El Carbono
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El propósito de la bioquímica consiste en describir, explicar y alcanzar la comprensión integral en términos
moleculares, de todos los procesos químicos relacionados con las células vivas.
Determinar las estructuras de numerosas moléculas presentes
en las células
Analizar como funcionan en los procesos metabólicos
Entender porque algunas alteraciones bioquímicas originan
diversas patologías
BIOQUÍMICA
LA
S R
AIC
ES
DE L
A B
IOQ
UIM
ICA
Biología Celular - Bioquímica
Mitocondria
Cloroplastos
Procesos bioquímicos
Genética
Gen: Unidad de Información hereditaria
DNA: Portador de la Información genética
Tres disciplinas Inicio se consideraban muy distintas, han pasado a estar entrelazadas para dar lugar a una verdadera biología molecular:
Que es el objeto de la BIOQUIMICA ACTUAL
La química estructural
• de los componentes de la materia viva y la relación de la función biológica con la estructura química.
El metabolismo
• Que se refiere a la totalidad de las reacciones químicas que se producen en la materia viva.
La genética molecular
• Es la química de los procesos y las sustancias que almacenan y transmiten la información biológica (herencia y expresión de la información genética en términos moleculares.
AREAS EN QUE SE DIVIDE LA BIOQUIMICA
Bioquímica
Química
orgánica
Biofísica
Fisiología
Genética
Biología Celular
Nutrición
Microbiología
LA BIOQUIMICA COMO CIENCIA INTERDISCIPLINAR
COMPOSICION QUIMICA DEL UNIVERSO, LA CORTEZA TERRESTRE Y EL CUERPO HUMANO
H y He, abundante en el universo
O y el Si, en la corteza terrestre
H, C, N y O, en el cuerpo
Compuestos químicos
Los compuestos orgánicos suelen ser moléculas muy complejas y en su composición siempre se encuentra el elemento carbono. Las moléculas de los compuestos orgánicos son tan grandes que pueden llegar a estar formadas por miles de átomos.
Los compuestos inorgánicos suelen ser moléculas sencillas y son característicos de la materia mineral. Algunos ejemplos de compuestos inorgánicos son los silicatos, carbonatos, ácidos y el sílice.
Primera Síntesis orgánica: Friedrich Wölher (1828)
calor
NH4OCN
NH2CONH2
(cianato de amonio) (urea)
EL CARBONO Y LA QUÍMICA ORGANICA
La Química de los “Compuestos del
Carbono”.
También tienen hidrógeno.
Se exceptúan CO, CO2, carbonatos, bicarbonatos,
cianuros...
Pueden tener otros elementos: O, N, S, P,
halógenos...
QUÍMICA ORGÁNICA EN LA ACTUALIDAD
Se conocen más de siete millones de compuestos de carbono y cada año se descubren miles de nuevos compuestos. Junto con esta cantidad, destaca su variedadMás del 95% de las sustancias químicas
conocidas son compuestos del
carbono y más de la mitad de los
químicos actuales en el mundo se
denominan a sí mismos químicos
orgánicos.
Todos los compuestos
responsables de la vida (ácidos
nucleicos, proteínas, enzimas, hormonas, azúcares, lípidos,
vitaminas, etc.) son sustancias orgánicas.
Proteínas.
Polisacáridos.
Almidón,
Celulosa.
Ácidos nucleic
os
Seda
Caucho
(latex)
Moléculas orgánicas. Naturales
Plásticos Polietileno, PVC,
Baquelita, Poliuretano, Poliesteres….
Fibras textiles sintéticas: Nylon,
tergal
Elastomeros : (neopreno
Moléculas orgánicas: Artificiales .
Propiedades Orgánicos Inorgánicos
Fuentes Pueden extraerse de materias primas que se encuentran en la naturaleza, de origen animal o vegetal, o por síntesis orgánica.
Se encuentran libres en la naturaleza en forma de sales, óxidos.
Elementos Básicos: C, HOcasionales: O, N, S, y halógenosTrazas: Fe, Co, P, Ca Zn
Todos los elementos de la tabla periódica (104)
Enlace predominante
Covalente Iónico, algunas veces covalente
Estado Físico Gases, líquidos o sólidos Son generalmente sólidos
Reacciones Lentas y rara vez cuantitativas Instantáneas y cuantitativas
Volatilidad Volátiles No volátiles
Puntos de fusión Bajos: 300º C Altos: 700º C
Solubilidad en agua
No solubles Solubles
Solubilidad en solventes orgánicos
Solubles No solubles
El carbono es un
elemento no metálico
que se presenta en formas muy variadas. Es
el cuarto elemento
más abundante
en el Universo
después del H2, He Y O2
La Molécula del Carbono
EL CARBONO EN LA NATURALEZA
Es el cuarto elemento más abundante en el Universo después del H2, He Y O2.
