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Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaCentro de Investigación en Matemáticas, A.C.
Estimaciones de la Tasa de Reproducción EfectivaRt de COVID-19 para los Estados y Zonas
Metropolitanas de México
08 de Julio de 2020
Reporte realizado por:Dra. Graciela González FaríasM.en C. Domingo Iván Rodríguez González
CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA
CENTRO DE INVESTIGACIÓN EN MATEMÁTICAS, A.C.
08 de Julio de 2020
Tabla de Contenidos
1 Estimaciones de Rt en Orden Ascendente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente 5
1.2 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente 6
2 Estimaciones de Rt por Estado . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
2.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado 19
3 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Zona Metropolitana 30
4 Metodología de Estimación de Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
4.1 Metodología para la Estimación del Rt. 324.1.1 Datos de entrada para la estimación . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324.1.2 Estimación de la tasa de reproducción efectiva Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
1. Estimaciones de Rt en Orden Ascendente
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente 5
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día08 de Julio de 2020
La figura 1.1 muestra las estimaciones del Rt para los 32 estados de México, ordenados demanera ascendente. Se tomaron los datos de nuevos casos hasta el día 02 de Julio de 2020. Enverde se muestran los estados para los que el Rt estimado es menor a 1. Se incluyen los intervalosde máxima densidad del 50 % y 90 %.
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R t
Rt más reciente por EstadoRt>1Rt<=1
50%50%
90%90%
Fig. 1.1: Valor de Rt más reciente para los 32 estados de México.
6 Capítulo 1. Estimaciones de Rt en Orden Ascendente
1.2 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día08 de Julio de 2020
La figura 1.2 muestra las estimaciones del Rt para las 25 Zonas Metropolitanas con mayornúmero de casos confirmados de COVID-19, ordenadas de manera ascendente. Se tomaron los datosde nuevos casos hasta el día 02 de Julio de 2020. En verde se muestran las zonas metropolitanaspara las que el Rt estimado es menor a 1. Se incluyen los intervalos de máxima densidad del 50 %y 90 %.
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R t
Rt más reciente por Zona MetropolitanaRt>1Rt<=1
50%50%
90%90%
Fig. 1.2: Valor de Rt más reciente para las 25 Zonas Metropolitanas con mayor número de casos.
2. Estimaciones de Rt por Estado
8 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día08 de Julio de 2020
A contiuación se muestran las gráficas del comportamiento de la tasa Rt a lo largo del tiempopara los 32 estados de México. La fecha inicial se toma a partir de la cual existen datos suficientespara hacer la estimación, mientras que la fecha final corresponde al 02 de Julio de 2020, es decir, 7días anteriores de la fecha de elaboración de este reporte.
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
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(Rt)
1.24Rt más reciente
AGUASCALIENTES
2731 casos totales169 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio190.36 casos por 100mil habitantes0.99 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.85Rt más reciente
BAJA CALIFORNIA
10286 casos totales2130 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio282.98 casos por 100mil habitantes3.74 % de casos a nivel nacional
9
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
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1.0
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(Rt)
1.30Rt más reciente
BAJA CALIFORNIA SUR
1937 casos totales93 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio240.71 casos por 100mil habitantes0.70 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.85Rt más reciente
CAMPECHE
2606 casos totales257 defunciones totales
2020-03-08 fecha de inicio260.44 casos por 100mil habitantes0.95 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
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3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.03Rt más reciente
COAHUILA
6484 casos totales318 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio201.45 casos por 100mil habitantes2.36 % de casos a nivel nacional
10 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.25Rt más reciente
COLIMA
757 casos totales83 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio96.41 casos por 100mil habitantes0.28 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.79
Rt más reciente
CHIAPAS
5050 casos totales720 defunciones totales
2020-02-29 fecha de inicio88.13 casos por 100mil habitantes1.84 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
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2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.92Rt más reciente
CHIHUAHUA
3552 casos totales701 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio93.44 casos por 100mil habitantes1.29 % de casos a nivel nacional
11
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
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(Rt)
1.00Rt más reciente
CIUDAD DE MÉXICO
54405 casos totales6021 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio603.25 casos por 100mil habitantes19.78 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
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(Rt)
1.03Rt más reciente
DURANGO
2447 casos totales169 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio130.93 casos por 100mil habitantes0.89 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
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3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.09Rt más reciente
GUANAJUATO
10295 casos totales479 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio165.30 casos por 100mil habitantes3.74 % de casos a nivel nacional
12 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
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3.0
4.0
5.0
6.0
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(Rt)
0.87Rt más reciente
GUERRERO
