Preparaduria de Proteinas-Presentacion

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  • 8/18/2019 Preparaduria de Proteinas-Presentacion

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    Tema 2

    Prep. Omar E Vitale De S

    Universidad de CaraboboFacultad de Ciencias de la Salud

    Escuela de Medicina“Dr. Witremundo Torrealba"Departamento de Fisiología y Bioquímica

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    CONTENIDO1. Características Generales.

    2. Configuración y Conformación.

    3.  Aminoácidos.

    4. El pH y los Aminoácidos.5. Titulación de un aminoácido.

    6. Enlace Peptídico.

    7. Clasificación de las Proteínas.

    8. Niveles estructurales de las Proteínas.9. Estructura Secundaria

    10. Estructura Terciaria

    11. Desnaturalización y Renaturalización

    12. Mioglobina y Hemoglobina.

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    CARACTERISTICAS GENERALES

    Son largos polímeros de aminoácidos.

    Las macromoléculas mas abundantes.

    Presentes en todas partes.

    Dependiendo de su secuencia de aminoácidos es el tipo deproteínas.

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    ISOMERÍA

    Es una propiedad de ciertos compuestos químicos que conigual fórmula química presentan estructuras molecularesdistintas y, por ello, diferentes propiedades.

    Existen dos tipos:

    Isomería Estructural

    Isomería Espacial o

    Estereoisomería.

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    Isomería

    Estructural oConstitucionales

    Espacial oEstereoisometría

    Conformacional

    Configuracional

    Optica

    Enantiomeros

    Diasteroisomeros

    Geometrica

    DIAGRAMA

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    ESTEREOISOMERÍA

    Es otra propiedad de ciertas moléculas que tienen fórmulasmoleculares idénticas y sus átomos presentan la mismadistribución pero su disposición en el espacio es distinta.

    Esta a su vez puede ser:

     Isomería Conformacional :

    Son Interconvertibles.

     Isomería Configuracional :

    No son interconvertibles.

    http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/76/Ethane_conformation.gif

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    No basta una simple rotación para convertir una forma enotra y aunque la disposición espacial es la misma, losisómeros no son interconvertibles.

    Se subdividen también a su ves en:

    Isomeria geométrica o cis-trans

    Isomeria óptica

    ISOMERÍA CONFIGURACIONAL

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    ISOMERÍA GEOMETRICA O CIS-TRANS

    Se produce cuando hay dos carbonos unidos con dobleenlace que tienen las otras valencias con los mismossustituyentes o con dos iguales y uno distinto.

    Presentan dos formas posibles: Forma cis (o forma Z).

    Forma trans (o forma E).

    http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/ab/Cis-trans.svg

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    ISOMERÍA OPTICA

    Cuando un compuesto tiene al menos un átomo de Carbono asimétricoo quiral .

    Se pueden reconocer 2 compuestos: los Enantiómeros y los Diastómeros

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    ISOMERÍA OPTICA

    Si una pareja de estereoisómerosson imagen especular uno del otroson llamados: Enantiómeros.

    Si una pareja de estereoisómeros noson imagen especular uno del otroson llamados: Diastereómeros.

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    FORMULA GENERAL

    Esta formado por un carbono α al cual están unidos:

    Un grupo Carboxilo (COOH)

    Un grupo Amino (NH2)

    Un Hidrogeno (H)

    Un grupo Radical o grupo R 

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    FORMULA GENERAL

    Los carbonos adicionales en un Grupo R, se denominancomúnmente en base al Alfabeto Griego.

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    ESTEREOISOMERÍA DE LOS AMINOÁCIDOS

    Los 4 grupos diferentes pueden tomar dos ordenamientos distintos:Estereoisomeros.

    Son imágenes especulares no superponibles: Enantioméros.

    Los aminoácidos de las proteínas se presentan en Esteroisómeros L

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    CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

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    CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

    Grupo R Apolares Alifático

    Grupo R Aromático

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    CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

    Grupo R Polares sin Carga

    Grupo R Cargados Positivamente

    Grupo R Cargados Negativamente

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    Cuando un aminoácido se disuelve en agua, se encuentraen forma de Ion dipolar o Zwitterion.

    EL pH Y LOS AMINOÁCIDOS

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    Un Zwitterion puede actuar como acido:

    O puede actuar como una base:

    Los compuestos con esta propiedad son llamados Anfólitos.

    EL pH Y LOS AMINOÁCIDOS

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    El Grupo R de algunos aminoácidos presentan grupos

    Ionizables: Carboxilo (COO-)

     Amino(NH3+)

    Sulfidrilo (SH)

    Fenol (OH)

    GRUPOS IONIZABLES

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    PUNTO ISOELÉCTRICO

    Es el pH característico en el que la carga eléctrica neta es cero.

    pK: Es el pH en el cual las concentraciones del donador deprotones y el aceptor de protones son iguales.

    H+H+

    H2

    H

    CargaNeta:

    0+1 -1

    pH: 1 pH: 7 pH: 14

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    AMINOÁCIDO CON GRUPO R SIN CARGA

    CargaNeta: 0+1 -1

    pI: pK1 + pK2

    2

    pI: 2,34 + 9,60 = 5,97

    2

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    AMINOÁCIDO CON GRUPO R CARGADO POSITIVO

    CargaNeta:

    0+1 -1

    pI: pKR + pK2

    2

    pI: 6,0 + 9,17 = 7,58

    2

    +2

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    AMINOÁCIDO CON GRUPO R CARGADO NEGATIVO

    pI: 2,19 + 4,25 = 3,22

    2

    CargaNeta: 0+1 -1

    pI: pK1 + pKR

    2

    -2

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    ENLACE PEPTIDICO

    Es el enlace covalente formado por dos aminoácidoscon la eliminación de una molécula de agua.

