Modelado 3D de la proteína DHH silvestre y de sus mutacionesDr. Gerardo Cobos SalcedoTutor: Dra. Patricia Canto

Introducción

Desert Hedgehog (DHH). Localizado en 12q12→q13.1, y se

compone de 3 exones y codifica una proteína de 396 aminoácidos.

Es expresado en las células de Sertoli y en las células de Schwann en los nervios periféricos.

Introducción

Hay diferentes antecedentes sobre la importancia que tiene Dhh en la morfología testicular (Clark et al1) o en su función. (Hung Chang et al2)

En el año 2000, Umehara et al reportó una mutación sin sentido en un paciente 46,XY con disgenesia gonadal parcial.

1. Clark AM, Garland KK, Russell LD 2000 Desert hedgehog (Dhh) gene is required in the mouse testis for formation of adult-type Leydig cells and normal development of peritubular cells and seminiferous tubules. Biol Reprod 63:1825–1838

2. Hung-Chang Yao H, Whoriskey W, Capel B 2002 Desert hedgehog/Patched 1 signaling specifies fetal Leydig cell fate in testis organogenesis. Genes Dev 16:1433–1440

3. Umehara F, Tate G, Itoh K, Yamaguchi N, Douchi T, Mitsuya T, Osame M2000Anovel mutation of desert hedgehog in a patient with 46,XY partial gonadal dysgenesis accompanied by

minifascicular neuropathy. Am J Hum Genet 67:1302–1305

Introducción

En el año 2004, Canto et al4 reportó dos mutaciones en 3 pacientes. Mutación homocigótica en el exón 2, substitución de T-

por-C en la posición 485. Esta mutación era responsable del cambio de una leucina (CTG) por una prolina (CCG) en el codón 162.

Deleción de un nucleótido en el exon 3, en la posición 1086, la cual compromete al tercer nucleotido (guanina) del codón 362. Esta delesión origina un codón de paro (TAG).

4. P. CANTO, D. SÖDERLUND, E. REYES, Mutations in the Desert hedgehog (DHH) Gene in Patients with 46,XY Complete Pure Gonadal Dysgenesis, The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism 89(9):4480–4483

Introducción

Que es un modelo 3D

Es un grupo de fórmulas matemáticas que describen un "mundo" en tres dimensiones.

Representación esquemática visible a través de un conjunto de objetos, elementos y propiedades que, una vez procesados, se convertirán en una imagen en 3D o una animación 3D.

Introducción

Usos de modelos 3D en medicina. Moldeos de proteínas. Modelos anatómicos. Operaciones robóticas. Diseño de farmacos.

Objetivos

Crear los modelos tridimensionales de las proteínas y las mutaciones.

Validar los modelos.

Buscar diferencias, y describir a detalle las mismas.

Justificación

La idea se crea de una mutación encontrada en un paciente con disgenesia gonadal.

Es una proteína no estudiada, por lo que a través de modelos se pretende inferir sus características y funcionamiento.

Los modelos moleculares son una herramienta vital para la investigación.

Presentar al usuario de una forma sólida un objeto abstracto.

Metodología

Obtención de modelo molecular o la secuencia de proteínas a través del PDB ID.

Metodología

Creación de los mapas del gen silvestre. Validación del modelo. Búsqueda y creación de mapa de diferencias.

Metodología

Modificación del mapa para crear las mutaciones.

Análisis de los Resultados

Se utilizará HyperProtein 1.0.4 y Bio CHEM 2009 para la creación de los modelos.

Para el análisis de los modelos se usa HyperChem Proffessional 8.0.6.

Maya 3D Modeling 2009 para la animación.

Avances

Se han creado 15 modelos de la proteína silvestre, así como de las proteína con sus mutaciones.

Los 15 modelos han sido enviados para validación.