6734 casos totales1039 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio184.14 casos por 100mil habitantes2.45 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
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6.0
7.0(R
t)1.06
Rt más reciente
HIDALGO
4515 casos totales718 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio146.29 casos por 100mil habitantes1.64 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
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3.0
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5.0
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(Rt)
1.08Rt más reciente
JALISCO
8274 casos totales909 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio98.39 casos por 100mil habitantes3.01 % de casos a nivel nacional
13
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
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3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.70Rt más reciente
MÉXICO
40087 casos totales6304 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio230.02 casos por 100mil habitantes14.58 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
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(Rt)
0.62Rt más reciente
MICHOACÁN
6642 casos totales540 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio137.65 casos por 100mil habitantes2.42 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
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(Rt)
1.00Rt más reciente
MORELOS
3232 casos totales712 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio158.12 casos por 100mil habitantes1.18 % de casos a nivel nacional
14 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.27Rt más reciente
NAYARIT
2141 casos totales229 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio166.15 casos por 100mil habitantes0.78 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
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4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.99
Rt más reciente
NUEVO LEÓN
8428 casos totales467 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio150.23 casos por 100mil habitantes3.06 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
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2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.65Rt más reciente
OAXACA
6924 casos totales682 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio167.10 casos por 100mil habitantes2.52 % de casos a nivel nacional
15
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
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3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.52Rt más reciente
PUEBLA
12841 casos totales1583 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio194.43 casos por 100mil habitantes4.67 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.11Rt más reciente
QUERÉTARO
2290 casos totales319 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio100.45 casos por 100mil habitantes0.83 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.10Rt más reciente
QUINTANA ROO
4570 casos totales660 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio265.20 casos por 100mil habitantes1.66 % de casos a nivel nacional
16 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.07Rt más reciente
SAN LUIS POTOSÍ
3978 casos totales232 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio138.79 casos por 100mil habitantes1.45 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.61
Rt más reciente
SINALOA
9526 casos totales1502 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio301.77 casos por 100mil habitantes3.46 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.55Rt más reciente
SONORA
10421 casos totales1034 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio338.92 casos por 100mil habitantes3.79 % de casos a nivel nacional
17
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.75Rt más reciente
TABASCO
13255 casos totales1250 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio515.30 casos por 100mil habitantes4.82 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.48Rt más reciente
TAMAULIPAS
8013 casos totales508 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio219.50 casos por 100mil habitantes2.91 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.95Rt más reciente
TLAXCALA
3093 casos totales431 defunciones totales
2020-03-23 fecha de inicio224.13 casos por 100mil habitantes1.12 % de casos a nivel nacional
18 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.76Rt más reciente
VERACRUZ
12739 casos totales1879 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio149.17 casos por 100mil habitantes4.63 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.33Rt más reciente
YUCATÁN
5538 casos totales530 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio245.14 casos por 100mil habitantes2.01 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.31Rt más reciente
ZACATECAS
1212 casos totales128 defunciones totales
2020-03-16 fecha de inicio72.73 casos por 100mil habitantes0.44 % de casos a nivel nacional
2.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado 19
2.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día08 de Julio de 2020
La figura 2.1 muestra la tasa de crecimiento (Rt ∗ I) a lo largo del tiempo, es decir, los casosnuevos esperados por día para la tasa Rt estimada y el número de casos nuevos registrados ese día(I). Se muestra la comparación con la curva nacional (obtenida a partir de los datos por Estado)para observar la contribución de cada uno de los Estados a la tasa de crecimiento nacional.
NACIONAL
CIUDAD DE MÉXICOYUCATÁN
●
●●
0
2000
4000
6000
8000
Feb 27 Mar 12 Mar 26 Apr 09 Apr 23 May 07 May 21 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
Cas
os N
uevo
s E
sper
ados
(R
t*I)
Estado
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NACIONAL
CIUDAD DE MÉXICO
YUCATÁN
GUANAJUATO
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NUEVO LEÓN
JALISCO
MÉXICO
QUINTANA ROO
AGUASCALIENTES
SAN LUIS POTOSÍ
TABASCO
NAYARIT
ZACATECAS
VERACRUZ
HIDALGO
BAJA CALIFORNIA SUR
BAJA CALIFORNIA
MORELOS
QUERÉTARO
COLIMA
GUERRERO
DURANGO
TLAXCALA
PUEBLA
OAXACA
CHIAPAS
MICHOACÁN
CAMPECHE
CHIHUAHUA
TAMAULIPAS
SINALOA
SONORA
Tasas de Crecimiento por Estado (Rt*I)
Fig. 2.1: Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado.
