Propuesta de Creación Maestría en Bioinformática

Agosto de 2012

GRUPO GESTOR

Sede Bogotá:

Emiliano Barreto, IBUNLuis Fernando Niño, Departamento de Ingeniería de Sistemas e IndustrialLuz Mary Salazar, Departamento de QuímicaEdgar Reyes, Departamento de Química

Auxiliares:Juan Felipe Ortiz

Angélica Sandoval

Antecedentes

Justificación

Plan de estudios

Administración

AGENDA

Biotecnología: Desarrollo de tecnologías basadas en sistemas vivos

Ciencias Biomédicas / Ing. Biomédica / Bioingeniería: Estudio de los seres humanos y desarrollo de tecnologías para la solución de problemas en salud

Bioinformática: conocimiento de los sistemas vivos a través de tecnologías informáticas

JUSTIFICACIÓN

1. Koch & Fuellen, 2008 | 2. Counsell, 2002 | 3. Zatz, 20022. 4. Neishich, 2007 | 5. Palacios, Collado, 2007

País Programas de pregrado Programas de posgrado

Alemania1 14 17

Reino Unido2 5 19

Estados Unidos3 4 27

Brasil4 0 2

México5 1 1

CONTEXTO INTERNACIONAL

Empresas e institutos con posibles campos de acción para la Bioinformática

EMPRESASOMISCO: empresa privada. Forma parte de Parquesoft en Cali.

INSTITUTOS CIAT: Centro Internacional de Agricultura Tropical ICA: Instituto Colombiano Agropecuario Cenicafé: Centro Nacional de Investigación en Café FIDIC: Fundación Instituto de Inmunología de Colombia INS: Instituto Nacional de Salud. CBIB: Centro de Bioinformática IBUN LAMFU: Laboratorio de Micología y Fitopatología de la Universidad de los Andes GeBiX: Centro Colombiano de Genómica y Bioinformática de Ambientes Extremos

Centro Colombiano de BioinformáticaCentro Colombiano de Secuenciación Centro de Investigaciones BiológicasInstituto de Biotecnología y Agroindustria (UN Sede Manizales)Corporación de Investigaciones Biológicas

CONTEXTO NACIONAL

• Formación a nivel de Posgrado de talento humano en bioinformática

• Generar capacidad de análisis masivo de datos biológicos

• Articulación de la investigación en bioinformática

• Implementación de infraestructura Institucional para el almacenamiento y procesamiento de datos biológicos

• Diseño e implementación de herramientas bioinformáticas novedosas

JUSTIFICACIÓN

Programa propuesto

Maestría en BioinformáticaProfundización/Investigación

Objetivo general - Profundización.

El programa está dirigido a profesionales en ciencias de la vida, e ingeniería o matemáticas, con interés en profundizar en el conocimiento de las herramientas para aplicarlas en su campo de trabajo relacionando las ciencias computacionales con la resolución de problemas de interés biológico.

MAESTRÍA EN BIOINFORMÁTICA

Objetivo general - Investigación.

El programa está dirigido a profesionales en ciencias de la vida, ingeniería o matemáticas, con interés en desarrollar proyectos de investigación interdisciplinarios para resolver problemas de interés biológico usando y desarrollando conocimiento de las ciencias computacionales.

MAESTRÍA EN BIOINFORMÁTICA

PROFUNDIZACIÓN INVESTIGACIÓN

TIPO DE ASIGNATURA CRÉDITOS

Actividades Académicas

Trabajo FinalPropuesta de Trabajo FinalSeminarios de profundización

Asignaturas obligatoriasAsignaturas elegibles

1046

1220

Total 52

TIPO DE ASIGNATURA CRÉDITOS

Actividades Académicas

TesisProyecto de tesisSeminario de investigación

Asignaturas elegibles

2246

20

Total 52

PROPUESTA DE DISTRIBUCIÓN DE CRÉDITOS

Bioestadística Genética molecular bacteriana Genética molecular microbiana

Ética y bioética Sistemas inteligentes Métodos en biología molecular

Bioensayos Temas avanzados en sistemas de información Métodos estadísticos

Detección molecular de patógenos Teoría básica de probabilidad Métodos estadísticos genéticaEpidemiologia Biología molecular Minería de datos