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    RESIDUOS DE AMINOACIDOS

     Así son llamadas las unidades de aminoácidos queforman un péptido.

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    NOMENCLATURA

     Alanil glutamil

    Tetra péptido

    Los péptidos se nombran

    iniciando por el residuoN-terminal, concluyendocon el sufijo “IL” cadaresiduo, hasta culminar

    en el residuo C-Terminalcon el nombre delaminoácido completo.

    glicil -lisina

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    CLASIFICACIÓN SEGÚN SU COMPOCISIÓN

    Simples: Son aquellas compuestas exclusivamente por Aminoácidos.

    Complejas: Son aquellas compuestas por aminoácidos y poseen

    otros componentes orgánicos o inorgánicos.

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    NIVELES ESTRUCTURALES

    Plegado Local Plegado Global

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    ESTRUCTURA SECUNDARIA

    Conformación local de algunas partes delpolipéptido.

    Las estructuras secundarias mas habitualesson las conformaciones en Hélice alfa yConformación en beta.

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    HELICE ALFA

    Estabilidad:

    Puentes de H2

    Restricciones:

    Carga Eléctrica

     Volumen

    Pro Gly 

    Extremos

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    HELICE ALFA

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    CONFORMACIÓN BETA

    Es una conformación mas extendida, en la cual el esqueletode la cadena proteica esta extendido en zigzag.

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    GIROS BETA

    Esta estructura forma un giro cerrado de 180° en el queparticipan 4 aminoácidos.

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    CLASIFICACIÓN SEGÚN SU FORMA

    Proteínas Fibrosas:

    Presentan cadenas polipeptídicas dispuestas en largas

    hebras. Constan mayoritariamente de un grupo únicode estructura secundaria.

    Proteínas Globulares:

    Presentan cadenas polipeptídicas dispuestas en formaglobular o esférica. Contienen a menudo varios tiposde estructura secundaria.

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    ESTRUCTURAS TERCIARIAS

    Las mas representativas tenemos:

    alfa-queratina

    Colágeno

    Fibroína de seda

    Estas proteínas comparten propiedades como fuerza,

    elasticidad o ambas cosas.

    Todas las proteínas fibrosas son insolubles en agua.

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    COLÁGENO

    Se encuentra en los tendones, cartílagos, matriz orgánicade los huesos y cornea del ojo.

    La hélice de Colágeno es única, distinta a la alfa- helice.

    Es Levógira y tiene tres residuos aminoácidos por vuelta.

    Esta formada por tres cadenas polipeptídicas separadasllamadas cadenas alfas, que están superenrolladas unaalrededor de la otra.

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    COLÁGENO

    La secuencia suele ser el Tripéptido Gly-X-Y 

    “X” suele ser Prolina y “Y” suele ser Hidroxiprolina.

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    APLICACIONES CLINICAS

    Osteogénesis Imperfecta

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    APLICACIONES CLINICAS

    Síndrome de Ehlers-Danlos

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    APLICACIONES CLINICAS

    Escorbuto

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    Desnaturalización: Perdida de la

    estructura tridimensional de unaproteína. Esta es suficiente para que estapierda su función.

     Agentes Desnaturalizantes:

    Calor

    pH extremo

    Solutos como la Urea

    Disolventes como el alcohol

    Renaturalización: Es el proceso medianteel cual una proteína desnaturalizada,recupera su conformación nativa y suactividad biológica.

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    OXIGENO

    El Oxigeno no es muy soluble enagua. Ninguno de las cadenaslaterales de los aminoácidos estapreparado para su unión.

    Este papel es desempeñado porciertos metales de transición(hierro y cobre).

    El hierro suele estar unido a unGrupo Prostético llamado GrupoHemo.

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    MIOGLOBINA

    Proteína de unión al Oxigeno relativamente simple.

    Costa de un único polipéptido de 153 aminoácidos con un

    grupo Hemo. Mr 16.700.

    Nivel Estructural Terciario.

    Su principal función es la

    de Almacén del Oxigeno.

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    MIOGLOBINA

    La unión del Oxigeno y la Mioglobina describe una curva hiperbólica.

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    HEMOGLOBINA

    Proteína de unión al Oxigeno un poco mas compleja.

    Es Tetramérica, con dos cadenas alfas (141 aa cada una) y

    dos cadenas betas (146 aa cada una).

    Nivel Estructural Cuaternario.

    Su principal función es el

    Transporte del Oxigeno.

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    COOPERATIVISMO

    La unión del Oxigeno a la Hemoglobina produce uncambio conformacional.

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    COOPERATIVISMO

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    COOPERATIVISMO

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    HEMOGLOBINA

    La unión del Oxigeno y la Hemoglobina describe una curva sigmoidea.

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    PROPIEDADES ALOSTERICAS

    Una Proteína Alostérica es aquella en la que la unión deun ligando a un sitio, afecta a las propiedades de unión deotro ligando a otro sitio de la misma proteína.

    Efecto Borh:

    CO2

    H+

    2,3-Bifosfoglicerato (BPG)

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    ANEMIA FALCIFORME

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