3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
21
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día08 de Julio de 2020
A contiuación se muestran las gráficas del comportamiento de la tasa Rt a lo largo del tiempopara las 25 Zonas Metropolitanas con mayor número de casos de COVID-19. La fecha inicial setoma a partir de la cual existen datos suficientes para hacer la estimación, mientras que la fechafinal corresponde al 02 de Julio de 2020, es decir, 7 días anteriores de la fecha de elaboración deeste reporte.
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.90Rt más reciente
Valle de México
85807 casos totales11108 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio391.05 casos por 100mil habitantes31.20 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.59Rt más reciente
Puebla
10964 casos totales1289 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio344.87 casos por 100mil habitantes3.99 % de casos a nivel nacional
22 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.02Rt más reciente
Monterrey
7823 casos totales449 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio152.38 casos por 100mil habitantes2.84 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.93
Rt más reciente
Villahermosa
7009 casos totales650 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio788.53 casos por 100mil habitantes2.55 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.75Rt más reciente
Toluca
6253 casos totales927 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio262.97 casos por 100mil habitantes2.27 % de casos a nivel nacional
23
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.04Rt más reciente
Guadalajara
6039 casos totales679 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio115.18 casos por 100mil habitantes2.20 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.89Rt más reciente
Mexicali
5707 casos totales1014 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio524.79 casos por 100mil habitantes2.08 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
León
5293 casos totales250 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio281.45 casos por 100mil habitantes1.92 % de casos a nivel nacional
24 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.85Rt más reciente
Veracruz
4310 casos totales607 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio450.62 casos por 100mil habitantes1.57 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)1.05
Rt más reciente
La Laguna
4081 casos totales221 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio279.00 casos por 100mil habitantes1.48 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
Acapulco
4005 casos totales564 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio435.46 casos por 100mil habitantes1.46 % de casos a nivel nacional
25
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.33Rt más reciente
Mérida
3912 casos totales362 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio316.07 casos por 100mil habitantes1.42 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.79Rt más reciente
Oaxaca
3892 casos totales310 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio556.95 casos por 100mil habitantes1.42 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.80Rt más reciente
Tijuana
3418 casos totales1001 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio169.94 casos por 100mil habitantes1.24 % de casos a nivel nacional
26 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.84Rt más reciente
Hermosillo
3312 casos totales192 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio350.09 casos por 100mil habitantes1.20 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.85
Rt más reciente
Culiacán
3276 casos totales581 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio340.23 casos por 100mil habitantes1.19 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.98Rt más reciente
Cancún
2560 casos totales499 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio295.01 casos por 100mil habitantes0.93 % de casos a nivel nacional
27
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.74Rt más reciente
Reynosa
2537 casos totales185 defunciones totales
2020-03-16 fecha de inicio309.44 casos por 100mil habitantes0.92 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.88Rt más reciente
Tuxtla Gutiérrez
2342 casos totales300 defunciones totales
2020-02-29 fecha de inicio260.15 casos por 100mil habitantes0.85 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.23Rt más reciente
Aguascalientes
2243 casos totales154 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio196.11 casos por 100mil habitantes0.82 % de casos a nivel nacional
28 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.86Rt más reciente
Juárez
2227 casos totales544 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio152.02 casos por 100mil habitantes0.81 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.85
Rt más reciente
Tampico
2062 casos totales95 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio210.31 casos por 100mil habitantes0.75 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.16Rt más reciente
Querétaro
1908 casos totales251 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio129.08 casos por 100mil habitantes0.69 % de casos a nivel nacional
29
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.98Rt más reciente
Tlaxcala-Apizaco
1802 casos totales203 defunciones totales
2020-03-23 fecha de inicio307.14 casos por 100mil habitantes0.66 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 14 Mar 28 Apr 11 Apr 24 May 08 May 22 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.10Rt más reciente
San Luis Potosí
1728 casos totales115 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio140.87 casos por 100mil habitantes0.63 % de casos a nivel nacional
30 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
3.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Zona Metropolitana
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día08 de Julio de 2020
La figura 3.1 muestra la tasa de crecimiento (Rt ∗ I) a lo largo del tiempo para Zonas Metropo-litanas, es decir, los casos nuevos esperados por día para la tasa Rt estimada y el número de casosnuevos registrados ese día (I). Se muestra la comparación con la curva nacional (obtenida a partirde los datos por Estado) para observar la contribución de cada una de las Zonas Metropolitanas a latasa de crecimiento nacional.