Es un elemento que existe bajo dos formas: una
orgánica (presente en los organismo vivos y muertos y en los descompuestos) y otra inorgánica (presentes en las
rocas)
Por tanto, en la naturaleza, el carbono se puede
encontrarse:Combinado: Formando gran
cantidad de compuestos.Libre: Sin enlazarse a otros
elementos.
En la atmósfera: en forma de dióxido de carbono CO2
En la corteza terrestre: formando
carbonatos, como la
caliza CaCO3
En el interior de la corteza
terrestre: en el petróleo,
carbón y gas natural
Es el componente esencial de la materia viva, tanto animal
como vegetal y forma parte de: glúcidos,
lípidos, proteínas y
ácidos nucleicos.
El Carbono Combinado
El Carbono Libre
Diamante
• Variedad de carbono que se encuentra en forma de cristales transparentes de gran dureza. • es el más duro que se conoce; cada átomo está unido a otros cuatro en una estructura
tridimensional. • Los átomos constituyen una red tridimensional que se extiende a lo largo de todo un
cristal, lo cual le hace poseer la mayor dureza de toda la naturaleza. Además• es incoloro, no conductor de la electricidad, pesado, frágil, exfoliable e insoluble..
el carbono grafito
• está formado por capas de carbono compuestas por anillos hexagonales de átomos, capaces de deslizarse una sobre la otra, por lo que puede usarse como lubricante.
• Tiene un color negro o gris oscuro, un brillo poco intenso, es graso al tacto y buen conductor de calor y electricidad.
• Se usa en la fabricación de electrodos, crisoles refractarios, minas de lápices y productos lubricantes
Carbón amorfo
• El carbón vegetal, el coque, el carbón animal, el carbón de azúcar, el hollín y el negro de humo
Fullerenos
• están formados por moléculas esféricas de C60.• Descubiertas en 1985, un compuesto soluble en agua preparado a partir de las esferas bucky tiene actividad antiviral y ha demostrado
tener actividad in-vitro contra VIH. Sin embargo, las esferas bucky aún son muy costosas; su precio era de 945 dólares por gramo en
Los nanotubos.
• Son cilindros formados por capas grafitoides de carbono, cerradas por hemisferios de carbono de fullereno. • Esos tubos sólo tienen nanómetros de diámetro, pero pueden tener cientos de micras de longitud. • Son muy resistentes, 100 veces más que el acero, con sólo la sexta parte de la masa. • Dependiendo de su geometría, pueden comportarse como metales, semiconductores o aisladores, y se espera encontrarles aplicaciones prácticas
• Esta electronegatividad permite al átomo de carbono combinarse con facilidad con elementos muy diferentes de la tabla periódica.
La electronegatividad (2,5)
• debida a la promoción electrónica, obteniéndose 4 electrones desapareados en la última capa
• La tendencia del átomo de carbono para formar enlaces covalentes con otros átomos de carbono en largas cadenas y ciclos
La tetra valencia
• Hace que los electrones de valencia estén fuertemente atraídos por el núcleo, por lo que es posible que los átomos se aproximen lo suficiente para formar enlaces “”, formando enlaces dobles y triples (concatenación )
El reducido volumen
• Es una característica que se da en los átomos de carbono.
