: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/5.jpg)
Taller: Análisis de vocalizaciones
animales en R
Sitio web del taller:
http://marceloarayasalas.weebly.com/Taller-
analisis-de-vocalizaciones-en-R-2015.html
• Contiene las presentaciones y los ejercicios
en R
![Page 6: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/6.jpg)
Introducción a la bioacústica:
historia y desarrollo
Marcelo Araya Salas
New Mexico State University
Taller análisis de vocalizaciones
animales en R
![Page 7: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/7.jpg)
Bioacústica
• Ciencia multidisciplinaria que
combina la biología y la acústica
• Investiga la producción del sonido,
dispersión a través de un medio y
recepción en animales
![Page 8: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/8.jpg)
Historia
• Aristóteles observó aprendizaje del
canto (350 A.C.)
• Darwin especuló sobre la música y
el canto de aves como análogos
evolutivos (1871)
![Page 9: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/9.jpg)
Historia
• Ivan (Janez) Regen (1868-1947)
• Fisiología de producción y
recepción de sonidos en grillos
• Descripción del órgano timpánico
![Page 10: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/10.jpg)
Historia
• Garstand (1922), Messian (1944)
![Page 11: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/11.jpg)
Historia
• Saunders (~1920),
Marler (~1940)
![Page 12: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/12.jpg)
Invención del espectrograma
• Bell Telephone Laboratories (~1940)
![Page 13: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/13.jpg)
Invención del espectrograma
![Page 14: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/14.jpg)
Bioacústica post-espectrograma
![Page 15: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/15.jpg)
Bioacústica post-espectrograma
• Discos de cera
![Page 16: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/16.jpg)
Bioacústica post-espectrograma
• Primeras grabadoras portables (Nagra)
![Page 17: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/17.jpg)
Bioacústica post-espectrograma
![Page 18: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/18.jpg)
Bioacústica post-espectrograma
![Page 19: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/19.jpg)
Temas en bioacústica
• Micro y macro
variación del
canto
(dialectos):
![Page 20: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/20.jpg)
Temas en bioacústica
• Ontogenia del canto:
![Page 21: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/21.jpg)
Temas en bioacústica
• Ontogenia
del canto:
![Page 22: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/22.jpg)
Temas en bioacústica Ontogenia del aprendizaje:
![Page 23: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/23.jpg)
Temas en bioacústica • Versatilidad del canto:
![Page 24: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/24.jpg)
Temas en bioacústica • Evolución del canto:
![Page 25: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/25.jpg)
Temas en bioacústica • Evolución cultural:
![Page 26: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/26.jpg)
Temas en bioacústica • Selección sexual:
![Page 27: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/27.jpg)
Temas en bioacústica • Monitoreo de diversidad:
![Page 28: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/28.jpg)
Temas en bioacústica Efectos de ruido antropogénico:
![Page 29: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/29.jpg)
Temas en bioacústica Taxonomía (definición de especies):
![Page 30: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/30.jpg)
Temas en bioacústica Neurología del aprendizaje:
![Page 31: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/31.jpg)
Bioacústica
• Método que utiliza las
vocalizaciones animales para
responder preguntas en ecología y
evolución
![Page 32: Taller: Análisis de vocalizaciones animales en Rmarceloarayasalas.weebly.com/uploads/2/5/5/2/25524573/1... · Descripción del taller: 1. Teoría básica sobre acústica/bioacústica](https://reader031.fdocumento.com/reader031/viewer/2022022101/5bb331e109d3f2734f8b9723/html5/thumbnails/32.jpg)
Bioacústica en el Neotrópico
• Disponibilidad de grabaciones en
internet
• Herramientas de análisis gratuitas
• Equipo accesible
Poco estudiada
Alta diversidad
Logística
accesible Oportunidad!