NACIONAL
Valle de México
Mérida
●
●
●0
2000
4000
6000
8000
Feb 27 Mar 12 Mar 26 Apr 09 Apr 23 May 07 May 21 Jun 04 Jun 18 Jul 02Fecha
Cas
os N
uevo
s E
sper
ados
(R
t*I)
ZM
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
NACIONAL
Valle de México
Mérida
Monterrey
Guadalajara
La Laguna
León
Aguascalientes
Villahermosa
Querétaro
San Luis Potosí
Puebla
Acapulco
Mexicali
Veracruz
Cancún
Tlaxcala−Apizaco
Tuxtla Gutiérrez
Oaxaca
Toluca
Tampico
Culiacán
Tijuana
Hermosillo
Reynosa
Juárez
Tasas de Crecimiento por Zona Metropolitana (Rt*I)
Fig. 3.1: Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Zona Metropolitana.
4. Metodología de Estimación de Rt
32 Capítulo 4. Metodología de Estimación de Rt
4.1 Metodología para la Estimación del Rt.A continuación se resume la metodología utilizada para estimar el valor de la tasa de repro-
ducción Rt cada día por Estados y Zonas Metropolitanas de la República Mexicana. La cual estábasada en la propuesta del sitio Estimating COVID-19’s Rt in Real-Time [1], que estima los valoresde Rt para los Estados Unidos de América.
Esta tasa de reproducción es una medida de la rapidez con la que se trasmite la enfermedadCOVID-19, pues se refiere al número promedio de personas que son infectadas por una personainfecciosa. Si el valor de Rt es superior a 1.0, la enfermedad continúa su expansión, mientras quesi es menor a 1.0 la expansión se está deteniendo.
4.1.1 Datos de entrada para la estimaciónLos datos a partir de los cuáles se estiman los valores de Rt corresponden a la información
oficial provista por el Gobierno de México, a través de su portal de acceso abierto, respecto a loscasos confirmados de COVID-19 en el país (ver el sitio).
Mediante estos datos se determina la serie de nuevos casos confirmados por día para cada unode los estados, tomando como fecha el día de presentación de los síntomas de cada individuo. Sedescartan los datos correspondientes a los últimos 7 días. La siguiente gráfica muestra los nuevoscasos diarios para la Ciudad de México hasta el 26 de abril.
4.1.2 Estimación de la tasa de reproducción efectiva Rt
Se estima la probabilidad a posteriori P (Rt|k) utilizando el Teorema de Bayes, donde t es eldía y k es el número de casos nuevos de COVID-19 en ese día:
P (Rt|k) =P (k|Rt) · P (Rt)
P (k)(4.1)
4.1 Metodología para la Estimación del Rt. 33
La probabilidad a priori P (Rt) se calcula a partir de la probabilidad a priori del día anteriorP (Rt−1), asumiendo que P (Rt|Rt−1) sigue una distribución normal centrada en Rt−1, es decirN(Rt−1, σ).
Para la verosimilitud P (k|Rt) se propone una distribución Poisson:
P (k|Rt) =λke−λ
k!(4.2)
con parámetro λ = kt−1eγ(Rt−1), que depende del número de casos nuevos del día anterior y del
parámetro γ = 1/7, pues el invervalo serial es de 7 días.
Para estimar la posterior P (Rt|k) del día t, se fija k, pues se conoce el número de nuevoscasos en el día t, y se varía Rt en un rango propuesto entre 0 y 12. Se repite el proceso de maneraiterativa para calcular la probabilidad posterior para cada día de la serie. La siguiente figura muestralas posteriores diarias obtenidas para la Ciudad de México.
Finalmente para cada día se calculan los intervalos de máxima densidad (HDI) para el 50 %y el 90 %, así como el valor de máxima verosimilitud (ML), a partir de la posterior P (Rt|k). Lasiguiente tabla muestra los valores estimados para 5 días de la Ciudad de México.
Referencias
[1] Systrom K. (2020). Estimating COVID-1’s Rt in Real-Time. Del sitio https://github.com/k-sys/covid-19/blob/master/Realtime%20R0.ipynb
[2] Systrom K., Vladeck T. & Krieger M. (2020). Rt Covid-19. Del sitio https://rt.live/