• La quiralidad es la propiedad de un objeto de no ser superponible con su imagen especular
La quiralidad
CARACTERÍSTICAS DEL CARBONO
El gran número y la diversidad de los compuestos orgánicos son una consecuencia de las características especiales que muestra el átomo de carbono
EL ÁTOMO DE CARBONO
Grupo 14
Periodo 2
Número atómico: Z=6 Número de masa A=12
Configuración electrónica
4 e- en su nivel externo
Carbono tetravalente Cuatro enlaces covalentes
C-C
C-otro elemento
CONFIGURACIÓN ELECTRÓNICA
La hibridación consiste en una mezcla de orbítales puros en un estado excitado para formar orbítales híbridos equivalentes con orientaciones determinadas en el espacio
HIBRIDACIÓN
HIBRIDACIÓN TRIGONAL SP2
La Superposición de orbitales híbridos pueden forman dos tipos de enlaces dependiendo de la geometría en la superposiciónEnlace son formados por superposición directaEnlace son formados por superposición paralela
HIBRIDACIÓN spEn este tipo de hibridación, se mezclan el orbital 2s con el orbital 2px, quedando los orbitales 2py y 2pz puros sin hibridizarLa molécula tiene geometría lineal y el ángulo H - C - C es de 180º.Es característica de los alquinos (enlace triple),
PROPIEDADES DE LOS COMPUESTOS DE CARBONO
Los compuestos del carbono forman moléculas cuyos átomos están unidos por fuertes enlaces
covalentesInsolubles en agua y solubles en disolventes
orgánicos
Temperaturas de fusión y ebullición bajas
No conducen la corriente eléctrica ni en estado líquido ni en disolución
Poseen poca estabilidad térmica, es decir, se descomponen o se inflaman fácilmente cuando se
calientan(termolabiles menores de 300 ºc)
Suelen reaccionar lentamente debido a la gran estabilidad de los enlaces covalentes que unen sus
átomos
SencillosSencillos
DoblesDobles
TriplesTriples
CH3 – CH3
CH2 = CH2
CH CH
1 sigma
1 sigma1 pi
1 sigma2 pi
Com
pu
est
os
org
án
icos
Hidrocarburos
Hidrocarburos conjugados
son los derivados del carbono más sencillos.
LOS HIDROCARBUROS
Resultan únicamente de la unión de átomos de carbono con átomos de hidrógeno y de átomos de carbono entre sí formando cadenas que pueden ser abiertas o cerradas y cuyos “eslabones” pueden estar unidos por enlaces simples o por enlaces múltiples.
Características de los hidrocarburos
Están constituidos únicamente por átomos de
carbono o hidrógeno.
Sus fuentes naturales principales son: el petróleo, gas natural y carbón mineral (hulla).
En condiciones normales de ambiente se encuentran en
los siguientes estados físicos
Por combustión completa forman dióxido de carbono y agua, y; por
combustión incompleta, monóxido de carbono y agua
ALCANOS
Los alcanos, hidrocarburos saturados o parafinas
Son formados exclusivamente por
carbono e hidrógeno, donde todos los
enlaces son covalentes sencillos (C – C y C – H)
El carbono se enlaza mediante orbitales
híbridos sp3 formando 4 enlaces simples en
disposición tetraédrica
Su fórmula molecular es CnH2n+2:
PROPIEDADES FÍSICAS
Las temperaturas de fusión y ebullición aumentan con el número de carbonos y son mayores para los compuestos lineales pues pueden compactarse mas aumentando las fuerzas intermoleculares.
Son menos densos que el agua y solubles en disolventes apolares.
desde (CH4 al C4H10) son gases, del pentano (C5H12) al hexadecano (C16H34) son líquidos; desde el C16H34 (n-hexadecano)en adelante, son sólidos. Los
PROPIEDADES QUÍMICA
Son bastantes inertes debido a la elevada estabilidad de los enlaces C-C y C-H y a su baja polaridad.
No se ven afectados por ácidos o bases fuertes ni por oxidantes como el permanganato.
La combustión es muy exotérmica aunque tiene una elevada energía de activación.
PROPIEDADES DE LOS ALCANOS
CLASIFICACIÓN DE LOS ALCANOS
Lineales
Son hidrocarburos cuya estructura molecular
siguen la secuencia lineal o sea no poseen ramificaciones.
Ramificados
Son hidrocarburos cuya estructura molecular posee ramificaciones
NOMENCLATURA DE LOS ALCANOS LINEALES
Se nombran mediante el prefijo numeral que indica el número de átomos de carbono que forman la cadena carbonada, seguido de la terminación –ano.
RAICES IUPAC
Ejemplo: Para el hidrocarburo: CH3 – CH2 – CH2 – CH3
Como tiene 4 carbonos, la raíz IUPAC será BUT y como el sufijo es ANO por ser alcano;
entonces, el nombre correcto será: Butano
NOMENCLATURA DE LOS ALCANOS RAMIFICADOS
Para nombrar a este tipo de hidrocarburos se deberá tener en cuentala siguiente estructura::
La cadena principal
Es la que da el nombre al compuesto
También se tendrá en cuenta las siguientes indicaciones
Cuando se repite un mismo radical, se hará uso de los prefijos: di,
tri, tetra, penta, etc.; según la cantidad de veces que se repite
el radical.
