ENLACES A PROGRAMAS

- Bsqueda papers y artculos cientficos: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

- Glosario a modo de diccionario del NCBI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21106/

- Base de datos Uniprot: http://www.uniprot.org/

Podemos buscar la secuencia de una protena de un determinado organismo y tambin

podemos buscar protenas de la misma familia poniendo en la bsqueda el nombre de dicha

familia.

- Base de datos NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

- Alineamiento simple de dos secuencias: http://emboss.bioinformatics.nl/cgi-

bin/emboss/dotmatcher

- Implementacin de algoritmo de Needleman & Wunsch:

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_P

ROG_DEF=blastn&BLAST_SPEC=GlobalAln&LINK_LOC=BlastHomeLink

- Mapa de restriccin de un vector de clonacin:

http://www.bioinformatics.org/sms2/rest_map.html

- Herramienta para ver lo que es vector de clonaje y lo que es injerto:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/vecscreen/

- Traducir una secuencia de aminocidos en sus 6 marcos de lectura posibles:

http://web.expasy.org/translate/

- Bsqueda de homologas de distintas secuencias o protenas (tambin bsqueda de

homlogos remotos): https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

- Bsqueda de dominios/motivos en protenas: http://prosite.expasy.org/ o

http://pfam.xfam.org/ o http://www.ebi.ac.uk/interpro/

- Para realizar alineamientos mltiples: (crustalW) http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

o (crustalOmega) http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/ o (muscle)

http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/ Leyenda:

- Comparar genomas: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/taxik2.cgi?isbact=1

- Visualizar genomas (comparar los cromosomas de dos especies etc):

http://www.ensembl.org/index.html

- Punto isoelctrico y peso molecular de una protena: http://web.expasy.org/compute_pi/

- Prediccin de pptido seal: http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

Podemos encontrar otras especies y otros individuos que posean los dominios buscados.

Domain organisation: muestra protenas con ese dominio. Species: se ven las especies que

tienen ese dominio (das a Control+F y buscas la especie que deseas)

. coincidencia; : coincidencia alta; * coincidencia exacta