Evolución Bioprocesos Temas avanzados en minería de datos I

Evolución del parasitismo y la virulencia Bioquímica Modelación numérica

Farmacología molecular Bioquímica de la acción hormonal Modelamiento matemáticoVida artificial Fisiologíacelular Modelos matemáticos

Genética molecular microbiana Fisiología y bioquímica de los microorganismos

Teoría de estadística no paramétrica

Inmunología Fitomejoramiento Teoría de la computaciónInteracciones moleculares planta-

microorganismo Genética Teoría de modelos

Química y biotecnología fúngica Genética cuantitativa Teoría de probabilidad

ASIGNATURAS OFRECIDAS PORLA UNIVERSIDAD NACIONAL

Líneas de investigación Asignaturas

Biología funcional y estructural

Bioinformática (O)

Métodos Estadísticos en Bioinformática (O)

Temas avanzados en Bioinformática Estructural (O)Métodos de determinación experimental de estructuras moleculares (E)

Biología de sistemas Modelamiento de Sistemas Biológicos (E)

Tecnologías computacionales en Bioinformática

Programación y algoritmos en Bioinformática (O)Bases de datos y sistemas de información en Bioinformática (E)

ASIGNATURAS PROPUESTAS

Recursos Computacionales:

• Salas de cómputo de la Facultad de Ingeniería• Salas de cómputo del Instituto de Biotecnología.• Clúster de la Facultad de Ingeniería• Clúster del Instituto de Biotecnología• Acceso a la malla computacional de Grid Colombia• Acceso a infraestructura computacional del European

Bioinformatics Institute (EBI)

Recursos Laboratorios de Experimentación en:

• Facultad de Ciencias• Instituto de Biotecnología• Facultad de Medicina• Instituto de Genética• Facultad de Agronomía

INFRAESTRUCTURA FÍSICA

Sede Bogotá Sede MedellÍn Métodos en Bioestadística Grupo de Automática de la Universidad Nacional - GAUNAL

Bioquímica INS y LIBBIQ UN Sede Caribe Grupo de investigación en proteinas - GRIP Modelación de ecosistemas costeros- Sede San Andres

Laboratorio de investigación en sistemas inteligentes LISI

Sede Manizales

Algoritmos y combinatoria ALGOS-UN Grupo de Procesamiento y Reconocimiento de Señales.

ALIFE: Grupo de investigación en vida artificial Alimentos-Frutales

MIDAS: Grupo de investigación en minería de datos Grupo Bioproductos

Grupo de neurociencias - Universidad Nacional Grupo de Ambientes Inteligentes Adaptativos

Inmunología evolutiva e inmunogenética Sede PalmiraBioinformática IBUN Caracterización de Recursos Zoogénicos con Fines de

Conservación y Utilización

Bioinformática Instituto de Genética Grupo de Investigación en Diversidad Biológica

Manihot Biotec Grupo de Investigación en Diversidad Biológica en Orquídeas y Ecología VegetalSistemática molecular y genética evolutiva

GRUPOS DE INVESTIGACIÓN

Profesor Facultad-Sede DepartamentoJosé Ernesto Mancera Pineda UN, Sede Caribe Biología

Liliana López Kleine Facultad de Ciencias EstadísticaEdgar Reyes Facultad de Ciencias Química

Luis Fernando Niño Facultad de Ingeniería Sistemas e Industrial

Jonatan Gómez Facultad de Ingeniería Sistemas e Industrial

Elizabeth León Facultad de Ingeniería Sistemas e Industrial

Humberto Arboleda Granados Instituto de Genética Instituto de GenéticaLuis Fernando Cadavid Instituto de Genética Instituto de GenéticaEmiliano Barreto Instituto de Biotecnología Insitituo de BiotecnologíaGabriela Delgado Facultad de Ciencias FarmaciaEsperanza Torres Facultad de Agronomía AgronomíaLuz Mary Salazar Pulido Facultad de Ciencias QuímicaMaría Teresa Reguero Instituto de Biotecnología Instituto de BiotecnologíaClara Bermúdez Facultad de Ciencias BiologíaMary Trujillo Facultad de Ciencias FarmaciaNorma Angélica Valencia Facultad de Ciencias Farmacia

DOCENTES