Cuando en la cadena principal existen
radicales diferentes, éstos se nombrarán
según el siguiente orden por tamaño ascendente:Metil, Etil, Propil, etc,
Cuando exista dos o más cadenas largas
con el mismo número de carbonos, se
deberá escoger la cadena que posea
más radicales
Como se puede observar, se prefiere la cadena 1, 2, 3 , 4, 5, 6 y 7 antes que a, b, 3, 4, 5 , 6y 7 porque la primera posee mas radicales
Elección de la cadena principal
• La cadena principal es la más larga, la de mayor número de átomos de carbono.
• A igualdad de átomos de carbono, la cadena principal es la que contiene mayor número de ramificaciones o radicales
Numeración de la cadena principal
• La cadena principal se numera empezando por el extremo más próximo a las ramificaciones, es decir, se numera de tal forma que los radicales o ramificaciones se le asigne el menor número o localizador de cadena
Consideraciones
Radicales alquílicos
• : son un grupo de átomos que procede de la perdida de un hidrógeno de un alcano. Se representan de forma genérica por –R.
Radical alquilo lineal
Se nombran igual que el alcano del que preceden,
Se cambia la terminación –ano
por –ilo (si se nombra sólo el
radical) o por –il (si el radical se nombra en un compuesto).
Radical alquilo ramificado
Se numera la cadena principal
empezando por el carbono de
valencia libre.
El nombre del radical se forma
indicando primero las ramificaciones
por orden alfabético, con su nombre y el
localizador de cadena, y
terminando el nombre con el de la
cadena principal terminada en -ilo.
Radical alquilo lineal Radical alquilo ramificado
Ejemplo:CH3 – CH2 – CH2 - Propil ó Propilo
CH3 – CH2 – CH3 = CH3 – CH – CH3 + - H
1 2 Radical alquilo
ramificado
1 - Metil - Etil ó 1 – Metil – EtiloEl radical principal es el Etil (cadena principal) el cual tiene un subradical, el Metil.
La cadena principal tiene 8 carbonos: (Octil.) Y, como tiene 2 subradicales: 1 - metil- 3 -etil. El nombre completo del radical complejo será: 1 - Metil- 3 – Etil - Octil
Radicales ramificados con nombres comunesIUPAC también acepta nombres comunes a muchos radicales ramificados quetienen grupos de átomos característicos
Son alcanos cuya estructura molecular está formada por una cadena principal y varios radicales entre ellos radicales ramificados.
Nomenclatura Alcanos de estructura compleja
3, 4, 7, 9 – Tetrametil – 6 (1´, 1´, 2´, 2´ - Tetrametil propil) - undecano
1. Oxidación de alcanos: Combustión.
REACCIÓN DE ALCANOS
La combustión de los alcanos es una de las reacciones orgánicas más Importantes.
La ecuación para la combustión de un alcano, por ejemplo el metano, es
la siguiente:
CH4 + 2 O2 ---- CO2 + 2 H2O
2. Reacciones de Cracking o PirólisisEstas son reacciones que se realizan a altas presiones y altas
temperaturas. Consisten en romper grandes moléculas para convertirlas en moléculas pequeñas
Se produce altas temperaturas en ausencia de Oxígeno. Se rompen
enlaces C-C y C-H, formando radicales, que se combinan entre sí formando otros alcanos de mayor
número de C.
2C13H28 = CH4 + C4H8 + C7H16 + C12H26 + H2 + 2C
3. Reacciones de Halogenación por Sustitución
Los alcanos reaccionan con halógenos mediante mecanismos radicalarios. Dicha reacción supone la sustitución de uno o
varios hidrógenos del alcano por halógenos Los halógenos (Cl, Br y I)
sustituyen a los hidrógenos del alcano formando unos compuestos llamados
halogenuros, bajo la acción de un catalizador ó de la luz.
Se debe tener en cuenta el orden de reactividad:
Del hidrógeno: Terciario > Secundario > Primario
De los halógenos: F > Cl > Br >
El metano reacciona con cloro a 250°C, si se mantiene esta temperatura en el reactor, progresivamente se generan nuevos productos.
4. NITRACIÓN
Los alcanos logran nitrarse, al reaccionar con acido nítrico concentrado, sustituyendo hidrogeno por el grupo Nitro (-NO2).
Esta reacción a presión atmosférica, en fase vapor o temperaturas entre 420 a 475°C y en presencia de ácido sulfúrico