Análisis de Vocalizaciones Animales
Marcelo Araya Salas New Mexico State University
Taller análisis de vocalizaciones
animales en R
Análisis de vocalizaciones
Análisis depende del tipo de pregunta:
• Estudios descriptivos:
– ¿Cuál es el comportamiento vocal de X especie?
– ¿Cómo varia el canto geográficamente?
• Estudios experimentales:
– ¿Cómo afecta el tamaño corporal la frecuencia del canto?
– ¿Qué ventaja brinda producir un repertorio largo?
– ¿Cómo afecta la estructura del hábitat los llamados?
Análisis de vocalizaciones
Análisis cuantitativos
Análisis cualitativos
Medición automática
Medición manual
Medición multivariada de elementos individuales
Inspección visual de
elementos Correlación cruzada
Descriptivo Experimental
Análisis cualitativo
A B C D
Elementos: unidades discretas mas simples que componen un canto
Análisis cualitativo
A BB B C DDD
Elementos: unidades discretas mas simples que componen un canto
Análisis cualitativo
Tipos de elementos:
• Tonos puros
• Modulados
• Trinos
• Atonales
• Armónicos
• Inflexiones
Análisis cualitativo
Sílabas: Serie de elementos que ocurren juntas en un patrón particular
Análisis cualitativo
Frases: Serie de sílabas que ocurren juntas en un patrón particular.
Tiempo (s)
Frecuencia
Amplitud • Combinaciones de 3 variables
Tiempo
Análisis cuantitativo
Análisis cuantitativo
Duración de los elementos:
Análisis cuantitativo
Tiempo entre elementos:
Análisis cuantitativo Frecuencia min y max:
min
max
Análisis cuantitativo Rango de frecuencia (max-min):
Rango
Análisis cuantitativo
Frecuencia fundamental (frecuencia mas baja en el espectro armónico)
Análisis cuantitativo
= Δ
: homogeneidad en la distribución energía
: simetría en la distribución energía
Duración
F pico
F fundamental
F modulacion
Entropía
F dominante
Asimetría
Tiempo pico
F dominante
Análisis cuantitativo
Otras caracteristicas:
# de oscilaciones/tiempo
Pendientes
Rangos de frec totales
Análisis cuantitativo
Indiv. 2 Indiv. 1
Correlación cruzada:
•Maximiza ajuste entre espectros •Valor entre 0 y 1
Corr. cruzada
1 2 3 4 1 2 3 4
1 2 3 1 2 3 4
Análisis cuantitativo
Coordinación del canto:
1 2 3 4 1 2 3 4
1 2 3 1 2 3 4
Análisis cuantitativo
Coordinación del canto:
Análisis cuantitativo Diversidad/riqueza acústica:
Análisis cuantitativo Riqueza acústica:
RA = (rank(Ht ) × rank(M))/ n2
Programas de análisis
• Syrinx (PC; www.syrinxpc.com)
• Raven (PC y Mac; www.birds.cornell.edu/brp/raven/RavenOverview.html)
• Soundruler (PC, Mac, Linux; www.soundruler.sourceforge.net)
• Avisoft (PC; www.avisoft.com)
• R: seewave, tuneR, warbleR (PC, Mac y Linux)
SYRINX Ventajas: • Gratis • Analiza tiempo y freq • Fácil de usar • Despliega grabaciones
multicanal Desventajas: • No se ajustan parámetros • No hace tablas • No muestra oscilogramas • No esta en mantenimiento
AVISOFT
Ventajas:
• Ajuste de parámetros
• Analiza tiempo y frec
• Hace tablas
• Correlación cruzada
• Ventanas múltiples
Desventajas:
• 2200 Euros
Ventajas:
• Gratis
• Especial para analizar sonidos simples y repetitivos (insectos, ranas)
• Reconocimiento automático de pulsos
• Correlación cruzada
Desventajas: • Corta los tracks • No es útil para manipular
archivos • Análisis de espectrog.
limitado • No guarda tablas
RAVEN Ventajas:
• Licencias gratis
• Se ajustan parámetros
• Guarda tablas
• Vista de espectros
• Correlación cruzada
• Detección automatica
Desventajas:
• Manipulación de imágenes
• Calidad baja de los espectrogramas
• 500 dólares (al menos)
Ventajas:
• Gratis
• Máxima flexibilidad
• Se puede hacer todo (en teoría)
• Permite producir análisis a la medida del problema
Desventajas:
• Curva de aprendizaje larga
• Lento en algunos casos
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